Protein–RNA interactions for Protein: P10645

CHGA, Chromogranin-A, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 457 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHGAP10645 DKK3-201ENST00000326932 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CHGAP10645 FAM213B-205ENST00000444521 2827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CHGAP10645 SYDE2-202ENST00000341460 5512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CHGAP10645 U82695.1-201ENST00000635752 1889 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
CHGAP10645 PARP15-202ENST00000464300 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CHGAP10645 DMPK-201ENST00000291270 2787 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CHGAP10645 URAHP-202ENST00000409873 1349 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CHGAP10645 TUBB8-201ENST00000561967 1413 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
CHGAP10645 TMEM161A-201ENST00000162044 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CHGAP10645 DMRTA2-201ENST00000404795 3137 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
CHGAP10645 TAX1BP1-201ENST00000265393 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CHGAP10645 PDPK2P-201ENST00000382326 2387 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CHGAP10645 AC006538.1-201ENST00000567905 1585 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
CHGAP10645 PHLDA2-201ENST00000314222 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CHGAP10645 HRCT1-201ENST00000354323 950 ntAPPRIS P1 BASIC23.33■■□□□ 1.33
CHGAP10645 MPV17-203ENST00000380044 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CHGAP10645 AC009163.1-201ENST00000530512 573 ntTSL 4 BASIC23.33■■□□□ 1.33
CHGAP10645 NOP16-209ENST00000618911 1087 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CHGAP10645 AL160035.1-201ENST00000637583 576 ntTSL 4 BASIC23.33■■□□□ 1.33
CHGAP10645 SLC1A4-201ENST00000234256 4561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CHGAP10645 EXT2-202ENST00000358681 2997 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
CHGAP10645 ZNF839-202ENST00000442396 2987 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
CHGAP10645 CFAP43-203ENST00000369719 1434 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.32
CHGAP10645 PDZD3-202ENST00000355547 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
CHGAP10645 SCOC-208ENST00000510586 2193 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
CHGAP10645 MSMO1-202ENST00000393766 1789 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CHGAP10645 DMAC2-201ENST00000221943 1692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CHGAP10645 PARD3-201ENST00000340077 3518 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CHGAP10645 SALL3-202ENST00000537592 6555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CHGAP10645 SPIDR-227ENST00000541342 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CHGAP10645 IL3RA-202ENST00000381469 1476 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CHGAP10645 CLEC18B-206ENST00000620745 1847 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CHGAP10645 RHCE-206ENST00000413854 1198 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CHGAP10645 RPL28-204ENST00000431533 590 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CHGAP10645 CHMP2B-205ENST00000494980 1175 ntTSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CHGAP10645 RPL28-206ENST00000558752 671 ntTSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CHGAP10645 RARRES2P5-201ENST00000564013 466 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
CHGAP10645 AC124287.1-201ENST00000582249 838 ntTSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CHGAP10645 IL32-235ENST00000613483 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CHGAP10645 NR2F1-201ENST00000327111 3732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CHGAP10645 GOLGA7-204ENST00000520817 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CHGAP10645 NSMF-204ENST00000371473 3556 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CHGAP10645 SGCB-201ENST00000381431 4431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CHGAP10645 CCDC183-201ENST00000338005 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CHGAP10645 AAAS-217ENST00000550286 1652 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CHGAP10645 HCRTR1-203ENST00000403528 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CHGAP10645 CDC14B-203ENST00000375242 2965 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CHGAP10645 CRYM-201ENST00000219599 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CHGAP10645 AC118344.1-201ENST00000378432 1462 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CHGAP10645 BRINP1-202ENST00000373964 1641 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CHGAP10645 KRT12-201ENST00000251643 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CHGAP10645 SLC10A3-204ENST00000393587 1862 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CHGAP10645 CSF2-201ENST00000296871 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CHGAP10645 AP000317.2-201ENST00000362077 641 ntTSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CHGAP10645 EIF1AX-201ENST00000379593 765 ntTSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CHGAP10645 TPM1-207ENST00000403994 1049 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CHGAP10645 LRRTM1-202ENST00000409148 2126 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CHGAP10645 MOGAT3-203ENST00000440203 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CHGAP10645 IGFBP2-204ENST00000456764 846 ntTSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CHGAP10645 GNG2-209ENST00000555472 908 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CHGAP10645 TMEM170A-203ENST00000566980 547 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CHGAP10645 IFT20-215ENST00000585313 852 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CHGAP10645 AC010319.3-201ENST00000597028 470 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
CHGAP10645 H2BFM-203ENST00000598335 465 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CHGAP10645 FHL2-205ENST00000393353 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CHGAP10645 CTNNAL1-204ENST00000374595 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CHGAP10645 SLC29A2-206ENST00000546034 2509 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CHGAP10645 DPF2-205ENST00000528416 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CHGAP10645 USP7-201ENST00000344836 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CHGAP10645 NIPAL2-201ENST00000341166 4581 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CHGAP10645 WNT5B-202ENST00000397196 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CHGAP10645 CACNA1I-201ENST00000401624 6740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CHGAP10645 PPP2R2B-203ENST00000394411 2071 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CHGAP10645 DGKE-204ENST00000572810 1843 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CHGAP10645 SUZ12-201ENST00000322652 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CHGAP10645 WDR45-239ENST00000634944 1745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CHGAP10645 THEM4-201ENST00000368814 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CHGAP10645 FLYWCH1-203ENST00000416288 4963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CHGAP10645 LYPLAL1-202ENST00000366928 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CHGAP10645 GLIPR2-205ENST00000619700 1645 ntTSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CHGAP10645 CPT2-210ENST00000637252 2739 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CHGAP10645 SGSM2-202ENST00000426855 4734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CHGAP10645 IQCE-217ENST00000623361 6775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CHGAP10645 BUD31-201ENST00000222969 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CHGAP10645 CCDC12-201ENST00000292314 1017 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CHGAP10645 ANKRD19P-201ENST00000338192 862 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
CHGAP10645 AC017116.1-201ENST00000445938 708 ntTSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CHGAP10645 BNIP3P42-201ENST00000454982 569 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
CHGAP10645 LIMS3-203ENST00000480744 1197 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CHGAP10645 AP005482.1-201ENST00000563722 1273 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
CHGAP10645 RRP7BP-205ENST00000566851 833 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
CHGAP10645 PAM16-204ENST00000571941 674 ntTSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CHGAP10645 FLT3LG-205ENST00000596435 1034 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CHGAP10645 BNIP3P29-201ENST00000598302 571 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
CHGAP10645 AC011447.5-201ENST00000616168 564 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
CHGAP10645 SYNE2-228ENST00000639659 1290 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CHGAP10645 MARCO-201ENST00000327097 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CHGAP10645 SGSH-201ENST00000326317 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CHGAP10645 FTSJ1-201ENST00000019019 1986 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CHGAP10645 ZNF454-202ENST00000519564 2142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.5 ms