Protein–RNA interactions for Protein: O15054

KDM6B, Lysine-specific demethylase 6B, humanhuman

Predictions only

Length 1,643 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KDM6BO15054 PSME1-201ENST00000206451 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
KDM6BO15054 UEVLD-201ENST00000300038 995 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
KDM6BO15054 SNHG17-201ENST00000413755 648 ntTSL 3 BASIC24.77■■□□□ 1.56
KDM6BO15054 PEX13-203ENST00000414712 1014 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
KDM6BO15054 SOCS2P1-201ENST00000417727 557 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
KDM6BO15054 DEF8-202ENST00000418391 852 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
KDM6BO15054 C11orf98-202ENST00000525675 405 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
KDM6BO15054 ST7L-207ENST00000369669 1743 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
KDM6BO15054 NMNAT3-203ENST00000413939 1711 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
KDM6BO15054 USP27X-AS1-201ENST00000437322 2175 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
KDM6BO15054 SNX2-213ENST00000514949 2119 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
KDM6BO15054 CPZ-203ENST00000382480 2538 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
KDM6BO15054 TRAF4-201ENST00000262395 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
KDM6BO15054 MSTO2P-201ENST00000314835 1709 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
KDM6BO15054 GGT4P-201ENST00000623672 1708 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
KDM6BO15054 AC012640.1-201ENST00000509915 688 ntTSL 3 BASIC24.76■■□□□ 1.55
KDM6BO15054 RPL8-205ENST00000527914 551 ntTSL 3 BASIC24.76■■□□□ 1.55
KDM6BO15054 TALDO1-203ENST00000528097 1231 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
KDM6BO15054 C19orf70-206ENST00000590389 769 ntTSL 3 BASIC24.76■■□□□ 1.55
KDM6BO15054 NDUFV2P1-201ENST00000596415 907 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
KDM6BO15054 ZNRD1ASP-217ENST00000437417 1497 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
KDM6BO15054 QSOX1-201ENST00000367600 2519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
KDM6BO15054 CTNNAL1-204ENST00000374595 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
KDM6BO15054 UBE2D2-202ENST00000398733 2702 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
KDM6BO15054 TCF7-204ENST00000395029 3330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
KDM6BO15054 MCC-208ENST00000514701 2855 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
KDM6BO15054 SLC25A43-201ENST00000217909 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
KDM6BO15054 TEAD4-203ENST00000397122 1396 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
KDM6BO15054 KLHDC3-202ENST00000326974 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
KDM6BO15054 QRFPR-202ENST00000394427 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
KDM6BO15054 DGKI-202ENST00000424189 4163 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
KDM6BO15054 TFF2-201ENST00000291526 737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
KDM6BO15054 AC007952.2-201ENST00000399091 1176 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
KDM6BO15054 HYAL1-208ENST00000457214 1084 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
KDM6BO15054 RNASEK-C17orf49-201ENST00000547302 900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
KDM6BO15054 HTT-AS1_1.1-201ENST00000612914 230 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
KDM6BO15054 CRTC1-201ENST00000321949 2501 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
KDM6BO15054 PRKACG-201ENST00000377276 1585 ntAPPRIS P1 BASIC24.75■■□□□ 1.55
KDM6BO15054 PACRGL-202ENST00000360916 2073 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
KDM6BO15054 LITAF-202ENST00000381810 1527 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
KDM6BO15054 BVES-202ENST00000336775 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
KDM6BO15054 DGKE-204ENST00000572810 1843 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
KDM6BO15054 NCALD-217ENST00000521599 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
KDM6BO15054 PRSS36-207ENST00000569305 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
KDM6BO15054 MEAF6-202ENST00000373073 603 ntTSL 3 BASIC24.75■■□□□ 1.55
KDM6BO15054 BAATP1-201ENST00000412284 1225 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
KDM6BO15054 PENK-202ENST00000451791 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
KDM6BO15054 AC245884.6-201ENST00000515672 1067 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
KDM6BO15054 NAALADL1-208ENST00000528884 973 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
