Protein–RNA interactions for Protein: K7ER74

APOC4-APOC2, APOC4-APOC2 readthrough (NMD candidate), humanhuman

Predictions only

Length 178 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOC4-APOC2K7ER74 AL035685.1-202ENST00000637341 1688 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
APOC4-APOC2K7ER74 DUSP13-210ENST00000491677 1770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
APOC4-APOC2K7ER74 SNCAIP-202ENST00000261368 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
APOC4-APOC2K7ER74 NAF1-201ENST00000274054 1907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
APOC4-APOC2K7ER74 Z99756.1-201ENST00000458463 1951 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
APOC4-APOC2K7ER74 KDM5C-204ENST00000375401 6031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
APOC4-APOC2K7ER74 NUDT16P1-202ENST00000499077 2208 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
APOC4-APOC2K7ER74 BAIAP2-219ENST00000575245 2229 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
APOC4-APOC2K7ER74 PHKA1-202ENST00000373539 4476 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
APOC4-APOC2K7ER74 PRKCZ-202ENST00000400921 2294 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
APOC4-APOC2K7ER74 RASGRP2-201ENST00000354024 2310 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
APOC4-APOC2K7ER74 CDK11B-208ENST00000629289 2490 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
APOC4-APOC2K7ER74 NPRL3-201ENST00000399953 2784 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
APOC4-APOC2K7ER74 FAM104A-201ENST00000403627 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
APOC4-APOC2K7ER74 ATP6V0E2-AS1-201ENST00000461019 2973 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
APOC4-APOC2K7ER74 YTHDF1-202ENST00000370339 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
APOC4-APOC2K7ER74 KCNA5-201ENST00000252321 2800 ntAPPRIS P1 BASIC16.83■□□□□ 0.28
APOC4-APOC2K7ER74 PF4-201ENST00000296029 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
APOC4-APOC2K7ER74 BRD3-201ENST00000303407 5652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
APOC4-APOC2K7ER74 SLC39A1-202ENST00000356205 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
APOC4-APOC2K7ER74 OSBPL6-203ENST00000357080 2217 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
APOC4-APOC2K7ER74 OCLN-202ENST00000396442 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
APOC4-APOC2K7ER74 SMAGP-202ENST00000398453 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
APOC4-APOC2K7ER74 MIEF1-202ENST00000402881 2269 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
APOC4-APOC2K7ER74 ZNF382-202ENST00000423582 2657 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
APOC4-APOC2K7ER74 HHIP-202ENST00000434550 1770 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
APOC4-APOC2K7ER74 AC131097.3-202ENST00000439270 331 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
APOC4-APOC2K7ER74 SMN2-210ENST00000511812 867 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
APOC4-APOC2K7ER74 ARFGAP1-210ENST00000519273 3176 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
APOC4-APOC2K7ER74 REM2-202ENST00000536884 1331 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
APOC4-APOC2K7ER74 SPATA21-205ENST00000540400 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
APOC4-APOC2K7ER74 CCT7-216ENST00000540468 1674 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
APOC4-APOC2K7ER74 BLOC1S1-201ENST00000547076 837 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
APOC4-APOC2K7ER74 AK2-210ENST00000548033 936 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
APOC4-APOC2K7ER74 CUX1-213ENST00000549414 4452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
APOC4-APOC2K7ER74 PDPK2P-202ENST00000562415 1191 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
APOC4-APOC2K7ER74 CDIP1-209ENST00000567695 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
APOC4-APOC2K7ER74 AC009133.1-203ENST00000569039 589 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
APOC4-APOC2K7ER74 AC011247.3-202ENST00000605062 570 ntTSL 4 BASIC16.83■□□□□ 0.28
APOC4-APOC2K7ER74 AL590999.1-203ENST00000606829 542 ntTSL 4 BASIC16.83■□□□□ 0.28
APOC4-APOC2K7ER74 FAM83A-202ENST00000518448 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
APOC4-APOC2K7ER74 SOCS7-201ENST00000612932 7857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
APOC4-APOC2K7ER74 KIFC3-206ENST00000541240 3047 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
APOC4-APOC2K7ER74 PSMD9-201ENST00000261817 2307 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
APOC4-APOC2K7ER74 ITGA7-202ENST00000347027 4084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
APOC4-APOC2K7ER74 HTR1B-201ENST00000369947 2021 ntAPPRIS P1 BASIC16.82■□□□□ 0.28
APOC4-APOC2K7ER74 CLPTM1L-216ENST00000630539 2032 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
APOC4-APOC2K7ER74 C10orf107-201ENST00000330194 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
APOC4-APOC2K7ER74 CRY1-201ENST00000008527 3267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
