Protein–RNA interactions for Protein: P26358

DNMT1, DNA (cytosine-5)-methyltransferase 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,616 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DNMT1P26358 TOM1-210ENST00000449058 2389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
DNMT1P26358 AL355987.1-201ENST00000435202 2420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
DNMT1P26358 DHCR7-201ENST00000355527 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
DNMT1P26358 NAGK-208ENST00000455662 1778 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
DNMT1P26358 TBXAS1-204ENST00000416849 2505 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
DNMT1P26358 NSL1-201ENST00000366976 722 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
DNMT1P26358 OR5C1-201ENST00000373680 963 ntAPPRIS P1 BASIC24.02■■□□□ 1.44
DNMT1P26358 AC011497.1-201ENST00000596781 561 ntTSL 4 BASIC24.02■■□□□ 1.44
DNMT1P26358 IFI27-206ENST00000612813 725 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
DNMT1P26358 WNT11-204ENST00000621122 789 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
DNMT1P26358 DEK-201ENST00000244776 1441 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
DNMT1P26358 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
DNMT1P26358 EPHX2-202ENST00000517536 1600 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
DNMT1P26358 KPNA2-202ENST00000537025 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
DNMT1P26358 CNGA3-205ENST00000436404 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
DNMT1P26358 C9orf78-201ENST00000372447 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
DNMT1P26358 OSGIN1-203ENST00000393306 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
DNMT1P26358 AKT1S1-207ENST00000391835 3075 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
DNMT1P26358 SOX14-201ENST00000306087 2055 ntAPPRIS P1 BASIC24.02■■□□□ 1.44
DNMT1P26358 ANTXRL-205ENST00000620264 2206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
DNMT1P26358 PES1-202ENST00000354694 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
DNMT1P26358 C12orf66-204ENST00000544871 2441 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
DNMT1P26358 TMEM91-202ENST00000356385 944 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
DNMT1P26358 PPDPF-201ENST00000370177 627 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
DNMT1P26358 RABL2A-203ENST00000393166 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
DNMT1P26358 AC016683.1-202ENST00000438409 583 ntTSL 4 BASIC24.02■■□□□ 1.44
DNMT1P26358 C8orf88-201ENST00000517562 894 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
DNMT1P26358 OMP-201ENST00000529803 492 ntAPPRIS P1 BASIC24.02■■□□□ 1.44
DNMT1P26358 AC006064.3-201ENST00000537921 477 ntTSL 4 BASIC24.02■■□□□ 1.44
DNMT1P26358 AC138028.3-201ENST00000561699 213 ntTSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
DNMT1P26358 AC124287.1-201ENST00000582249 838 ntTSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
DNMT1P26358 C19orf70-204ENST00000587950 655 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
DNMT1P26358 KXD1-204ENST00000595073 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
DNMT1P26358 AC243829.4-204ENST00000616926 1115 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
DNMT1P26358 NOP16-209ENST00000618911 1087 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
DNMT1P26358 SOCS3-201ENST00000330871 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
DNMT1P26358 EWSAT1-206ENST00000558922 1725 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.43
DNMT1P26358 DRC3-201ENST00000313838 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
DNMT1P26358 CYP46A1-201ENST00000261835 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
DNMT1P26358 AL365277.1-202ENST00000331856 2241 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
DNMT1P26358 EML3-201ENST00000278845 3017 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
DNMT1P26358 PARD3-205ENST00000374773 3420 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
DNMT1P26358 DLX4-201ENST00000240306 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
DNMT1P26358 ISCA1-201ENST00000311534 813 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
DNMT1P26358 YARS2-201ENST00000324868 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
DNMT1P26358 TMEM183A-201ENST00000367242 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
DNMT1P26358 CIART-203ENST00000369095 1433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
DNMT1P26358 MPP1-205ENST00000413259 2195 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
DNMT1P26358 PACS2-202ENST00000430725 2944 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
