Protein–RNA interactions for Protein: M5A8F1

ERVH48-1, Suppressyn, humanhuman

Predictions only

Length 160 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVH48-1M5A8F1 NDUFA11-201ENST00000308961 539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ERVH48-1M5A8F1 PXMP4-202ENST00000344022 989 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ERVH48-1M5A8F1 AL096814.1-202ENST00000372963 647 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ERVH48-1M5A8F1 RETN-202ENST00000381324 249 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ERVH48-1M5A8F1 NPM2-202ENST00000381530 925 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ERVH48-1M5A8F1 MPV17-208ENST00000405076 603 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ERVH48-1M5A8F1 MTATP6P19-201ENST00000413797 659 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
ERVH48-1M5A8F1 HCG4-201ENST00000418983 998 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
ERVH48-1M5A8F1 AC093459.1-202ENST00000438963 768 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ERVH48-1M5A8F1 AC234783.1-201ENST00000441761 496 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
ERVH48-1M5A8F1 AP001471.1-201ENST00000454245 672 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ERVH48-1M5A8F1 RHOXF1P1-201ENST00000454625 772 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ERVH48-1M5A8F1 MTRF1LP2-201ENST00000506027 1122 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
ERVH48-1M5A8F1 ARL6IP1-202ENST00000546206 1107 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ERVH48-1M5A8F1 AC046168.2-201ENST00000560590 875 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ERVH48-1M5A8F1 AC129507.3-201ENST00000571512 913 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ERVH48-1M5A8F1 AC005253.2-201ENST00000593791 432 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ERVH48-1M5A8F1 KLK15-204ENST00000598239 855 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ERVH48-1M5A8F1 PGPEP1-209ENST00000604499 769 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ERVH48-1M5A8F1 TEX28P1-201ENST00000613479 1221 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
ERVH48-1M5A8F1 SPTSSB-204ENST00000617024 1292 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
ERVH48-1M5A8F1 TEX28P2-201ENST00000617764 1221 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
ERVH48-1M5A8F1 NDUFS7-218ENST00000618074 688 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ERVH48-1M5A8F1 PFAS-212ENST00000625942 396 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ERVH48-1M5A8F1 DDHD1-201ENST00000323669 5503 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ERVH48-1M5A8F1 TXNDC11-201ENST00000283033 3140 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ERVH48-1M5A8F1 APBB1-224ENST00000621678 1907 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ERVH48-1M5A8F1 IQCE-210ENST00000438376 2170 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ERVH48-1M5A8F1 MGME1-201ENST00000377704 1781 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ERVH48-1M5A8F1 PDE1C-202ENST00000396182 2420 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ERVH48-1M5A8F1 NPHP3-201ENST00000337331 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ERVH48-1M5A8F1 PANK4-201ENST00000378466 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ERVH48-1M5A8F1 ENC1-201ENST00000302351 5520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
ERVH48-1M5A8F1 NTRK3-202ENST00000355254 2938 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
ERVH48-1M5A8F1 HSPA1B-201ENST00000375650 2521 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.06
ERVH48-1M5A8F1 TCTN1-204ENST00000397659 1885 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
ERVH48-1M5A8F1 BTBD7P1-201ENST00000447253 1453 ntBASIC15.46■□□□□ 0.06
ERVH48-1M5A8F1 FBXO22-202ENST00000453211 1486 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
ERVH48-1M5A8F1 TUBB-206ENST00000330914 2632 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
ERVH48-1M5A8F1 DENND6B-201ENST00000413817 4939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
ERVH48-1M5A8F1 KCNJ5-201ENST00000338350 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
ERVH48-1M5A8F1 TMEM143-202ENST00000377431 1960 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ERVH48-1M5A8F1 MKRN3-203ENST00000568252 1312 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ERVH48-1M5A8F1 AC053503.2-201ENST00000420563 1598 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ERVH48-1M5A8F1 CACNB3-203ENST00000540990 1814 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ERVH48-1M5A8F1 BTC-201ENST00000395743 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ERVH48-1M5A8F1 OCIAD1-204ENST00000425583 1915 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ERVH48-1M5A8F1 MAP4K3-202ENST00000341681 4271 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ERVH48-1M5A8F1 SVOPL-204ENST00000436657 1420 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ERVH48-1M5A8F1 ST8SIA4-202ENST00000451528 1794 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ERVH48-1M5A8F1 GABRB1-201ENST00000295454 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ERVH48-1M5A8F1 FAM221A-203ENST00000409653 761 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ERVH48-1M5A8F1 PLD3-207ENST00000409735 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ERVH48-1M5A8F1 FAM221A-204ENST00000409994 1136 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ERVH48-1M5A8F1 AC004945.1-201ENST00000416738 983 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
