Protein–RNA interactions for Protein: P08F94

PKHD1, Fibrocystin, humanhuman

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Length 4,074 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKHD1P08F94 AL590617.2-201ENST00000432673 917 ntTSL 3 BASIC10.25□□□□□ -0.77
PKHD1P08F94 FTLP10-202ENST00000505798 471 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
PKHD1P08F94 AC005920.3-202ENST00000512717 789 ntTSL 3 BASIC10.25□□□□□ -0.77
PKHD1P08F94 MSRB3-209ENST00000540804 884 ntTSL 2 BASIC10.25□□□□□ -0.77
PKHD1P08F94 SHBG-212ENST00000575314 1146 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
PKHD1P08F94 HOXB6-203ENST00000484302 1960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.25□□□□□ -0.77
PKHD1P08F94 NDOR1-203ENST00000427047 2315 ntTSL 2 BASIC10.25□□□□□ -0.77
PKHD1P08F94 TVP23C-204ENST00000438826 1852 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
PKHD1P08F94 ACP5-202ENST00000412435 1527 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.25□□□□□ -0.77
PKHD1P08F94 TDRKH-203ENST00000368824 2824 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
PKHD1P08F94 CLDN15-202ENST00000401528 2131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.25□□□□□ -0.77
PKHD1P08F94 MIER1-204ENST00000371012 2420 ntTSL 2 BASIC10.25□□□□□ -0.77
PKHD1P08F94 ZNF200-202ENST00000396870 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
PKHD1P08F94 PDE6B-202ENST00000429163 2120 ntTSL 2 BASIC10.24□□□□□ -0.77
PKHD1P08F94 MYC-201ENST00000259523 2042 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
PKHD1P08F94 PAX4-202ENST00000341640 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
PKHD1P08F94 ADAM33-202ENST00000356518 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
PKHD1P08F94 ADAM33-203ENST00000379861 3674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
PKHD1P08F94 PRSS54-204ENST00000567164 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
PKHD1P08F94 ANKRD33-202ENST00000340970 1507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
PKHD1P08F94 TEX30-203ENST00000376022 828 ntTSL 2 BASIC10.24□□□□□ -0.77
PKHD1P08F94 IGHV3-49-201ENST00000390625 439 ntAPPRIS P1 BASIC10.24□□□□□ -0.77
PKHD1P08F94 TOMM22P5-201ENST00000416399 439 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
PKHD1P08F94 AHRR-211ENST00000515206 462 ntTSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
PKHD1P08F94 AC134698.3-201ENST00000523880 214 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
PKHD1P08F94 AC116456.1-201ENST00000526646 815 ntTSL 3 BASIC10.24□□□□□ -0.77
PKHD1P08F94 HNRNPA1P48-202ENST00000565308 961 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
PKHD1P08F94 GEMIN7-204ENST00000591747 576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
PKHD1P08F94 RTN4-201ENST00000317610 2333 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
PKHD1P08F94 SLC29A1-208ENST00000393844 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
PKHD1P08F94 ZBP1-202ENST00000395822 2073 ntTSL 2 BASIC10.24□□□□□ -0.77
PKHD1P08F94 PTGER3-208ENST00000370932 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
PKHD1P08F94 ZBTB32-201ENST00000262630 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
PKHD1P08F94 CCDC142-201ENST00000290418 2835 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.24□□□□□ -0.77
PKHD1P08F94 GTF2H2C-201ENST00000380729 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
PKHD1P08F94 SPDYE4-201ENST00000328794 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
PKHD1P08F94 SIRPB2-203ENST00000444444 884 ntTSL 2 BASIC10.24□□□□□ -0.77
PKHD1P08F94 AC090502.1-202ENST00000515416 966 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
PKHD1P08F94 AP007216.2-201ENST00000562094 299 ntTSL 3 BASIC10.24□□□□□ -0.77
PKHD1P08F94 TNNT1-212ENST00000588981 1163 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
PKHD1P08F94 AC008403.1-201ENST00000595676 443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.24□□□□□ -0.77
PKHD1P08F94 AC073263.1-201ENST00000616370 494 ntTSL 3 BASIC10.24□□□□□ -0.77
PKHD1P08F94 SLCO6A1-202ENST00000389019 2340 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
PKHD1P08F94 ANHX-201ENST00000419717 1765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.24□□□□□ -0.77
PKHD1P08F94 AC139530.2-201ENST00000571730 1922 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.24□□□□□ -0.77
PKHD1P08F94 LEFTY2-201ENST00000366820 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
PKHD1P08F94 COTL1-201ENST00000262428 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
PKHD1P08F94 KRT35-202ENST00000393989 1670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
PKHD1P08F94 LINC00094-204ENST00000599836 1689 ntAPPRIS P5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
