Protein–RNA interactions for Protein: P13224

GP1BB, Platelet glycoprotein Ib beta chain, humanhuman

Predictions only

Length 206 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GP1BBP13224 LYNX1-206ENST00000621401 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
GP1BBP13224 ATG9B-212ENST00000639579 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
GP1BBP13224 EDN3-202ENST00000337938 2636 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
GP1BBP13224 ABCF3-203ENST00000429586 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
GP1BBP13224 AL138752.2-201ENST00000540557 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
GP1BBP13224 FAM53B-202ENST00000337318 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
GP1BBP13224 MEG3-206ENST00000423456 1771 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
GP1BBP13224 CHAT-201ENST00000337653 2458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
GP1BBP13224 ANKMY1-202ENST00000361678 2499 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
GP1BBP13224 DLGAP4-205ENST00000401952 4881 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
GP1BBP13224 TMEM189-UBE2V1-201ENST00000341698 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
GP1BBP13224 NUP50-203ENST00000407019 2059 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
GP1BBP13224 GSTO2-203ENST00000450629 1391 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
GP1BBP13224 MAFB-201ENST00000373313 3393 ntAPPRIS P1 BASIC15.26■□□□□ 0.03
GP1BBP13224 WDR90-209ENST00000547944 1672 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
GP1BBP13224 ACE-202ENST00000290866 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
GP1BBP13224 SEPT9-202ENST00000423034 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
GP1BBP13224 CDC25B-204ENST00000379598 2990 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
GP1BBP13224 USP45-201ENST00000327681 6255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
GP1BBP13224 C2orf54-203ENST00000402775 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
GP1BBP13224 EPHA8-201ENST00000166244 4943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
GP1BBP13224 UBALD1-205ENST00000590891 2641 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
GP1BBP13224 TMEM52-201ENST00000310991 929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
GP1BBP13224 STARD13-205ENST00000439831 945 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
GP1BBP13224 SPDYE11-202ENST00000450699 704 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
GP1BBP13224 PSEN2-206ENST00000472139 1163 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
GP1BBP13224 GSTK1-207ENST00000479303 1185 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
GP1BBP13224 INS-205ENST00000512523 297 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
GP1BBP13224 AC090607.3-202ENST00000558971 383 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
GP1BBP13224 SPDYE9P-201ENST00000570642 692 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
GP1BBP13224 SIGLEC29P-201ENST00000599873 1114 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
GP1BBP13224 AC004233.3-201ENST00000607794 1269 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
GP1BBP13224 AC239798.4-201ENST00000609879 700 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
GP1BBP13224 Six3os1_5.1-201ENST00000611000 271 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
GP1BBP13224 SPDYE10P-202ENST00000612005 668 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
GP1BBP13224 SPDYE8P-202ENST00000612377 668 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
GP1BBP13224 WT1-AS_2.1-201ENST00000613208 137 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
GP1BBP13224 BCRP3-202ENST00000621462 1021 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
GP1BBP13224 NR6A1-205ENST00000487099 7031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
GP1BBP13224 CCDC189-204ENST00000541260 1531 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
GP1BBP13224 TMEM161A-201ENST00000162044 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
GP1BBP13224 AC226118.1-201ENST00000515213 2146 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
GP1BBP13224 MVB12B-201ENST00000361171 4819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
GP1BBP13224 EDC3-202ENST00000426797 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
GP1BBP13224 LINC00323-202ENST00000441268 2095 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
GP1BBP13224 MTERF2-201ENST00000240050 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
GP1BBP13224 RIMS1-210ENST00000491071 5047 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
GP1BBP13224 LAT-202ENST00000360872 1459 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
GP1BBP13224 SH2B1-206ENST00000545570 1488 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
GP1BBP13224 LMF1-201ENST00000262301 2621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
GP1BBP13224 MAN1C1-201ENST00000263979 2627 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
GP1BBP13224 LAPTM4B-201ENST00000445593 3173 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
GP1BBP13224 UGCG-201ENST00000374279 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
GP1BBP13224 GOLGA2-213ENST00000610329 2212 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
GP1BBP13224 LDOC1-201ENST00000370526 1381 ntAPPRIS P1 BASIC15.25■□□□□ 0.03
GP1BBP13224 GCLM-201ENST00000370238 4857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
GP1BBP13224 FANCA-203ENST00000389302 1641 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
GP1BBP13224 PRMT2-208ENST00000451211 1878 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
GP1BBP13224 RB1CC1-201ENST00000025008 6635 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
GP1BBP13224 IGLL5-203ENST00000532223 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
GP1BBP13224 DARS-201ENST00000264161 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
GP1BBP13224 PEX10-201ENST00000288774 2871 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
GP1BBP13224 GLOD4-202ENST00000301329 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
GP1BBP13224 ACOT12-201ENST00000307624 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
GP1BBP13224 SLC2A5-201ENST00000377414 2344 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
GP1BBP13224 DCAF12L2-201ENST00000360028 2599 ntAPPRIS P1 BASIC15.25■□□□□ 0.03
GP1BBP13224 CGB3-201ENST00000357383 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
GP1BBP13224 CGB2-201ENST00000359342 627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
GP1BBP13224 AC002056.1-201ENST00000395613 760 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
GP1BBP13224 NME6-203ENST00000415644 849 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
GP1BBP13224 WDR53-204ENST00000433160 887 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
GP1BBP13224 PTPA-220ENST00000436883 532 ntTSL 4 BASIC15.25■□□□□ 0.03
GP1BBP13224 TREML1-203ENST00000437044 647 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
GP1BBP13224 H2AFV-206ENST00000437072 589 ntTSL 4 BASIC15.25■□□□□ 0.03
GP1BBP13224 AL592309.1-201ENST00000443127 649 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
GP1BBP13224 AC079336.1-201ENST00000583156 420 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
GP1BBP13224 LGALS9C-215ENST00000584941 1104 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
GP1BBP13224 ELOF1-205ENST00000589171 743 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
GP1BBP13224 MIR6805-201ENST00000615055 62 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
GP1BBP13224 ZNF445-205ENST00000617032 1291 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
GP1BBP13224 AC068587.10-201ENST00000641210 219 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
GP1BBP13224 AC012569.1-201ENST00000591191 1524 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
GP1BBP13224 CD1D-201ENST00000368171 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
GP1BBP13224 FLVCR1-AS1-201ENST00000356684 2525 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
GP1BBP13224 SHISA9-203ENST00000558583 6724 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
GP1BBP13224 PYCR3-201ENST00000220966 2678 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
GP1BBP13224 ANKRD23-203ENST00000418232 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
GP1BBP13224 ATP5S-201ENST00000245448 1671 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
GP1BBP13224 KRT8P39-201ENST00000396270 1433 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
GP1BBP13224 TLK2-201ENST00000326270 3512 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
GP1BBP13224 OSBPL1A-203ENST00000399441 1887 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
GP1BBP13224 C17orf113-201ENST00000587304 3746 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
GP1BBP13224 GLMP-201ENST00000362007 1604 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
GP1BBP13224 FSCN1-201ENST00000382361 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
GP1BBP13224 AC099398.1-201ENST00000567919 2776 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
GP1BBP13224 RGS3-206ENST00000374136 2092 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
GP1BBP13224 AL139300.1-201ENST00000472726 2505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
GP1BBP13224 ICAM4-203ENST00000393717 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
GP1BBP13224 CLCF1-201ENST00000312438 1844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
GP1BBP13224 TLE2-204ENST00000455444 2253 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30 ms