Protein–RNA interactions for Protein: P08238

HSP90AB1, Heat shock protein HSP 90-beta, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 724 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HSP90AB1P08238 C9orf24-204ENST00000379127 596 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
HSP90AB1P08238 IDH3B-202ENST00000380851 1230 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
HSP90AB1P08238 STMN1-204ENST00000426559 948 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
HSP90AB1P08238 AL158198.1-201ENST00000449143 380 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
HSP90AB1P08238 RN7SL618P-201ENST00000477850 296 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
HSP90AB1P08238 AC103957.2-201ENST00000521218 510 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
HSP90AB1P08238 AC135586.1-201ENST00000539323 574 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
HSP90AB1P08238 NAA38-207ENST00000576861 556 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
HSP90AB1P08238 ARMC7-205ENST00000584947 445 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
HSP90AB1P08238 AC138474.1-201ENST00000586630 523 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
HSP90AB1P08238 AC026979.3-201ENST00000607315 403 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
HSP90AB1P08238 Metazoa_SRP.112-201ENST00000613101 279 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
HSP90AB1P08238 TEKT2-201ENST00000207457 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
HSP90AB1P08238 AL589702.1-201ENST00000641229 1509 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
HSP90AB1P08238 ADARB1-202ENST00000360697 6604 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
HSP90AB1P08238 RAD1-208ENST00000628399 1678 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
HSP90AB1P08238 AL512652.2-201ENST00000625156 1716 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
HSP90AB1P08238 PANK2-209ENST00000621507 1763 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
HSP90AB1P08238 CFL1-203ENST00000525451 1878 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
HSP90AB1P08238 SPATC1-201ENST00000377470 2007 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
HSP90AB1P08238 IGSF8-205ENST00000614243 2191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
HSP90AB1P08238 B3GNT3-201ENST00000318683 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
HSP90AB1P08238 NEK3-206ENST00000611833 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
HSP90AB1P08238 ARL13B-203ENST00000394222 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
HSP90AB1P08238 BCL11B-202ENST00000357195 7559 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
HSP90AB1P08238 FER1L4-210ENST00000615531 5998 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
HSP90AB1P08238 BHLHE41-201ENST00000242728 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
HSP90AB1P08238 AES-201ENST00000221561 1884 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
HSP90AB1P08238 C2orf40-201ENST00000238044 789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
HSP90AB1P08238 PLEKHA8P1-201ENST00000256692 1839 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
HSP90AB1P08238 DDX28-201ENST00000332395 2169 ntAPPRIS P1 BASIC21.42■■□□□ 1.02
HSP90AB1P08238 MED19-201ENST00000337672 1637 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
HSP90AB1P08238 SYVN1-203ENST00000377190 3052 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
HSP90AB1P08238 ELN-207ENST00000380562 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
HSP90AB1P08238 TOM1-201ENST00000382034 1300 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
HSP90AB1P08238 FBLIM1-206ENST00000441801 1543 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
HSP90AB1P08238 LEPROTL1-204ENST00000518192 847 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
HSP90AB1P08238 API5-211ENST00000534695 560 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
HSP90AB1P08238 AC007541.1-201ENST00000570282 1469 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
HSP90AB1P08238 AC015688.8-201ENST00000577746 656 ntTSL 4 BASIC21.42■■□□□ 1.02
HSP90AB1P08238 IER3IP1-202ENST00000639845 832 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
HSP90AB1P08238 TMEM189-UBE2V1-201ENST00000341698 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
HSP90AB1P08238 MOAP1-202ENST00000556883 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
HSP90AB1P08238 P4HA2-201ENST00000166534 2230 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
HSP90AB1P08238 LRRC38-201ENST00000376085 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
HSP90AB1P08238 C2orf54-203ENST00000402775 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
HSP90AB1P08238 CLEC18B-206ENST00000620745 1847 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
HSP90AB1P08238 TCP1-203ENST00000420894 1671 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
HSP90AB1P08238 TVP23C-201ENST00000225576 1527 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
