Protein–RNA interactions for Protein: O60809

PRAMEF10, PRAME family member 10, humanhuman

Predictions only

Length 474 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRAMEF10O60809 MANSC1-202ENST00000535902 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PRAMEF10O60809 SLFNL1-205ENST00000439569 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
PRAMEF10O60809 XKR7-201ENST00000562532 7844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PRAMEF10O60809 DEF6-201ENST00000316637 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PRAMEF10O60809 SENP1-204ENST00000549518 2260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PRAMEF10O60809 CHAD-201ENST00000258969 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PRAMEF10O60809 TXNDC11-202ENST00000356957 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PRAMEF10O60809 ZBTB5-201ENST00000307750 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PRAMEF10O60809 RGS12-203ENST00000344733 5469 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PRAMEF10O60809 LITAF-202ENST00000381810 1527 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PRAMEF10O60809 OSR2-209ENST00000522510 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PRAMEF10O60809 CRTC3-202ENST00000420329 5209 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PRAMEF10O60809 TTLL11-201ENST00000321582 3250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PRAMEF10O60809 WDR90-209ENST00000547944 1672 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PRAMEF10O60809 PKM-216ENST00000565184 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PRAMEF10O60809 INPP5J-213ENST00000620191 2306 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PRAMEF10O60809 LINC00895-201ENST00000629028 1637 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
PRAMEF10O60809 STK39-201ENST00000355999 3820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PRAMEF10O60809 CKS1B-202ENST00000368436 820 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PRAMEF10O60809 LCE1E-201ENST00000368770 1180 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PRAMEF10O60809 ALKBH6-202ENST00000378875 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PRAMEF10O60809 ZDHHC20-IT1-201ENST00000417513 440 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PRAMEF10O60809 SPDYE7P-202ENST00000420373 878 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
PRAMEF10O60809 AC005034.1-201ENST00000426657 489 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
PRAMEF10O60809 AL451067.1-201ENST00000453111 394 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PRAMEF10O60809 AC139713.2-206ENST00000499587 566 ntTSL 4 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PRAMEF10O60809 AC106795.3-201ENST00000511650 547 ntTSL 4 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PRAMEF10O60809 AC123777.1-201ENST00000534827 1247 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PRAMEF10O60809 FLYWCH2-203ENST00000572006 754 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PRAMEF10O60809 AC013467.2-201ENST00000605472 835 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
PRAMEF10O60809 LCN8-205ENST00000612714 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PRAMEF10O60809 MIR6080-201ENST00000617359 66 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
PRAMEF10O60809 AL035252.4-201ENST00000624174 288 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
PRAMEF10O60809 YPEL3-203ENST00000562641 1941 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PRAMEF10O60809 C12orf29-201ENST00000356891 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PRAMEF10O60809 RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 4931 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PRAMEF10O60809 MAN2A2-216ENST00000559717 6704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PRAMEF10O60809 C17orf62-201ENST00000306645 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PRAMEF10O60809 CHCHD3-201ENST00000262570 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PRAMEF10O60809 CD9-203ENST00000382518 1556 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PRAMEF10O60809 AC053503.2-201ENST00000420563 1598 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PRAMEF10O60809 FAM60A-203ENST00000454658 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PRAMEF10O60809 ZNF446-201ENST00000335841 1889 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PRAMEF10O60809 RNF183-203ENST00000441031 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PRAMEF10O60809 SH3BP5-206ENST00000426925 2190 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PRAMEF10O60809 ADGRA1-203ENST00000607359 6004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PRAMEF10O60809 DXO-203ENST00000375356 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PRAMEF10O60809 RPS5-202ENST00000596046 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PRAMEF10O60809 AC006974.1-201ENST00000637928 1501 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PRAMEF10O60809 SART1-201ENST00000312397 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PRAMEF10O60809 PYCR2-201ENST00000343818 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PRAMEF10O60809 TSSK2-201ENST00000399635 1816 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PRAMEF10O60809 STARD3NL-204ENST00000434197 1341 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PRAMEF10O60809 PTGDR2-201ENST00000332539 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PRAMEF10O60809 BCS1L-212ENST00000439945 1483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PRAMEF10O60809 PEX6-202ENST00000304611 3478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PRAMEF10O60809 PTGES3-201ENST00000262033 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PRAMEF10O60809 AL512625.1-201ENST00000305709 2541 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PRAMEF10O60809 CDS1-201ENST00000295887 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PRAMEF10O60809 CLPP-201ENST00000245816 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PRAMEF10O60809 LAT2-201ENST00000275635 1869 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PRAMEF10O60809 FBXO21-201ENST00000330622 2906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PRAMEF10O60809 COPE-202ENST00000349893 948 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PRAMEF10O60809 NRG1-202ENST00000356819 5931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PRAMEF10O60809 WASH6P-202ENST00000359512 1437 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
PRAMEF10O60809 TNNC2-201ENST00000372555 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PRAMEF10O60809 ZSCAN2-205ENST00000379358 906 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PRAMEF10O60809 NDUFAF3-203ENST00000395458 808 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PRAMEF10O60809 CRIP1-203ENST00000409393 677 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PRAMEF10O60809 TMEM176B-205ENST00000450753 1006 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PRAMEF10O60809 AL391335.1-201ENST00000504583 535 ntTSL 4 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PRAMEF10O60809 TSC22D3-213ENST00000506081 956 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PRAMEF10O60809 SYBU-230ENST00000532779 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PRAMEF10O60809 GSTO1-207ENST00000539281 1052 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PRAMEF10O60809 LINC01089-211ENST00000543334 1282 ntTSL 4 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PRAMEF10O60809 AC015712.4-202ENST00000558641 1007 ntTSL 4 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PRAMEF10O60809 AC099482.1-201ENST00000563471 481 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PRAMEF10O60809 AL138918.1-201ENST00000568306 659 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
PRAMEF10O60809 RNF165-204ENST00000587853 2011 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PRAMEF10O60809 YTHDF3-AS1-201ENST00000603538 718 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
PRAMEF10O60809 RAI1-207ENST00000640861 5172 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PRAMEF10O60809 FHL1-207ENST00000394155 2706 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PRAMEF10O60809 TOM1L1-204ENST00000570371 2442 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PRAMEF10O60809 ATXN2-219ENST00000550104 4648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PRAMEF10O60809 FAM49B-202ENST00000517654 1817 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PRAMEF10O60809 HPCAL1-208ENST00000622018 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PRAMEF10O60809 MXD1-201ENST00000264444 5587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PRAMEF10O60809 LDOC1-201ENST00000370526 1381 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PRAMEF10O60809 IGSF8-202ENST00000368086 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PRAMEF10O60809 TCP11L2-201ENST00000299045 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PRAMEF10O60809 CHGA-201ENST00000216492 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PRAMEF10O60809 RAPGEFL1-209ENST00000544503 2079 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PRAMEF10O60809 TLE3-212ENST00000558201 2766 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PRAMEF10O60809 AC091980.2-201ENST00000619056 2775 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PRAMEF10O60809 LAD1-201ENST00000367313 2336 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PRAMEF10O60809 PDXDC1-204ENST00000455313 2183 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PRAMEF10O60809 ORMDL1-203ENST00000392350 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PRAMEF10O60809 NPC1L1-203ENST00000423141 2554 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PRAMEF10O60809 C2CD4C-201ENST00000332235 3129 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PRAMEF10O60809 CACNA1G-202ENST00000354983 8138 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37 ms