Protein–RNA interactions for Protein: P07948

LYN, Tyrosine-protein kinase Lyn, humanhuman

Predictions only

Length 512 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LYNP07948 AL390719.2-201ENST00000606993 987 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
LYNP07948 MAP3K12-205ENST00000547488 2807 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
LYNP07948 SEPT7-201ENST00000350320 4350 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
LYNP07948 AC009133.1-201ENST00000569981 2449 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
LYNP07948 TMEM41B-204ENST00000528080 3968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
LYNP07948 BAG1-210ENST00000634734 3786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
LYNP07948 STAT6-225ENST00000640254 2037 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
LYNP07948 STOML1-206ENST00000561656 1833 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
LYNP07948 ZNF596-201ENST00000308811 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
LYNP07948 LENG8-208ENST00000610347 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
LYNP07948 NOS1AP-205ENST00000493151 5559 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
LYNP07948 TUSC3-201ENST00000382020 3683 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
LYNP07948 DUSP18-206ENST00000407308 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
LYNP07948 CA12-202ENST00000344366 2744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
LYNP07948 PDE3A-201ENST00000359062 7576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
LYNP07948 KIF1BP-214ENST00000638119 2537 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
LYNP07948 RANBP3-220ENST00000591092 1783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
LYNP07948 SRD5A3-201ENST00000264228 4190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
LYNP07948 PRAMEF20-201ENST00000316412 1597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
LYNP07948 RGS19-202ENST00000395042 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
LYNP07948 SLC9A7-205ENST00000616978 10024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
LYNP07948 YY1AP1-201ENST00000295566 2626 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
LYNP07948 ROR2-202ENST00000375715 2993 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
LYNP07948 EYA2-201ENST00000317304 1540 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
LYNP07948 PRMT2-208ENST00000451211 1878 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
LYNP07948 CRYZL1-202ENST00000361534 2224 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
LYNP07948 TRAPPC3-209ENST00000616395 1336 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
LYNP07948 TRAPPC3-210ENST00000617904 1305 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
LYNP07948 AC097374.2-201ENST00000618617 1306 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
LYNP07948 AZGP1-202ENST00000411734 2027 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
LYNP07948 HSD17B4-206ENST00000504811 2740 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
LYNP07948 IL6R-201ENST00000344086 3217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
LYNP07948 PPM1B-205ENST00000409432 3025 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
LYNP07948 ZNF280D-207ENST00000559237 4902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
LYNP07948 KATNB1-201ENST00000379661 2664 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
LYNP07948 MAP4K5-201ENST00000013125 4354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
LYNP07948 DCTN1-203ENST00000409240 4365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
LYNP07948 Z83836.1-201ENST00000624605 1642 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
LYNP07948 AKAP12-201ENST00000253332 6597 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
LYNP07948 SYP-201ENST00000263233 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
LYNP07948 BAALC-202ENST00000306391 243 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
LYNP07948 LCE1D-201ENST00000326233 430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
LYNP07948 BAALC-204ENST00000330955 222 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
LYNP07948 LCE3C-201ENST00000333881 425 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
LYNP07948 BEX1-201ENST00000372728 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
LYNP07948 AK4P3-201ENST00000418260 669 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
LYNP07948 MRPS24-203ENST00000418740 743 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
LYNP07948 AC007731.5-201ENST00000429594 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
LYNP07948 KRT18P57-201ENST00000443599 1254 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
LYNP07948 FNDC5-205ENST00000496770 837 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
LYNP07948 CCNG1-211ENST00000512163 919 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
LYNP07948 AC103957.2-201ENST00000521218 510 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
LYNP07948 AC012213.1-202ENST00000523422 449 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
LYNP07948 YIPF2-209ENST00000590329 958 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
LYNP07948 AC011511.2-201ENST00000592893 918 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
LYNP07948 HNF4A-208ENST00000609795 1192 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
LYNP07948 EML2-AS1-203ENST00000623430 886 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
LYNP07948 CDC42-203ENST00000400259 2274 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
LYNP07948 AC013726.1-201ENST00000563747 2285 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
LYNP07948 MAN1B1-202ENST00000371589 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
LYNP07948 GPANK1-205ENST00000375906 2793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
LYNP07948 PPP1R16B-202ENST00000373331 6106 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
LYNP07948 CLK2-202ENST00000361168 1934 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
LYNP07948 ARHGAP27P1-BPTFP1-KPNA2P3-201ENST00000578492 2732 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
LYNP07948 MMADHC-203ENST00000428879 1726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
LYNP07948 RUSC1-214ENST00000490373 1700 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
LYNP07948 LINC00996-201ENST00000477392 2043 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
LYNP07948 MARCO-201ENST00000327097 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
LYNP07948 NUP62-212ENST00000597723 1824 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
LYNP07948 SLC25A35-201ENST00000380067 2785 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
LYNP07948 PSMD13-212ENST00000532097 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
LYNP07948 ARHGEF6-202ENST00000370620 4764 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
LYNP07948 MAP2K5-202ENST00000340972 1491 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
LYNP07948 CHTF18-205ENST00000455171 3172 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
LYNP07948 ZC3HAV1-204ENST00000471652 3182 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
LYNP07948 APLNR-203ENST00000611099 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
LYNP07948 CFAP100-201ENST00000352312 2086 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
LYNP07948 PNPLA3-203ENST00000423180 2222 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
LYNP07948 MAP4-202ENST00000360240 5142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
LYNP07948 RABAC1-201ENST00000222008 821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
LYNP07948 CEP76-201ENST00000262127 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
LYNP07948 ABCB8-201ENST00000297504 2487 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
LYNP07948 PHAX-201ENST00000297540 4288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
LYNP07948 CD320-201ENST00000301458 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
LYNP07948 MCRS1-202ENST00000357123 1428 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
LYNP07948 INPP5F-203ENST00000369081 874 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
LYNP07948 AMACR-203ENST00000382072 2919 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
LYNP07948 MLPH-203ENST00000409373 2031 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
LYNP07948 MLPH-204ENST00000410032 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
LYNP07948 API5-202ENST00000420461 2009 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
LYNP07948 AP001059.1-201ENST00000442785 523 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
LYNP07948 AC108025.1-201ENST00000453678 1058 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
LYNP07948 WDR45-218ENST00000473974 1077 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
LYNP07948 RARRES2-205ENST00000482669 563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
LYNP07948 C5orf24-204ENST00000504727 2923 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
LYNP07948 IGHV3-52-201ENST00000519770 353 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
LYNP07948 ANP32AP1-202ENST00000560832 1074 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
LYNP07948 PSMD8-202ENST00000585598 541 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
LYNP07948 RABAC1-208ENST00000601078 728 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
LYNP07948 GLMP-214ENST00000614643 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.3 ms