HSP90AB1P08238 SNRPN-201ENST00000346403 1304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
HSP90AB1P08238 AKR7L-202ENST00000429712 1313 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
HSP90AB1P08238 RTN4RL2-202ENST00000395120 582 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
HSP90AB1P08238 MRPS6-201ENST00000399312 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
HSP90AB1P08238 SERBP1P3-201ENST00000459980 809 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
HSP90AB1P08238 TMEM176A-202ENST00000461345 635 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
HSP90AB1P08238 RAB3A-202ENST00000464076 1253 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
HSP90AB1P08238 AP003068.1-201ENST00000528887 544 ntTSL 4 BASIC21.41■■□□□ 1.02
HSP90AB1P08238 AC061975.2-201ENST00000581722 295 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
HSP90AB1P08238 C17orf62-201ENST00000306645 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
HSP90AB1P08238 C17orf62-203ENST00000434650 2050 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
HSP90AB1P08238 JADE3-204ENST00000614628 4934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
HSP90AB1P08238 PHGDH-202ENST00000369409 1882 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
HSP90AB1P08238 MAPRE1-201ENST00000375571 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
HSP90AB1P08238 AD000671.3-202ENST00000591091 1712 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
HSP90AB1P08238 EML3-201ENST00000278845 3017 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
HSP90AB1P08238 CD1E-212ENST00000368167 1458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
HSP90AB1P08238 SLC12A2-208ENST00000628403 3617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
HSP90AB1P08238 IFNGR1-201ENST00000367739 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
HSP90AB1P08238 SLK-202ENST00000369755 7766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
HSP90AB1P08238 TRIM24-201ENST00000343526 8410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
HSP90AB1P08238 KCMF1-201ENST00000409785 7568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
HSP90AB1P08238 RUNX1-203ENST00000358356 2720 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
HSP90AB1P08238 FGFR4-203ENST00000393648 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
HSP90AB1P08238 MAPT-215ENST00000574436 1326 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
HSP90AB1P08238 EBI3-201ENST00000221847 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
HSP90AB1P08238 TOMM5-201ENST00000321301 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
HSP90AB1P08238 NDUFB8-202ENST00000370320 684 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
HSP90AB1P08238 AC062015.1-201ENST00000423838 1134 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
HSP90AB1P08238 DFFBP1-201ENST00000433250 979 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
HSP90AB1P08238 AC006001.2-201ENST00000448096 393 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
HSP90AB1P08238 LINC01605-204ENST00000522718 1093 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
HSP90AB1P08238 SLC8B1-206ENST00000549069 1058 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
HSP90AB1P08238 NUBP2-208ENST00000565987 1049 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
HSP90AB1P08238 AC012173.1-201ENST00000567942 430 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
HSP90AB1P08238 AC140912.1-201ENST00000577171 1054 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
HSP90AB1P08238 AP005482.2-201ENST00000587889 310 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
HSP90AB1P08238 IFI27-210ENST00000616764 716 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
HSP90AB1P08238 IFI27-213ENST00000620066 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
HSP90AB1P08238 SCP2-201ENST00000371509 1889 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
HSP90AB1P08238 DYRK1B-205ENST00000597639 1806 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
HSP90AB1P08238 UNC13A-205ENST00000551649 6052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
HSP90AB1P08238 EHD2-202ENST00000538399 1766 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
HSP90AB1P08238 IGFBP3-203ENST00000381086 2322 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
HSP90AB1P08238 AL162311.3-201ENST00000555918 2867 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
HSP90AB1P08238 FENDRR-206ENST00000599749 2843 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
HSP90AB1P08238 NFE2-201ENST00000312156 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
HSP90AB1P08238 DIP2A-205ENST00000466639 2711 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
HSP90AB1P08238 USP27X-AS1-201ENST00000437322 2175 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
HSP90AB1P08238 NBL1-210ENST00000615215 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
HSP90AB1P08238 RHCE-201ENST00000294413 1591 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.8 ms