KDM6BO15054 AC090502.1-201ENST00000549905 748 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
KDM6BO15054 AC090502.1-204ENST00000551210 469 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
KDM6BO15054 NEAT1-203ENST00000601801 487 ntTSL 4 BASIC24.75■■□□□ 1.55
KDM6BO15054 ANAPC2-201ENST00000323927 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
KDM6BO15054 PTTG1IP-201ENST00000330938 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
KDM6BO15054 IDH3G-204ENST00000427365 1526 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
KDM6BO15054 COPS3-212ENST00000539941 1699 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
KDM6BO15054 GPS1-228ENST00000624957 1825 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
KDM6BO15054 CPT2-210ENST00000637252 2739 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
KDM6BO15054 WDR45-201ENST00000322995 1444 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
KDM6BO15054 FCHO1-201ENST00000252771 3118 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
KDM6BO15054 AK1-202ENST00000373156 757 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.74■■□□□ 1.55
KDM6BO15054 HNRNPA1P32-201ENST00000396326 963 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
KDM6BO15054 AC017104.1-201ENST00000415129 720 ntTSL 3 BASIC24.74■■□□□ 1.55
KDM6BO15054 TGIF2-C20orf24-201ENST00000558530 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.74■■□□□ 1.55
KDM6BO15054 AC025259.3-202ENST00000564363 687 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
KDM6BO15054 ANAPC11-215ENST00000578550 599 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
KDM6BO15054 PRCD-204ENST00000586148 630 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
KDM6BO15054 PRCD-210ENST00000592014 462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
KDM6BO15054 AC078925.2-201ENST00000624013 1973 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
KDM6BO15054 WASF1-205ENST00000392587 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
KDM6BO15054 DNM1-202ENST00000372923 3244 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
KDM6BO15054 EML3-212ENST00000494176 2901 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
KDM6BO15054 EML3-216ENST00000529309 2909 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
KDM6BO15054 C17orf62-201ENST00000306645 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
KDM6BO15054 C17orf62-203ENST00000434650 2050 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
KDM6BO15054 CXorf40B-202ENST00000370404 1316 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
KDM6BO15054 CCDC120-203ENST00000536628 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
KDM6BO15054 MAPKAP1-205ENST00000373503 3045 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
KDM6BO15054 ZBTB14-202ENST00000400143 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
KDM6BO15054 SQSTM1-202ENST00000389805 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
KDM6BO15054 PSMB6-201ENST00000270586 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
KDM6BO15054 HIST1H4J-201ENST00000355057 373 ntAPPRIS P1 BASIC24.73■■□□□ 1.55
KDM6BO15054 ARMC12-203ENST00000373869 1111 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
KDM6BO15054 DKFZp779M0652-201ENST00000378779 649 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
KDM6BO15054 MAGEA5-201ENST00000446757 942 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
KDM6BO15054 KRT18P66-201ENST00000452970 1269 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
KDM6BO15054 EVX1-AS-202ENST00000519050 576 ntTSL 4 BASIC24.73■■□□□ 1.55
KDM6BO15054 PAFAH1B3-202ENST00000538771 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
KDM6BO15054 LINC02109-201ENST00000565798 869 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
KDM6BO15054 RAB11B-202ENST00000594216 894 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
KDM6BO15054 LINC01115-203ENST00000606068 577 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
KDM6BO15054 PSMB6-205ENST00000614486 871 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
KDM6BO15054 KLC1-202ENST00000334553 2524 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
KDM6BO15054 ANKRD23-202ENST00000331001 2455 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
KDM6BO15054 SCOC-211ENST00000614192 1959 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
KDM6BO15054 MRPS21-201ENST00000581066 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
KDM6BO15054 RBM47-212ENST00000514014 2419 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
KDM6BO15054 TJP3-201ENST00000539908 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
KDM6BO15054 RFC5-204ENST00000454402 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
KDM6BO15054 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.8 ms