Protein–RNA interactions for Protein: P23229

ITGA6, Integrin alpha-6, humanhuman

Predictions only

Length 1,130 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGA6P23229 FAM234A-203ENST00000399932 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
ITGA6P23229 IGLON5-201ENST00000270642 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
ITGA6P23229 TDH-201ENST00000525246 1357 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
ITGA6P23229 TMEM110-201ENST00000355083 4769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
ITGA6P23229 MIB2-201ENST00000355826 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
ITGA6P23229 UBXN11-205ENST00000374221 1792 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
ITGA6P23229 RNPS1-223ENST00000568631 1792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
ITGA6P23229 ESPNP-202ENST00000414828 571 ntTSL 3 BASIC19.99■□□□□ 0.79
ITGA6P23229 COX5BP8-201ENST00000416911 349 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
ITGA6P23229 DFFBP1-201ENST00000433250 979 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
ITGA6P23229 AL589987.1-201ENST00000453380 819 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
ITGA6P23229 PTK7-212ENST00000476760 902 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
ITGA6P23229 AC140912.1-201ENST00000577171 1054 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
ITGA6P23229 GGT5-203ENST00000398292 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
ITGA6P23229 GPER1-206ENST00000617001 1900 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
ITGA6P23229 PPP2R2B-206ENST00000453001 2569 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
ITGA6P23229 TPM1-201ENST00000267996 1670 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
ITGA6P23229 LHCGR-204ENST00000405626 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
ITGA6P23229 ATXN2-227ENST00000616825 4575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
ITGA6P23229 ALDH1A3-201ENST00000329841 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
ITGA6P23229 CNTNAP3-205ENST00000377659 2649 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
ITGA6P23229 ME2P1-201ENST00000426028 1970 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
ITGA6P23229 IKZF4-206ENST00000547791 1712 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
ITGA6P23229 ARHGAP33-201ENST00000007510 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
ITGA6P23229 SPSB4-201ENST00000310546 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
ITGA6P23229 ATG5-210ENST00000636437 2261 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
ITGA6P23229 CCDC28A-201ENST00000332797 1496 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
ITGA6P23229 FDPS-201ENST00000356657 1478 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
ITGA6P23229 VASH1-203ENST00000554237 1462 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
ITGA6P23229 MAGEA8-201ENST00000286482 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
ITGA6P23229 CDK13-201ENST00000181839 7298 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
ITGA6P23229 FAM174A-201ENST00000312637 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
ITGA6P23229 TEKT2-201ENST00000207457 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
ITGA6P23229 RBFOX3-212ENST00000584778 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
ITGA6P23229 KRT8-215ENST00000552150 1687 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
ITGA6P23229 VASH1-201ENST00000167106 5728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
ITGA6P23229 KCNJ8-201ENST00000240662 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
ITGA6P23229 MTMR14-203ENST00000353332 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
ITGA6P23229 SYVN1-203ENST00000377190 3052 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
ITGA6P23229 AL357673.1-201ENST00000637610 2542 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
ITGA6P23229 COL5A3-201ENST00000264828 6174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
ITGA6P23229 MRPL13-201ENST00000306185 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
ITGA6P23229 LINC01116-202ENST00000339037 838 ntTSL 3 BASIC19.98■□□□□ 0.79
ITGA6P23229 ACTA1-201ENST00000366683 1122 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
ITGA6P23229 NDUFB8-202ENST00000370320 684 ntTSL 3 BASIC19.98■□□□□ 0.79
ITGA6P23229 CCL25-203ENST00000390669 924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
ITGA6P23229 AC008406.2-201ENST00000507058 532 ntTSL 3 BASIC19.98■□□□□ 0.79
ITGA6P23229 NEIL2-207ENST00000528323 998 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
ITGA6P23229 SLC8B1-206ENST00000549069 1058 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