PKHD1P08F94 TTLL3-209ENST00000426895 2767 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.24□□□□□ -0.77
PKHD1P08F94 MYO3A-206ENST00000543632 2203 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
PKHD1P08F94 BORCS5-201ENST00000298571 549 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
PKHD1P08F94 KLK1-201ENST00000301420 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
PKHD1P08F94 C9orf24-203ENST00000379126 496 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
PKHD1P08F94 TMEM177-203ENST00000409951 1216 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
PKHD1P08F94 PRSS30P-202ENST00000475030 752 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
PKHD1P08F94 AC239802.2-201ENST00000532137 554 ntTSL 4 BASIC10.24□□□□□ -0.77
PKHD1P08F94 EEF1DP1-201ENST00000585891 896 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
PKHD1P08F94 CHGA-201ENST00000216492 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
PKHD1P08F94 KBTBD2-201ENST00000304056 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
PKHD1P08F94 TRABD-202ENST00000380909 2272 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
PKHD1P08F94 IL12RB2-202ENST00000371000 2454 ntTSL 2 BASIC10.24□□□□□ -0.77
PKHD1P08F94 MON1B-203ENST00000545553 1814 ntTSL 2 BASIC10.24□□□□□ -0.77
PKHD1P08F94 NEU1-206ENST00000375631 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
PKHD1P08F94 SATB2-203ENST00000428695 2135 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
PKHD1P08F94 DMAC2-202ENST00000301183 1134 ntTSL 2 BASIC10.23□□□□□ -0.77
PKHD1P08F94 PRSS55-201ENST00000328655 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
PKHD1P08F94 AL121901.1-201ENST00000419613 366 ntTSL 3 BASIC10.23□□□□□ -0.77
PKHD1P08F94 EEF1DP4-201ENST00000446006 880 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
PKHD1P08F94 TCEAL4-208ENST00000472484 1273 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
PKHD1P08F94 NUP210P1-202ENST00000504322 710 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
PKHD1P08F94 PNOC-204ENST00000522209 1007 ntTSL 2 BASIC10.23□□□□□ -0.77
PKHD1P08F94 TPGS2-209ENST00000589049 1102 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
PKHD1P08F94 ANXA2R-202ENST00000616064 1265 ntAPPRIS P1 BASIC10.23□□□□□ -0.77
PKHD1P08F94 AC138356.1-201ENST00000330539 2086 ntTSL 2 BASIC10.23□□□□□ -0.77
PKHD1P08F94 ADPRHL1-202ENST00000375418 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
PKHD1P08F94 COMT-205ENST00000406520 1339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
PKHD1P08F94 SGSH-203ENST00000570923 1546 ntTSL 2 BASIC10.23□□□□□ -0.77
PKHD1P08F94 ZCCHC17-206ENST00000616393 1534 ntTSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
PKHD1P08F94 ERICH5-201ENST00000318528 1761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
PKHD1P08F94 GPAA1P2-202ENST00000606848 1787 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
PKHD1P08F94 RNFT2-204ENST00000407967 2415 ntTSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
PKHD1P08F94 KLK5-202ENST00000391809 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
PKHD1P08F94 CIDEC-201ENST00000336832 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
PKHD1P08F94 KRTAP10-13P-201ENST00000412914 571 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
PKHD1P08F94 AC074338.1-201ENST00000416825 156 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
PKHD1P08F94 DMAC2-203ENST00000417807 1065 ntTSL 2 BASIC10.23□□□□□ -0.77
PKHD1P08F94 CIDEC-203ENST00000423850 1036 ntTSL 2 BASIC10.23□□□□□ -0.77
PKHD1P08F94 FOXP4-AS1-203ENST00000439386 404 ntTSL 3 BASIC10.23□□□□□ -0.77
PKHD1P08F94 CIDEC-206ENST00000455015 1123 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
PKHD1P08F94 RBM4B-202ENST00000524637 867 ntTSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
PKHD1P08F94 UBXN1-214ENST00000533000 367 ntTSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
PKHD1P08F94 RRN3-205ENST00000563559 2128 ntTSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
PKHD1P08F94 AC009133.1-202ENST00000563806 494 ntTSL 3 BASIC10.23□□□□□ -0.77
PKHD1P08F94 AC073352.2-201ENST00000609385 439 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
PKHD1P08F94 RGS3-211ENST00000462403 2155 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
PKHD1P08F94 SDR16C5-201ENST00000303749 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
PKHD1P08F94 SUSD2-201ENST00000358321 3404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
PKHD1P08F94 NKX2-2-201ENST00000377142 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
PKHD1P08F94 NAP1L5-201ENST00000323061 2321 ntAPPRIS P1 BASIC10.23□□□□□ -0.77
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