Protein–RNA interactions for Protein: P11926

ODC1, Ornithine decarboxylase, humanhuman

Predictions only

Length 461 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ODC1P11926 TXNDC2-201ENST00000306084 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
ODC1P11926 SNX9-201ENST00000392185 4198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
ODC1P11926 CHTOP-201ENST00000368686 2250 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
ODC1P11926 PLXNB3-201ENST00000361971 6146 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
ODC1P11926 PRKACG-201ENST00000377276 1585 ntAPPRIS P1 BASIC17.28■□□□□ 0.36
ODC1P11926 GFY-202ENST00000610896 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
ODC1P11926 AC005052.1-201ENST00000625181 2492 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
ODC1P11926 PRAG1-201ENST00000615670 4903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
ODC1P11926 MTFR2-203ENST00000420702 1793 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
ODC1P11926 HEY1-208ENST00000523976 1325 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
ODC1P11926 GGT5-203ENST00000398292 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
ODC1P11926 EVC2-202ENST00000344408 4390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
ODC1P11926 HHIPL1-201ENST00000330710 7390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
ODC1P11926 THOC5-202ENST00000397871 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
ODC1P11926 ADAM22-202ENST00000398201 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
ODC1P11926 RASA4-202ENST00000449970 2787 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
ODC1P11926 PNKD-201ENST00000248451 758 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
ODC1P11926 CIB3-201ENST00000269878 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
ODC1P11926 KLK8-202ENST00000320838 456 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
ODC1P11926 CD8B-201ENST00000331469 832 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
ODC1P11926 CIB3-202ENST00000379859 467 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
ODC1P11926 NQO2-203ENST00000380441 1021 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
ODC1P11926 MRPS18AP1-201ENST00000414458 589 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
ODC1P11926 AC016735.2-201ENST00000438736 569 ntTSL 4 BASIC17.28■□□□□ 0.36
ODC1P11926 PAX5-207ENST00000446742 885 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
ODC1P11926 OARD1-208ENST00000469104 704 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
ODC1P11926 RN7SL204P-201ENST00000582831 262 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
ODC1P11926 AL844908.2-201ENST00000609461 460 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
ODC1P11926 OARD1-216ENST00000628419 1188 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
ODC1P11926 ISG20L2-202ENST00000368219 2310 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
ODC1P11926 FBXO22-202ENST00000453211 1486 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
ODC1P11926 ANKRD20A5P-207ENST00000581935 2089 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
ODC1P11926 CD244-203ENST00000368034 2463 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
ODC1P11926 CDHR1-201ENST00000332904 2694 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
ODC1P11926 SLCO4A1-202ENST00000370507 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
ODC1P11926 SRRM2-201ENST00000301740 9353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
ODC1P11926 ZNF397-201ENST00000261333 1419 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
ODC1P11926 SNAI2-201ENST00000020945 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
ODC1P11926 TDRP-201ENST00000324079 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
ODC1P11926 AC132872.2-201ENST00000581303 2368 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
ODC1P11926 KIAA0895-207ENST00000436884 1952 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
ODC1P11926 KRT8P12-202ENST00000472924 1397 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
ODC1P11926 ITGA3-202ENST00000320031 4888 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
ODC1P11926 MCCC1-201ENST00000265594 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
ODC1P11926 AL096870.2-201ENST00000565988 2108 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
ODC1P11926 BRIX1-201ENST00000336767 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
ODC1P11926 SNAP47-213ENST00000617596 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
ODC1P11926 PAK4-203ENST00000360442 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
ODC1P11926 EPB41L5-203ENST00000443124 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
ODC1P11926 BID-201ENST00000317361 2495 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
ODC1P11926 KPNA2-202ENST00000537025 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
ODC1P11926 LMX1B-204ENST00000561065 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
ODC1P11926 NUP50-202ENST00000396096 1895 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
ODC1P11926 REXO1L8P-201ENST00000604378 1897 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
ODC1P11926 TSC2-201ENST00000219476 6156 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
ODC1P11926 TRPC6-202ENST00000348423 2448 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
ODC1P11926 TNRC18-202ENST00000399434 1459 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
ODC1P11926 CDIP1-206ENST00000563507 1463 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
ODC1P11926 NF2-208ENST00000403435 2568 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
ODC1P11926 ZNF496-201ENST00000294753 5336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
ODC1P11926 LTK-204ENST00000561619 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
ODC1P11926 ENDOV-201ENST00000323854 1226 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
ODC1P11926 SFT2D1-201ENST00000361731 1079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
ODC1P11926 PDSS2-201ENST00000369031 1236 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
ODC1P11926 PSMB8-203ENST00000395339 1025 ntTSL 3 BASIC17.27■□□□□ 0.36
ODC1P11926 SPDYE17-201ENST00000412399 783 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
ODC1P11926 AC245100.5-201ENST00000452108 331 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
ODC1P11926 AC009477.1-201ENST00000452936 217 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
ODC1P11926 AL627443.1-201ENST00000456477 1035 ntTSL 3 BASIC17.27■□□□□ 0.36
ODC1P11926 RN7SL618P-201ENST00000477850 296 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
ODC1P11926 AC015712.4-202ENST00000558641 1007 ntTSL 4 BASIC17.27■□□□□ 0.36
ODC1P11926 AC138761.1-201ENST00000584393 385 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
ODC1P11926 ARID1B-202ENST00000346085 10194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
ODC1P11926 RPS9-207ENST00000441429 1600 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
ODC1P11926 COQ8A-201ENST00000366777 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
ODC1P11926 ZNF451-203ENST00000370706 5268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
ODC1P11926 APBA2-207ENST00000558402 4031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
ODC1P11926 PTGDR-201ENST00000306051 2942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
ODC1P11926 TEX261-201ENST00000272438 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
ODC1P11926 LIN54-204ENST00000505397 2742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
ODC1P11926 TMEM65-201ENST00000297632 9029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
ODC1P11926 FAM234A-203ENST00000399932 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
ODC1P11926 CLU-215ENST00000523500 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
ODC1P11926 FBLIM1-206ENST00000441801 1543 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
ODC1P11926 IMPDH1P4-201ENST00000445028 1534 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
ODC1P11926 TMEM161A-206ENST00000587583 1654 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
ODC1P11926 ELAC2-203ENST00000426905 2671 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
ODC1P11926 ZNF74-202ENST00000400451 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
ODC1P11926 PIGT-221ENST00000638594 1835 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
ODC1P11926 MON2-203ENST00000546600 6130 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
ODC1P11926 UCKL1-203ENST00000369908 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
ODC1P11926 SRGAP2C-201ENST00000304465 1477 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
ODC1P11926 SRGAP2-201ENST00000419187 1477 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
ODC1P11926 SRGAP2B-205ENST00000619678 1477 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
ODC1P11926 AIFM1-201ENST00000287295 2260 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
ODC1P11926 NCAPD2-201ENST00000315579 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
ODC1P11926 NRBP2-202ENST00000442628 3587 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
ODC1P11926 ATG5-210ENST00000636437 2261 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
ODC1P11926 RIC8B-213ENST00000638198 1611 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
ODC1P11926 HCN1-201ENST00000303230 9885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.7 ms