Protein–RNA interactions for Protein: P28067

HLA-DMA, HLA class II histocompatibility antigen, DM alpha chain, humanhuman

Predictions only

Length 261 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HLA-DMAP28067 SRD5A2-201ENST00000622030 4648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
HLA-DMAP28067 SYBU-219ENST00000528647 2995 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.22□□□□□ -0.13
HLA-DMAP28067 DNAJB1-201ENST00000254322 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
HLA-DMAP28067 AKT1S1-205ENST00000391833 3640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.22□□□□□ -0.13
HLA-DMAP28067 TFAP2A-201ENST00000319516 2035 ntTSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
HLA-DMAP28067 USP4-201ENST00000265560 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
HLA-DMAP28067 ACP2-201ENST00000256997 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
HLA-DMAP28067 RFXANK-205ENST00000456252 1325 ntTSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
HLA-DMAP28067 USP43-202ENST00000570475 3500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
HLA-DMAP28067 ELF2-207ENST00000510408 1965 ntTSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
HLA-DMAP28067 TMED5-202ENST00000370282 6104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
HLA-DMAP28067 DNM1-201ENST00000341179 3254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
HLA-DMAP28067 TCP11L1-201ENST00000334274 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
HLA-DMAP28067 SEMA5B-201ENST00000195173 4523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
HLA-DMAP28067 C1QC-201ENST00000374637 1089 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.22□□□□□ -0.13
HLA-DMAP28067 CMTM2-202ENST00000379486 904 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
HLA-DMAP28067 CXorf40A-202ENST00000393985 1148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
HLA-DMAP28067 UBE2J2-204ENST00000400929 1057 ntTSL 3 BASIC14.22□□□□□ -0.13
HLA-DMAP28067 C2orf82-202ENST00000409230 663 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC14.22□□□□□ -0.13
HLA-DMAP28067 MYL6-203ENST00000536128 1221 ntTSL 2 BASIC14.22□□□□□ -0.13
HLA-DMAP28067 TUBA1A-203ENST00000546918 984 ntTSL 3 BASIC14.22□□□□□ -0.13
HLA-DMAP28067 AC010203.1-204ENST00000548782 407 ntBASIC14.22□□□□□ -0.13
HLA-DMAP28067 ATP6V0C-202ENST00000564973 1081 ntTSL 2 BASIC14.22□□□□□ -0.13
HLA-DMAP28067 P4HB-223ENST00000576390 439 ntTSL 4 BASIC14.22□□□□□ -0.13
HLA-DMAP28067 ELAC2-212ENST00000578071 579 ntTSL 4 BASIC14.22□□□□□ -0.13
HLA-DMAP28067 UQCR11-201ENST00000585671 753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
HLA-DMAP28067 AC139887.4-201ENST00000607877 719 ntBASIC14.22□□□□□ -0.13
HLA-DMAP28067 AC124864.1-201ENST00000623408 392 ntBASIC14.22□□□□□ -0.13
HLA-DMAP28067 AP006294.2-201ENST00000641667 209 ntBASIC14.22□□□□□ -0.13
HLA-DMAP28067 DDX56-201ENST00000258772 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
HLA-DMAP28067 CCDC188-201ENST00000439765 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
HLA-DMAP28067 NFIX-210ENST00000588228 1692 ntTSL 2 BASIC14.22□□□□□ -0.13
HLA-DMAP28067 ARC-201ENST00000356613 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
HLA-DMAP28067 CHDH-201ENST00000315251 7665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
HLA-DMAP28067 GOLGA7B-201ENST00000370602 6447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
HLA-DMAP28067 AC041040.2-201ENST00000622926 2899 ntBASIC14.22□□□□□ -0.13
HLA-DMAP28067 HNRNPA0-201ENST00000314940 8726 ntAPPRIS P1 BASIC14.22□□□□□ -0.13
HLA-DMAP28067 TRIM29-210ENST00000528870 2217 ntTSL 2 BASIC14.22□□□□□ -0.13
HLA-DMAP28067 CORO6-201ENST00000345068 2603 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
HLA-DMAP28067 TOMM40L-201ENST00000367987 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
HLA-DMAP28067 SAFB-205ENST00000588852 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
HLA-DMAP28067 REEP3-201ENST00000373758 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
HLA-DMAP28067 CAMK1D-204ENST00000619168 8153 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
HLA-DMAP28067 UBTF-201ENST00000302904 4997 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.22□□□□□ -0.13
HLA-DMAP28067 AC023024.1-201ENST00000558838 2590 ntTSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
HLA-DMAP28067 PAK2-201ENST00000327134 6139 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.22□□□□□ -0.13
HLA-DMAP28067 DUSP18-206ENST00000407308 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
HLA-DMAP28067 TOPAZ1-201ENST00000309765 5334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
HLA-DMAP28067 TBC1D3P5-202ENST00000581469 2513 ntTSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
HLA-DMAP28067 CRB2-201ENST00000359999 3659 ntTSL 2 BASIC14.21□□□□□ -0.13