ERVH48-1M5A8F1 HLA-DPB2-205ENST00000435074 1188 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
ERVH48-1M5A8F1 AL121753.1-201ENST00000444717 529 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ERVH48-1M5A8F1 HMGB2-203ENST00000446922 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ERVH48-1M5A8F1 AC093004.1-201ENST00000508850 424 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
ERVH48-1M5A8F1 LINC01220-201ENST00000558575 715 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ERVH48-1M5A8F1 GADD45B-204ENST00000587345 765 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ERVH48-1M5A8F1 AL031055.1-201ENST00000606362 631 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
ERVH48-1M5A8F1 AC133552.6-201ENST00000613406 534 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
ERVH48-1M5A8F1 AC254562.3-201ENST00000626627 631 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ERVH48-1M5A8F1 CKAP4-201ENST00000378026 3093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ERVH48-1M5A8F1 PCGF6-202ENST00000369847 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ERVH48-1M5A8F1 UBL3-201ENST00000380680 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ERVH48-1M5A8F1 MEN1-207ENST00000377326 3150 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ERVH48-1M5A8F1 FUT7-201ENST00000314412 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ERVH48-1M5A8F1 NCCRP1-201ENST00000339852 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ERVH48-1M5A8F1 MIS18BP1-212ENST00000627697 1950 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ERVH48-1M5A8F1 DOCK7-203ENST00000404627 2678 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ERVH48-1M5A8F1 FRMD4A-203ENST00000357447 6821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ERVH48-1M5A8F1 TUFM-201ENST00000313511 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ERVH48-1M5A8F1 GPR158-AS1-201ENST00000449643 2433 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ERVH48-1M5A8F1 PDLIM1-201ENST00000329399 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ERVH48-1M5A8F1 PRRT2-205ENST00000567659 1470 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ERVH48-1M5A8F1 AC106886.4-201ENST00000623557 2502 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
ERVH48-1M5A8F1 ARHGAP33-201ENST00000007510 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ERVH48-1M5A8F1 GGT7-201ENST00000336431 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ERVH48-1M5A8F1 ZDHHC4-205ENST00000396713 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ERVH48-1M5A8F1 AP3S2-216ENST00000617003 1561 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
ERVH48-1M5A8F1 AC026691.1-201ENST00000602502 2017 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
ERVH48-1M5A8F1 LINC02268-202ENST00000515444 1328 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ERVH48-1M5A8F1 FCGRT-201ENST00000221466 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ERVH48-1M5A8F1 AC105202.1-204ENST00000502167 1781 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ERVH48-1M5A8F1 CAPN1-201ENST00000279247 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ERVH48-1M5A8F1 NKIRAS1-207ENST00000437230 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ERVH48-1M5A8F1 RUSC2-202ENST00000455600 5636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ERVH48-1M5A8F1 PDE3B-201ENST00000282096 6076 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ERVH48-1M5A8F1 PSMA1-209ENST00000530457 1527 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ERVH48-1M5A8F1 REXO1L6P-201ENST00000603433 1515 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
ERVH48-1M5A8F1 INTS14-209ENST00000567744 2419 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ERVH48-1M5A8F1 CFAP100-201ENST00000352312 2086 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ERVH48-1M5A8F1 SCLT1-205ENST00000503401 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ERVH48-1M5A8F1 UNC5D-203ENST00000416672 3532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ERVH48-1M5A8F1 CETN4P-206ENST00000642099 2168 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
ERVH48-1M5A8F1 ZDHHC12-201ENST00000372663 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ERVH48-1M5A8F1 IGHV3-23-201ENST00000390609 432 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ERVH48-1M5A8F1 RAC2-203ENST00000405484 842 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.8 ms