Protein–RNA interactions for Protein: O43854

EDIL3, EGF-like repeat and discoidin I-like domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 480 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EDIL3O43854 LINC01160-201ENST00000441004 768 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
EDIL3O43854 AC009477.1-201ENST00000452936 217 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
EDIL3O43854 AC027369.6-201ENST00000525520 931 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
EDIL3O43854 TMEM258-204ENST00000537328 575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
EDIL3O43854 LINC01481-203ENST00000549651 883 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
EDIL3O43854 ARMC7-205ENST00000584947 445 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
EDIL3O43854 FAM181B-201ENST00000329203 3924 ntAPPRIS P1 BASIC18.24■□□□□ 0.51
EDIL3O43854 HOXD3-201ENST00000249440 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
EDIL3O43854 NFATC4-218ENST00000554966 2506 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
EDIL3O43854 NFATC4-225ENST00000556169 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
EDIL3O43854 KLF10-202ENST00000395884 3659 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
EDIL3O43854 PARVB-204ENST00000406477 1569 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
EDIL3O43854 SLC9A6-208ENST00000636206 4711 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
EDIL3O43854 GALNT8-202ENST00000433855 5977 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
EDIL3O43854 CBFB-201ENST00000290858 3136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
EDIL3O43854 RHOU-201ENST00000366691 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
EDIL3O43854 TGIF1-201ENST00000330513 1980 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
EDIL3O43854 FGFR1-214ENST00000447712 5900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
EDIL3O43854 PRKCI-201ENST00000295797 4950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
EDIL3O43854 RGS7-203ENST00000366564 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
EDIL3O43854 TAB2-209ENST00000637181 4230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
EDIL3O43854 ATP6AP2-233ENST00000638153 1303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
EDIL3O43854 TMEM222-210ENST00000608611 1511 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
EDIL3O43854 CRTC2-202ENST00000368630 1635 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
EDIL3O43854 LRRC57-204ENST00000563454 2407 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
EDIL3O43854 MYB-203ENST00000341911 3672 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
EDIL3O43854 LEF1-201ENST00000265165 3068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
EDIL3O43854 TMEM127-202ENST00000432959 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
EDIL3O43854 GPR161-204ENST00000367838 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
EDIL3O43854 GLUD2-201ENST00000328078 2493 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
EDIL3O43854 AC018695.7-201ENST00000624587 2492 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
EDIL3O43854 PKP4-AS1-203ENST00000629904 1951 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
EDIL3O43854 IL18BP-204ENST00000393703 1788 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
EDIL3O43854 MAFG-201ENST00000357736 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
EDIL3O43854 BFSP2-201ENST00000302334 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
EDIL3O43854 CAMK2B-208ENST00000395747 1557 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
EDIL3O43854 PRRT3-202ENST00000411976 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
EDIL3O43854 NOMO3-201ENST00000263012 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
EDIL3O43854 CABP5-201ENST00000293255 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
EDIL3O43854 OSTC-201ENST00000361564 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
EDIL3O43854 LINC01273-201ENST00000411453 685 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
EDIL3O43854 AZGP1P1-201ENST00000411909 902 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
EDIL3O43854 OST4-202ENST00000447619 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
EDIL3O43854 TMEM63A-209ENST00000537914 1018 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
EDIL3O43854 AL583722.3-202ENST00000554954 486 ntTSL 4 BASIC18.23■□□□□ 0.51
EDIL3O43854 KLK3-204ENST00000593997 1035 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
EDIL3O43854 AP000347.2-202ENST00000421064 3041 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
EDIL3O43854 EGLN2-207ENST00000593726 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
EDIL3O43854 HYAL1-202ENST00000320295 2324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
EDIL3O43854 CTNND2-201ENST00000304623 5481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
EDIL3O43854 EIF2B4-206ENST00000451130 1633 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
EDIL3O43854 DIABLO-208ENST00000464942 2569 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
EDIL3O43854 PPP1R15A-201ENST00000200453 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
EDIL3O43854 CETN4P-206ENST00000642099 2168 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
EDIL3O43854 ACSM1-204ENST00000520010 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
EDIL3O43854 RASAL3-201ENST00000343625 3293 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
EDIL3O43854 UBXN11-205ENST00000374221 1792 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
EDIL3O43854 GLCCI1-201ENST00000223145 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
EDIL3O43854 CAAP1-201ENST00000333916 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
EDIL3O43854 TAGLN3-202ENST00000393917 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
EDIL3O43854 CDIP1-206ENST00000563507 1463 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
EDIL3O43854 CLN3-229ENST00000567963 1452 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
EDIL3O43854 GDPD3-202ENST00000406256 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
EDIL3O43854 MRPL2-201ENST00000230413 899 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
EDIL3O43854 NMU-201ENST00000264218 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
EDIL3O43854 PRSS55-201ENST00000328655 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
EDIL3O43854 SIVA1-202ENST00000347067 550 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
EDIL3O43854 COMT-209ENST00000449653 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
EDIL3O43854 PTGES3-205ENST00000456859 957 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
EDIL3O43854 AQP6-203ENST00000551733 849 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
EDIL3O43854 CCDC85C-204ENST00000555822 930 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
EDIL3O43854 AC010336.2-201ENST00000564226 506 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
EDIL3O43854 DM1-AS-201ENST00000586251 483 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
EDIL3O43854 NSUN5-203ENST00000428206 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
EDIL3O43854 SIPA1-201ENST00000394224 3628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
EDIL3O43854 KRT27-201ENST00000301656 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
EDIL3O43854 RPS9-207ENST00000441429 1600 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
EDIL3O43854 COL26A1-203ENST00000613501 2970 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
EDIL3O43854 LOXL3-203ENST00000409249 2431 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
EDIL3O43854 SMIM5-201ENST00000375215 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
EDIL3O43854 MANBAL-204ENST00000397151 1503 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
EDIL3O43854 MANBAL-205ENST00000397152 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
EDIL3O43854 ZBTB45P2-201ENST00000452245 1531 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
EDIL3O43854 HNRNPF-204ENST00000443950 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
EDIL3O43854 RASGRP2-201ENST00000354024 2310 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
EDIL3O43854 FAM57B-202ENST00000380495 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
EDIL3O43854 UBL3-201ENST00000380680 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
EDIL3O43854 SIGLEC6-205ENST00000425629 1852 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
EDIL3O43854 ST3GAL6-214ENST00000483910 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
EDIL3O43854 ATP6V0E1-203ENST00000519374 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
EDIL3O43854 TRPM2-208ENST00000621064 1669 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
EDIL3O43854 CXorf38-202ENST00000378421 2380 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
EDIL3O43854 PRKCZ-202ENST00000400921 2294 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
EDIL3O43854 NRXN2-201ENST00000265459 6621 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
EDIL3O43854 LRRFIP2-205ENST00000421276 2522 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
EDIL3O43854 ZP3-204ENST00000416245 1846 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
EDIL3O43854 ZCCHC3-201ENST00000500893 3354 ntAPPRIS P1 BASIC18.21■□□□□ 0.51
EDIL3O43854 BRSK1-202ENST00000326848 2095 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
EDIL3O43854 MAP3K3-202ENST00000361733 3529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
EDIL3O43854 TMEM5-205ENST00000537373 1966 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.3 ms