HLA-DMAP28067 NBEA-203ENST00000379939 10738 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.13
HLA-DMAP28067 PACSIN2-201ENST00000263246 3249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
HLA-DMAP28067 SFI1-209ENST00000443011 3579 ntTSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.13
HLA-DMAP28067 TXNDC2-201ENST00000306084 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
HLA-DMAP28067 GLS2-201ENST00000311966 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
HLA-DMAP28067 MINK1-201ENST00000347992 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
HLA-DMAP28067 CMKLR1-206ENST00000552995 1890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
HLA-DMAP28067 GLMP-214ENST00000614643 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.21□□□□□ -0.13
HLA-DMAP28067 TVP23C-210ENST00000584811 2989 ntTSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
HLA-DMAP28067 LAPTM5-201ENST00000294507 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
HLA-DMAP28067 ST3GAL3-208ENST00000361392 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
HLA-DMAP28067 SLC35A3-221ENST00000640600 3341 ntTSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.13
HLA-DMAP28067 WDR88-202ENST00000361680 1835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
HLA-DMAP28067 AL353803.2-201ENST00000436510 1846 ntTSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.13
HLA-DMAP28067 MEIS3-206ENST00000559524 1828 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.21□□□□□ -0.13
HLA-DMAP28067 NUP62-212ENST00000597723 1824 ntTSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
HLA-DMAP28067 POMZP3-201ENST00000275569 1259 ntTSL 2 BASIC14.21□□□□□ -0.13
HLA-DMAP28067 OR10H2-201ENST00000305899 1041 ntAPPRIS P1 BASIC14.21□□□□□ -0.13
HLA-DMAP28067 CD7-201ENST00000312648 1281 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
HLA-DMAP28067 BEX1-201ENST00000372728 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
HLA-DMAP28067 RPL8-202ENST00000394920 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
HLA-DMAP28067 MOBP-204ENST00000420739 940 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.13
HLA-DMAP28067 DGUOK-AS1-203ENST00000453103 601 ntTSL 3 BASIC14.21□□□□□ -0.13
HLA-DMAP28067 AC097372.2-201ENST00000510996 732 ntTSL 3 BASIC14.21□□□□□ -0.13
HLA-DMAP28067 ABHD14B-208ENST00000525795 980 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.21□□□□□ -0.13
HLA-DMAP28067 RDH5-202ENST00000547072 1054 ntTSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.13
HLA-DMAP28067 AC073592.5-201ENST00000624854 528 ntBASIC14.21□□□□□ -0.13
HLA-DMAP28067 AL139011.1-202ENST00000642063 584 ntBASIC14.21□□□□□ -0.13
HLA-DMAP28067 MOCS1-201ENST00000340692 2747 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.13
HLA-DMAP28067 TRIP10-201ENST00000313244 2153 ntTSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
HLA-DMAP28067 CCAR2-201ENST00000308511 4853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
HLA-DMAP28067 TGIF2-202ENST00000373874 3432 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.21□□□□□ -0.13
HLA-DMAP28067 CRB3-203ENST00000598494 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.21□□□□□ -0.13
HLA-DMAP28067 SARM1-208ENST00000585482 10309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
HLA-DMAP28067 WASH2P-202ENST00000538033 2800 ntTSL 2 BASIC14.21□□□□□ -0.14
HLA-DMAP28067 BNIP2-201ENST00000267859 6325 ntTSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
HLA-DMAP28067 TFAP2A-AS1-201ENST00000420777 1575 ntTSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.14
HLA-DMAP28067 ALDH3A1-212ENST00000494157 1572 ntTSL 3 BASIC14.21□□□□□ -0.14
HLA-DMAP28067 AC013726.1-201ENST00000563747 2285 ntBASIC14.21□□□□□ -0.14
HLA-DMAP28067 PDGFB-201ENST00000331163 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
HLA-DMAP28067 SEPT8-208ENST00000378721 1723 ntTSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.14
HLA-DMAP28067 RNF113B-201ENST00000267291 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
HLA-DMAP28067 PDE8B-202ENST00000333194 2572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
HLA-DMAP28067 CDH24-202ENST00000397359 3552 ntTSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.14
HLA-DMAP28067 GPD1L-201ENST00000282541 4060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
HLA-DMAP28067 PTHLH-202ENST00000395868 1674 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
HLA-DMAP28067 CCT7-216ENST00000540468 1674 ntTSL 2 BASIC14.2□□□□□ -0.14
HLA-DMAP28067 ST3GAL3-209ENST00000361400 2195 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
HLA-DMAP28067 SNX14-202ENST00000346348 3348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
HLA-DMAP28067 RPS6KL1-210ENST00000555647 3309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.8 ms