Protein–RNA interactions for Protein: P11441

UBL4A, Ubiquitin-like protein 4A, humanhuman

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Length 157 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBL4AP11441 UCKL1-203ENST00000369908 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
UBL4AP11441 SULT1A2-204ENST00000533150 1991 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
UBL4AP11441 LINC01144-201ENST00000626198 1710 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
UBL4AP11441 KIAA1217-206ENST00000376462 6123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
UBL4AP11441 MBD1-222ENST00000590208 2913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
UBL4AP11441 MARCO-201ENST00000327097 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
UBL4AP11441 AL353803.2-201ENST00000436510 1846 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
UBL4AP11441 BCL11A-203ENST00000358510 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
UBL4AP11441 PITPNM1-201ENST00000356404 4225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
UBL4AP11441 CLN3-216ENST00000565316 1318 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
UBL4AP11441 HSP90B1-210ENST00000614327 1338 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
UBL4AP11441 SLC4A5-203ENST00000377632 3123 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
UBL4AP11441 NFIX-210ENST00000588228 1692 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
UBL4AP11441 ACP5-212ENST00000592828 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
UBL4AP11441 ICMT-201ENST00000343813 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
UBL4AP11441 CD72-204ENST00000396757 2035 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
UBL4AP11441 GPR108-202ENST00000430424 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
UBL4AP11441 ADGRE2-208ENST00000595839 2046 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
UBL4AP11441 NFATC4-203ENST00000422617 5491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
UBL4AP11441 TVP23B-202ENST00000476139 2989 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
UBL4AP11441 ANAPC13-206ENST00000514612 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
UBL4AP11441 IKBKE-204ENST00000584998 2487 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
UBL4AP11441 PLPPR4-203ENST00000457765 4846 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
UBL4AP11441 TBRG4-203ENST00000395655 2225 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
UBL4AP11441 AC010931.2-202ENST00000514871 2566 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
UBL4AP11441 DPY30-201ENST00000295066 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
UBL4AP11441 THAP3-202ENST00000307896 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
UBL4AP11441 DPY30-202ENST00000342166 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
UBL4AP11441 HIST1H3D-201ENST00000356476 411 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
UBL4AP11441 Metazoa_SRP.28-201ENST00000366402 260 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
UBL4AP11441 HNRNPA1P28-201ENST00000424481 961 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
UBL4AP11441 PIGBOS1-201ENST00000436697 866 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
UBL4AP11441 AL807752.3-201ENST00000456356 748 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
UBL4AP11441 NTMT1-205ENST00000459968 1123 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
UBL4AP11441 CMPK1-205ENST00000471289 816 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
UBL4AP11441 AP000892.1-201ENST00000504906 488 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
UBL4AP11441 DDIAS-202ENST00000524921 607 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC15.19■□□□□ 0.02
UBL4AP11441 AC135050.2-203ENST00000529564 725 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.19■□□□□ 0.02
UBL4AP11441 SPATA33-208ENST00000568929 1264 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
UBL4AP11441 AC040963.1-202ENST00000589729 644 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
UBL4AP11441 AC008403.2-204ENST00000600650 1006 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
UBL4AP11441 MOB3B-201ENST00000262244 6454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
UBL4AP11441 AC132872.4-202ENST00000622924 2756 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
UBL4AP11441 ARL14EP-201ENST00000282032 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
UBL4AP11441 AC006449.5-201ENST00000610658 2098 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
UBL4AP11441 NRXN1-229ENST00000628515 3243 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
UBL4AP11441 PELP1-208ENST00000572293 5272 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
UBL4AP11441 AQP3-201ENST00000297991 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
UBL4AP11441 AL669918.1-201ENST00000452392 2705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
UBL4AP11441 TXNDC11-202ENST00000356957 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
UBL4AP11441 TMEM132D-202ENST00000422113 5776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
UBL4AP11441 LAT2-202ENST00000344995 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
UBL4AP11441 IRAK1-204ENST00000393687 2049 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
UBL4AP11441 PRDM5-202ENST00000394435 2492 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
UBL4AP11441 GALE-216ENST00000617979 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
UBL4AP11441 MROH6-201ENST00000398882 3469 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
UBL4AP11441 LINC00612-201ENST00000538094 2213 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
UBL4AP11441 AXL-202ENST00000359092 3206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
UBL4AP11441 ARHGEF5-201ENST00000056217 5544 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
UBL4AP11441 MUL1-201ENST00000264198 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
UBL4AP11441 CLMAT3-201ENST00000510576 1973 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
UBL4AP11441 MYCL-203ENST00000397332 3256 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
UBL4AP11441 HLA-B-249ENST00000412585 1547 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
UBL4AP11441 RBM14-201ENST00000310137 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
UBL4AP11441 CNPY1-203ENST00000636372 2259 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
UBL4AP11441 PDE4C-201ENST00000262805 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
UBL4AP11441 MEX3A-202ENST00000532414 6124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
UBL4AP11441 AMZ2P1-202ENST00000430983 3425 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
UBL4AP11441 CICP13-201ENST00000422015 2789 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
UBL4AP11441 TLE3-212ENST00000558201 2766 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
UBL4AP11441 SLIT1-204ENST00000371070 4564 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
UBL4AP11441 MRGPRD-201ENST00000309106 966 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
UBL4AP11441 DNAJC4-203ENST00000355040 759 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
UBL4AP11441 OTOS-202ENST00000391989 645 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
UBL4AP11441 AC140658.5-201ENST00000438532 169 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
UBL4AP11441 AL121672.1-201ENST00000439423 1181 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
UBL4AP11441 AC139887.2-202ENST00000507446 534 ntTSL 4 BASIC15.18■□□□□ 0.02
UBL4AP11441 AF131215.3-201ENST00000532453 639 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
UBL4AP11441 AC109635.5-201ENST00000533593 962 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
UBL4AP11441 BLOC1S1-201ENST00000547076 837 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
UBL4AP11441 PDPK2P-202ENST00000562415 1191 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
UBL4AP11441 METTL23-202ENST00000586200 465 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
UBL4AP11441 METTL23-212ENST00000590964 1006 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
UBL4AP11441 AL009183.1-201ENST00000603760 355 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
UBL4AP11441 TUBA4B-203ENST00000490341 1380 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
UBL4AP11441 TATDN3-214ENST00000532324 1381 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
UBL4AP11441 CHMP5-201ENST00000223500 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
UBL4AP11441 TRIM72-201ENST00000322122 8500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
UBL4AP11441 SLC22A12-205ENST00000473690 2522 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
UBL4AP11441 TNKS1BP1-207ENST00000532437 5952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
UBL4AP11441 UROC1-202ENST00000383579 2735 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
UBL4AP11441 COMP-203ENST00000542601 2707 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
UBL4AP11441 COMMD6-203ENST00000377615 1793 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
UBL4AP11441 EIF2B4-212ENST00000622434 1771 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
UBL4AP11441 PLAGL1-206ENST00000416623 3237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
UBL4AP11441 SMIM13-202ENST00000416247 4688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
UBL4AP11441 GRB7-204ENST00000394211 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
UBL4AP11441 GALNT14-201ENST00000324589 2169 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
UBL4AP11441 DCST1-201ENST00000295542 2279 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
UBL4AP11441 SEPT8-204ENST00000378699 2289 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
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