Protein–RNA interactions for Protein: O60437

PPL, Periplakin, humanhuman

Predictions only

Length 1,756 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPLO60437 MAGEA2-207ENST00000620710 1947 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
PPLO60437 AL607033.1-201ENST00000623900 1599 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
PPLO60437 TSPEAR-202ENST00000397916 2114 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PPLO60437 AL158154.2-201ENST00000585776 2208 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
PPLO60437 FP565260.3-204ENST00000623795 2238 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
PPLO60437 APOPT1-201ENST00000409074 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PPLO60437 XRCC1-202ENST00000543982 1994 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
PPLO60437 REXO1L1P-202ENST00000608646 1974 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
PPLO60437 SNAP47-AS1-201ENST00000413347 1708 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
PPLO60437 KIF9-205ENST00000432493 633 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PPLO60437 AL118558.1-202ENST00000557242 451 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
PPLO60437 AL160035.1-201ENST00000637583 576 ntTSL 4 BASIC22.63■■□□□ 1.21
PPLO60437 ENOSF1-209ENST00000580982 1397 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
PPLO60437 STX17-205ENST00000525640 2523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
PPLO60437 TCF7-204ENST00000395029 3330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
PPLO60437 RHNO1-209ENST00000618250 2070 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC22.62■■□□□ 1.21
PPLO60437 PES1-202ENST00000354694 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PPLO60437 PCTP-201ENST00000268896 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PPLO60437 CCDC112-205ENST00000506442 2145 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
PPLO60437 DNMT3A-205ENST00000402667 2300 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
PPLO60437 ADGRD2-201ENST00000334810 3244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
PPLO60437 FUT8-213ENST00000557164 2269 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
PPLO60437 APOBEC3A-202ENST00000402255 1478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
PPLO60437 FDFT1-202ENST00000443614 1393 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
PPLO60437 STPG3-201ENST00000388931 1207 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PPLO60437 CSF2RBP1-201ENST00000447905 391 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
PPLO60437 TMEM225B-203ENST00000453227 1041 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
PPLO60437 HRASLS5-206ENST00000540857 3032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PPLO60437 PCBP4-205ENST00000461554 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PPLO60437 KCNQ2-202ENST00000344462 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PPLO60437 TUBA3E-201ENST00000312988 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PPLO60437 FDPS-202ENST00000368356 1431 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
PPLO60437 ZNF619-205ENST00000456778 2192 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
PPLO60437 AC010186.2-201ENST00000575094 2612 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
PPLO60437 SLC2A4-204ENST00000571308 1768 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
PPLO60437 KLC2-201ENST00000316924 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PPLO60437 GOLIM4-201ENST00000309027 2100 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PPLO60437 DNM1-202ENST00000372923 3244 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PPLO60437 AP000787.1-201ENST00000501356 1926 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
PPLO60437 PRKN-201ENST00000338468 1276 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PPLO60437 PRKN-203ENST00000366894 1157 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
PPLO60437 TEX30-203ENST00000376022 828 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
PPLO60437 TSPAN32-204ENST00000381121 999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
PPLO60437 MORN2-204ENST00000409665 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
PPLO60437 AC134915.1-201ENST00000426461 574 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
PPLO60437 AL354761.2-202ENST00000430816 546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
PPLO60437 KRT43P-201ENST00000434019 910 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
PPLO60437 KCNQ1-AS1-201ENST00000440887 1084 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
PPLO60437 METTL21A-209ENST00000448823 869 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
PPLO60437 AC093904.1-201ENST00000474561 455 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
PPLO60437 PTP4A1P2-201ENST00000546033 454 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
PPLO60437 APRT-204ENST00000563655 709 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
PPLO60437 COX6B1-204ENST00000592141 660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
PPLO60437 C9orf50-202ENST00000619117 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PPLO60437 DTX2-206ENST00000430490 2623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PPLO60437 MAP2K6-209ENST00000613873 1509 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PPLO60437 ARFIP1-202ENST00000356064 1302 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PPLO60437 COLQ-206ENST00000603808 1668 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PPLO60437 CBFB-202ENST00000412916 2971 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PPLO60437 ZC3H12A-201ENST00000373087 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PPLO60437 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PPLO60437 ACTG1P3-201ENST00000431775 1114 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
PPLO60437 RFPL4A-201ENST00000434937 1035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
PPLO60437 AC128709.1-201ENST00000445908 600 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
PPLO60437 AC020659.2-202ENST00000512295 513 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
PPLO60437 AC027601.2-201ENST00000571085 805 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
PPLO60437 AC108134.3-202ENST00000571404 1207 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
PPLO60437 AL022328.1-201ENST00000610050 478 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
PPLO60437 LINC02351-201ENST00000614728 289 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
PPLO60437 SNRPD3-201ENST00000215829 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PPLO60437 TCEA2-203ENST00000361317 1427 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
PPLO60437 AC092171.3-201ENST00000610122 2651 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
PPLO60437 MB21D2-201ENST00000392452 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PPLO60437 HSFX1-201ENST00000370416 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PPLO60437 PSMD13-212ENST00000532097 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PPLO60437 SPATS2L-202ENST00000360760 2119 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PPLO60437 PTTG1IP-201ENST00000330938 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PPLO60437 RCC1-202ENST00000373832 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PPLO60437 NAGK-208ENST00000455662 1778 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PPLO60437 CXCL14-202ENST00000512158 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PPLO60437 SEPT8-216ENST00000620483 4335 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
PPLO60437 LINC00928-204ENST00000561201 1123 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PPLO60437 AC007611.1-201ENST00000568150 826 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
PPLO60437 SNN-201ENST00000329565 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PPLO60437 ATG10-202ENST00000355178 1438 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
PPLO60437 IL1RN-202ENST00000354115 1747 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PPLO60437 GRHPR-212ENST00000607784 1704 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
PPLO60437 FLJ38576-201ENST00000623820 2459 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
PPLO60437 BAIAP2-219ENST00000575245 2229 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
PPLO60437 NCOA6-207ENST00000616167 3271 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
PPLO60437 MAGEA2-202ENST00000598543 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
PPLO60437 HAPLN4-201ENST00000291481 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
PPLO60437 NRP1-203ENST00000374821 1988 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
PPLO60437 TLE2-202ENST00000426948 2406 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
PPLO60437 ISM1-201ENST00000262487 2593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
PPLO60437 CGB5-201ENST00000301408 841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
PPLO60437 LCE1E-202ENST00000368771 575 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
PPLO60437 METTL17-202ENST00000382985 1586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
PPLO60437 RPL7P3-201ENST00000441388 714 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
PPLO60437 AC103563.7-201ENST00000448734 478 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53 ms