DNMT1P26358 AC114730.3-201ENST00000435195 584 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
DNMT1P26358 GUSBP2-202ENST00000479900 1203 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
DNMT1P26358 AC106772.2-201ENST00000515085 442 ntTSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
DNMT1P26358 DMTN-209ENST00000517600 1569 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
DNMT1P26358 LY6K-205ENST00000522591 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
DNMT1P26358 AC008750.2-202ENST00000532688 729 ntTSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
DNMT1P26358 NDUFA4L2-206ENST00000556732 883 ntTSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
DNMT1P26358 IGHV3OR16-13-201ENST00000562905 353 ntAPPRIS P1 BASIC24.01■■□□□ 1.43
DNMT1P26358 NOP53-AS1-201ENST00000602048 540 ntTSL 4 BASIC24.01■■□□□ 1.43
DNMT1P26358 INTS4P2-202ENST00000614726 2019 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
DNMT1P26358 HIST1H2BO-201ENST00000616182 381 ntAPPRIS P1 BASIC24.01■■□□□ 1.43
DNMT1P26358 LINC01759-203ENST00000635271 888 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
DNMT1P26358 C11orf53-203ENST00000637637 1049 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
DNMT1P26358 TMTC4-203ENST00000376234 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
DNMT1P26358 B3GALNT1-202ENST00000392779 3221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
DNMT1P26358 IFFO1-211ENST00000615885 2775 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
DNMT1P26358 TAF1B-201ENST00000263663 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
DNMT1P26358 SAMD3-202ENST00000368134 2377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
DNMT1P26358 BAIAP2-219ENST00000575245 2229 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
DNMT1P26358 FP565260.3-204ENST00000623795 2238 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
DNMT1P26358 ZNF619-205ENST00000456778 2192 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
DNMT1P26358 MFSD4A-207ENST00000536357 1841 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
DNMT1P26358 DNM2-201ENST00000355667 3541 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
DNMT1P26358 G6PD-203ENST00000393564 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
DNMT1P26358 AMT-233ENST00000636522 1620 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
DNMT1P26358 TMEM222-210ENST00000608611 1511 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
DNMT1P26358 RHBDF1-201ENST00000262316 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
DNMT1P26358 RPL18A-201ENST00000222247 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
DNMT1P26358 TRMT112-201ENST00000308774 561 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
DNMT1P26358 PNOC-204ENST00000522209 1007 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
DNMT1P26358 AL049840.4-201ENST00000602422 811 ntBASIC24■■□□□ 1.43
DNMT1P26358 AP001372.2-201ENST00000526036 2493 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
DNMT1P26358 CMTM3-202ENST00000424011 2330 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
DNMT1P26358 VHL-202ENST00000345392 2696 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
DNMT1P26358 EIF4E1B-203ENST00000504597 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
DNMT1P26358 SPAAR-202ENST00000443779 1612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
DNMT1P26358 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
DNMT1P26358 SGSH-203ENST00000570923 1546 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
DNMT1P26358 SLFNL1-201ENST00000302946 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
DNMT1P26358 PSEN2-203ENST00000422240 1947 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
DNMT1P26358 EIF1AX-201ENST00000379593 765 ntTSL 3 BASIC23.99■■□□□ 1.43
DNMT1P26358 USP40-206ENST00000443711 628 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
DNMT1P26358 CROCCP4-201ENST00000457096 498 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
DNMT1P26358 SELENOT-203ENST00000477889 944 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
DNMT1P26358 SPDYE16-201ENST00000515340 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
DNMT1P26358 AL133153.2-201ENST00000557524 303 ntTSL 3 BASIC23.99■■□□□ 1.43
DNMT1P26358 IGHV3OR16-16-201ENST00000563644 343 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
DNMT1P26358 ANKS3-227ENST00000592711 580 ntTSL 4 BASIC23.99■■□□□ 1.43
DNMT1P26358 AL450472.2-201ENST00000603663 1156 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
DNMT1P26358 C6orf223-203ENST00000442114 3109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
DNMT1P26358 CES4A-206ENST00000540579 1825 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.5 ms