Protein–RNA interactions for Protein: P26842

CD27, CD27 antigen, humanhuman

Predictions only

Length 260 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD27P26842 MIR8072-201ENST00000614241 80 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
CD27P26842 AL033527.5-201ENST00000641382 801 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
CD27P26842 NDUFS2-202ENST00000392179 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CD27P26842 AL645608.8-201ENST00000606034 2086 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
CD27P26842 MOCS1-206ENST00000425303 1920 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CD27P26842 MCM9-201ENST00000316068 2442 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CD27P26842 TES-201ENST00000358204 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CD27P26842 AL591845.1-201ENST00000373137 1838 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CD27P26842 AMMECR1-201ENST00000262844 5504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CD27P26842 DMAC2-201ENST00000221943 1692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CD27P26842 PIK3R2-201ENST00000222254 4033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CD27P26842 MBD1-207ENST00000398488 1512 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CD27P26842 DNM1-202ENST00000372923 3244 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CD27P26842 HLA-A-202ENST00000376806 1854 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
CD27P26842 ARMC6-203ENST00000392336 1866 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CD27P26842 DIABLO-204ENST00000413918 1859 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CD27P26842 NRP1-204ENST00000374822 2213 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CD27P26842 ING4-202ENST00000396807 1393 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CD27P26842 GLMP-213ENST00000612353 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CD27P26842 GLMP-215ENST00000622703 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CD27P26842 TPST2-201ENST00000338754 5697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CD27P26842 FOXL2-201ENST00000330315 2917 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CD27P26842 PKLR-201ENST00000342741 2083 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CD27P26842 NOTCH3-201ENST00000263388 8666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CD27P26842 PEPD-202ENST00000397032 1754 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CD27P26842 RNPS1-223ENST00000568631 1792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CD27P26842 PPEF2-207ENST00000621010 1797 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CD27P26842 ADAMTS4-201ENST00000367995 1961 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CD27P26842 HR-202ENST00000381418 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CD27P26842 PODNL1-202ENST00000339560 2165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CD27P26842 BRPF1-203ENST00000424362 4712 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CD27P26842 AGTRAP-202ENST00000376627 1055 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CD27P26842 MIR658-201ENST00000385210 100 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
CD27P26842 RPS2P32-201ENST00000439199 892 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
CD27P26842 ELP6-209ENST00000446787 894 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CD27P26842 AC245100.5-201ENST00000452108 331 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
CD27P26842 LCN10-203ENST00000474369 564 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CD27P26842 AJ271736.1-201ENST00000483543 773 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CD27P26842 AC021054.1-202ENST00000543884 599 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CD27P26842 NDUFA4L2-206ENST00000556732 883 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CD27P26842 AC243562.2-201ENST00000561247 970 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
CD27P26842 CD300LG-205ENST00000586233 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CD27P26842 YIF1B-214ENST00000591784 940 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CD27P26842 PIH1D1-209ENST00000596049 992 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CD27P26842 HIST1H2BO-201ENST00000616182 381 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CD27P26842 SLC18B1-201ENST00000275227 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CD27P26842 FCHO1-201ENST00000252771 3118 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CD27P26842 JMJD4-201ENST00000366758 2595 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CD27P26842 PIGT-207ENST00000543458 2037 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CD27P26842 CLK3P2-201ENST00000427566 1453 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
CD27P26842 COL4A2-201ENST00000360467 6281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CD27P26842 PTHLH-209ENST00000545234 1544 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CD27P26842 GLDN-201ENST00000335449 4971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CD27P26842 IKZF4-206ENST00000547791 1712 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CD27P26842 HTR3E-201ENST00000335304 1912 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CD27P26842 SGPP2-201ENST00000321276 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CD27P26842 TRIM50-202ENST00000453152 1599 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CD27P26842 HARS2-206ENST00000508522 1562 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CD27P26842 TUBB3-201ENST00000315491 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CD27P26842 LFNG-207ENST00000614382 1969 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CD27P26842 NAA50-201ENST00000240922 6135 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CD27P26842 SLC41A3-203ENST00000360370 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CD27P26842 AP001094.4-201ENST00000579008 2176 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
CD27P26842 LETM1P2-201ENST00000597330 2178 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
CD27P26842 CACNA1A-225ENST00000636389 8137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CD27P26842 APMAP-201ENST00000217456 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CD27P26842 GPS1-226ENST00000623691 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CD27P26842 KLHL31-201ENST00000370905 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CD27P26842 TNIP1-211ENST00000521591 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CD27P26842 SMG5-201ENST00000361813 4559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CD27P26842 SCP2-213ENST00000528311 1896 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CD27P26842 B3GNT9-201ENST00000449549 2917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CD27P26842 LRFN3-201ENST00000246529 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CD27P26842 TTLL8-201ENST00000266182 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CD27P26842 ATP4B-201ENST00000335288 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CD27P26842 CCDC144A-210ENST00000456009 2306 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CD27P26842 ZNF512B-201ENST00000369888 5919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CD27P26842 LINC01121-201ENST00000378479 1095 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CD27P26842 TAGLN-202ENST00000392951 928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CD27P26842 AL645941.1-201ENST00000415875 338 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CD27P26842 AC105940.2-201ENST00000421055 380 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CD27P26842 AC022210.1-201ENST00000449856 793 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
CD27P26842 RHOXF1P1-201ENST00000454625 772 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CD27P26842 AC092552.1-201ENST00000547243 906 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
CD27P26842 RNASEK-C17orf49-201ENST00000547302 900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CD27P26842 AC079336.2-201ENST00000578408 927 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CD27P26842 RAMP2-202ENST00000587142 549 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CD27P26842 RAMP2-203ENST00000588576 573 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CD27P26842 LRRN4CL-201ENST00000317449 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CD27P26842 RAB4B-EGLN2-201ENST00000594136 2554 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CD27P26842 KDSR-202ENST00000406396 5447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CD27P26842 PLCB2-201ENST00000260402 4616 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CD27P26842 SAMD4A-208ENST00000555192 1337 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CD27P26842 CCNJL-203ENST00000393977 3320 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CD27P26842 NOL4L-205ENST00000375678 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CD27P26842 TJP3-205ENST00000587686 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CD27P26842 JAKMIP1-202ENST00000409021 2975 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CD27P26842 SYDE2-202ENST00000341460 5512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CD27P26842 STRADA-254ENST00000640999 2336 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CD27P26842 LENG8-202ENST00000376514 5146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.4 ms