ITGA6P23229 SPATA8-AS1-201ENST00000558722 465 ntTSL 3 BASIC19.98■□□□□ 0.79
ITGA6P23229 FAM20A-205ENST00000592554 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
ITGA6P23229 DUSP13-214ENST00000607131 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
ITGA6P23229 5S_rRNA.22-201ENST00000614916 106 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
ITGA6P23229 SNHG28-203ENST00000621242 708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
ITGA6P23229 LMF1-AS1-202ENST00000569574 1408 ntTSL 3 BASIC19.98■□□□□ 0.79
ITGA6P23229 AL691432.1-201ENST00000596308 1422 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
ITGA6P23229 FAM69B-201ENST00000371691 2410 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
ITGA6P23229 UBL7-209ENST00000567435 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
ITGA6P23229 AADAT-208ENST00000515480 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
ITGA6P23229 GJA3-201ENST00000241125 5211 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.98■□□□□ 0.79
ITGA6P23229 GLIPR2-205ENST00000619700 1645 ntTSL 3 BASIC19.98■□□□□ 0.79
ITGA6P23229 TUBB3-201ENST00000315491 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
ITGA6P23229 GOLGA2-213ENST00000610329 2212 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
ITGA6P23229 AIFM3-202ENST00000399167 2387 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
ITGA6P23229 AIFM3-207ENST00000440238 2368 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
ITGA6P23229 PTPA-206ENST00000358994 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
ITGA6P23229 NDFIP1-201ENST00000253814 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
ITGA6P23229 VWA1-203ENST00000476993 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
ITGA6P23229 EVX2-201ENST00000308618 4203 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
ITGA6P23229 OGFR-201ENST00000290291 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
ITGA6P23229 ZNF79-204ENST00000617266 1969 ntTSL 3 BASIC19.97■□□□□ 0.79
ITGA6P23229 FBXO33-201ENST00000298097 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
ITGA6P23229 GALNT17-201ENST00000333538 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
ITGA6P23229 PCBP4-202ENST00000355852 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
ITGA6P23229 ELAC2-203ENST00000426905 2671 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
ITGA6P23229 AC132872.2-201ENST00000581303 2368 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
ITGA6P23229 MRPL53-201ENST00000258105 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
ITGA6P23229 FLYWCH2-201ENST00000293981 915 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC19.97■□□□□ 0.79
ITGA6P23229 TSPO-202ENST00000337554 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
ITGA6P23229 SELENOM-201ENST00000400299 694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
ITGA6P23229 OSM-203ENST00000403463 464 ntTSL 3 BASIC19.97■□□□□ 0.79
ITGA6P23229 APOA1-AS-201ENST00000444200 563 ntTSL 4 BASIC19.97■□□□□ 0.79
ITGA6P23229 LINC00473-201ENST00000444465 798 ntTSL 3 BASIC19.97■□□□□ 0.79
ITGA6P23229 CD81-207ENST00000481687 890 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
ITGA6P23229 AL161781.2-201ENST00000509911 739 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
ITGA6P23229 CR383656.12-201ENST00000549567 513 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
ITGA6P23229 AC027575.2-201ENST00000585258 1295 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
ITGA6P23229 AP005482.2-201ENST00000587889 310 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
ITGA6P23229 AC025048.3-201ENST00000590609 569 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
ITGA6P23229 CHCHD2P3-201ENST00000603038 451 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
ITGA6P23229 AC005702.4-201ENST00000618393 416 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
ITGA6P23229 FKBP4-208ENST00000630279 156 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
ITGA6P23229 BRIX1-201ENST00000336767 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
ITGA6P23229 MCM3AP-AS1-202ENST00000420074 1947 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
ITGA6P23229 RIC8B-213ENST00000638198 1611 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
ITGA6P23229 ESYT2-206ENST00000613624 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
ITGA6P23229 SP3-203ENST00000418194 3937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
ITGA6P23229 PFDN4-201ENST00000371419 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
ITGA6P23229 TAGLN3-202ENST00000393917 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
ITGA6P23229 CHST8-201ENST00000262622 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31 ms