APOC4-APOC2K7ER74 ACOT7-204ENST00000377855 1614 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
APOC4-APOC2K7ER74 FAM60A-203ENST00000454658 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
APOC4-APOC2K7ER74 FHAD1-205ENST00000375997 1459 ntTSL 3 BASIC16.82■□□□□ 0.28
APOC4-APOC2K7ER74 VOPP1-207ENST00000428648 2866 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
APOC4-APOC2K7ER74 BACE1-211ENST00000528053 4083 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
APOC4-APOC2K7ER74 SATB1-AS1-201ENST00000414198 737 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
APOC4-APOC2K7ER74 MMP24-AS1-209ENST00000456790 712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
APOC4-APOC2K7ER74 CMPK1-205ENST00000471289 816 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
APOC4-APOC2K7ER74 MKNK2-212ENST00000591588 631 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
APOC4-APOC2K7ER74 GDF5-201ENST00000374369 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
APOC4-APOC2K7ER74 AC068831.3-201ENST00000553321 1858 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
APOC4-APOC2K7ER74 JMY-201ENST00000396137 9042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
APOC4-APOC2K7ER74 MC1R-204ENST00000639847 2567 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
APOC4-APOC2K7ER74 CACNA1A-253ENST00000637927 6847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
APOC4-APOC2K7ER74 QRFP-202ENST00000623824 1658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.81■□□□□ 0.28
APOC4-APOC2K7ER74 TFPI2-201ENST00000222543 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
APOC4-APOC2K7ER74 KIF25-202ENST00000354419 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
APOC4-APOC2K7ER74 WDR70-202ENST00000504564 1526 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
APOC4-APOC2K7ER74 TNFSF8-203ENST00000618336 1523 ntTSL 3 BASIC16.81■□□□□ 0.28
APOC4-APOC2K7ER74 AL589702.1-201ENST00000641229 1509 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
APOC4-APOC2K7ER74 AP000253.1-201ENST00000449339 2233 ntTSL 3 BASIC16.81■□□□□ 0.28
APOC4-APOC2K7ER74 FBP1-201ENST00000375326 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
APOC4-APOC2K7ER74 KCNC2-209ENST00000550433 2931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
APOC4-APOC2K7ER74 BRF1-206ENST00000446501 2858 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
APOC4-APOC2K7ER74 RIMS3-201ENST00000372683 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
APOC4-APOC2K7ER74 CNOT6-207ENST00000618123 6250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
APOC4-APOC2K7ER74 TUBA4B-203ENST00000490341 1380 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
APOC4-APOC2K7ER74 SMIM25-203ENST00000425497 2010 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
APOC4-APOC2K7ER74 BEND4-202ENST00000504360 8692 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
APOC4-APOC2K7ER74 STK24-203ENST00000397517 4578 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
APOC4-APOC2K7ER74 ZADH2-201ENST00000322342 7732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
APOC4-APOC2K7ER74 PDXK-202ENST00000327574 2583 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
APOC4-APOC2K7ER74 HAUS4P1-201ENST00000406739 1145 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
APOC4-APOC2K7ER74 HNRNPA1P28-201ENST00000424481 961 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
APOC4-APOC2K7ER74 FDX1P1-201ENST00000449115 551 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
APOC4-APOC2K7ER74 AC074386.1-202ENST00000463561 864 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
APOC4-APOC2K7ER74 EFCAB1-209ENST00000523092 648 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
APOC4-APOC2K7ER74 SPATA33-208ENST00000568929 1264 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
APOC4-APOC2K7ER74 AC002347.1-201ENST00000569543 541 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
APOC4-APOC2K7ER74 AC011530.1-201ENST00000593999 558 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
APOC4-APOC2K7ER74 BABAM1-206ENST00000595632 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
APOC4-APOC2K7ER74 AL512343.2-201ENST00000609423 490 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
APOC4-APOC2K7ER74 IRF1-211ENST00000613424 821 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
APOC4-APOC2K7ER74 AC247036.6-201ENST00000632950 410 ntAPPRIS P1 BASIC16.81■□□□□ 0.28
APOC4-APOC2K7ER74 ARHGEF4-205ENST00000409359 5489 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
APOC4-APOC2K7ER74 MFSD1-203ENST00000415822 2423 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
APOC4-APOC2K7ER74 ZDHHC24-201ENST00000310442 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
APOC4-APOC2K7ER74 NUS1-201ENST00000368494 4676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
APOC4-APOC2K7ER74 CHMP1A-202ENST00000535997 2295 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
APOC4-APOC2K7ER74 ADAMTS13-206ENST00000371929 4934 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
APOC4-APOC2K7ER74 SHTN1-202ENST00000355371 5361 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.2 ms