Protein–RNA interactions for Protein: A2RRP1

NBAS, Neuroblastoma-amplified sequence, humanhuman

Predictions only

Length 2,371 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NBASA2RRP1 NOMO1-207ENST00000610363 3765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
NBASA2RRP1 FOS-208ENST00000555686 1496 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
NBASA2RRP1 RIMBP3-201ENST00000619918 6105 ntAPPRIS P1 BASIC14.5□□□□□ -0.09
NBASA2RRP1 SPIN2A-201ENST00000374906 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
NBASA2RRP1 KCNH3-201ENST00000257981 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
NBASA2RRP1 RPH3A-203ENST00000543106 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
NBASA2RRP1 AGRP-201ENST00000290953 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
NBASA2RRP1 NUDT1-205ENST00000397048 783 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
NBASA2RRP1 AC053503.1-201ENST00000429882 519 ntTSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
NBASA2RRP1 RPS24-203ENST00000435275 656 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
NBASA2RRP1 YBX1P6-201ENST00000442962 1002 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
NBASA2RRP1 AC104596.2-201ENST00000512793 793 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
NBASA2RRP1 AC018653.3-202ENST00000538062 735 ntTSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
NBASA2RRP1 THAP4-206ENST00000612200 969 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
NBASA2RRP1 RPS24-214ENST00000613865 538 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
NBASA2RRP1 ELAVL2-208ENST00000544538 3789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
NBASA2RRP1 AP003680.1-201ENST00000598970 3660 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
NBASA2RRP1 MUL1-201ENST00000264198 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
NBASA2RRP1 ZNF500-202ENST00000545009 2440 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
NBASA2RRP1 TTC19-201ENST00000261647 3002 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
NBASA2RRP1 TRAPPC11-201ENST00000334690 4552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
NBASA2RRP1 SLC25A23-202ENST00000301454 3425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
NBASA2RRP1 EWSR1-208ENST00000414183 2189 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
NBASA2RRP1 MRGPRX3-201ENST00000396275 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
NBASA2RRP1 MBD1-207ENST00000398488 1512 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
NBASA2RRP1 TMEM25-202ENST00000354064 1965 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
NBASA2RRP1 PKN3-201ENST00000291906 3375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
NBASA2RRP1 SMTNL2-201ENST00000338859 1919 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
NBASA2RRP1 RALGPS1-208ENST00000424082 2362 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
NBASA2RRP1 HARS2-202ENST00000448069 1426 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
NBASA2RRP1 H2AFY-202ENST00000312469 1859 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
NBASA2RRP1 SEPT2-208ENST00000407971 3267 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
NBASA2RRP1 KIAA1211L-201ENST00000397899 3907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
NBASA2RRP1 KLK6-202ENST00000376851 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
NBASA2RRP1 TEX13B-201ENST00000302917 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
NBASA2RRP1 MRPL55-202ENST00000336300 722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
NBASA2RRP1 MRPL55-206ENST00000366732 722 ntTSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
NBASA2RRP1 TEN1-201ENST00000397640 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
NBASA2RRP1 AC104457.1-201ENST00000401024 814 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
NBASA2RRP1 NEU3-202ENST00000526068 431 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
NBASA2RRP1 FGFR1OP2-206ENST00000546072 956 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
NBASA2RRP1 ASB7-203ENST00000558747 2133 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
NBASA2RRP1 OIP5-AS1-209ENST00000561226 775 ntTSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
NBASA2RRP1 LINC00854-216ENST00000636331 718 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
NBASA2RRP1 EHD3-201ENST00000322054 4636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
NBASA2RRP1 PPFIBP2-201ENST00000299492 3557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
NBASA2RRP1 CES3-203ENST00000543856 3178 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
NBASA2RRP1 FUT5-201ENST00000252675 1916 ntAPPRIS P1 BASIC14.49□□□□□ -0.09
NBASA2RRP1 UAP1-204ENST00000367926 2294 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
NBASA2RRP1 DNAJA3-203ENST00000431375 2294 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
NBASA2RRP1 TRPV4-208ENST00000544971 2295 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
NBASA2RRP1 PARD3-206ENST00000374776 3389 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
NBASA2RRP1 PPP3CA-207ENST00000512215 4007 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
NBASA2RRP1 P2RX6-201ENST00000401443 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
NBASA2RRP1 OR2C3-203ENST00000617752 2481 ntAPPRIS P1 BASIC14.49□□□□□ -0.09
NBASA2RRP1 LMLN-204ENST00000420910 2423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
NBASA2RRP1 PTP4A3-202ENST00000349124 2710 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
NBASA2RRP1 HILPDA-201ENST00000257696 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
NBASA2RRP1 ATP6AP2-233ENST00000638153 1303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
NBASA2RRP1 ZNF213-202ENST00000416391 2996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
NBASA2RRP1 ANAPC2-201ENST00000323927 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
NBASA2RRP1 MED19-201ENST00000337672 1637 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
NBASA2RRP1 FPGS-201ENST00000373225 2278 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
NBASA2RRP1 VEGFA-205ENST00000372067 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
NBASA2RRP1 AC036164.1-201ENST00000570544 333 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
NBASA2RRP1 AC025048.3-201ENST00000590609 569 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
NBASA2RRP1 YIF1B-214ENST00000591784 940 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
NBASA2RRP1 AC011466.1-201ENST00000595201 566 ntTSL 4 BASIC14.49□□□□□ -0.09
NBASA2RRP1 SCGB1C2-201ENST00000595228 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
NBASA2RRP1 SLC22A4-201ENST00000200652 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
NBASA2RRP1 VPS54-201ENST00000272322 3463 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
NBASA2RRP1 OBSL1-203ENST00000373876 5503 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
NBASA2RRP1 ETV7-201ENST00000339796 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
NBASA2RRP1 WRAP53-203ENST00000431639 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
NBASA2RRP1 WRAP53-204ENST00000457584 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
NBASA2RRP1 TSNARE1-204ENST00000519651 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
NBASA2RRP1 YKT6-201ENST00000223369 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
NBASA2RRP1 C17orf62-201ENST00000306645 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
NBASA2RRP1 C17orf62-203ENST00000434650 2050 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
NBASA2RRP1 NFE2-202ENST00000435572 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
NBASA2RRP1 TRIL-201ENST00000539664 4935 ntAPPRIS P1 BASIC14.49□□□□□ -0.09
NBASA2RRP1 ZBTB5-201ENST00000307750 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
NBASA2RRP1 PNMA3-202ENST00000593810 1432 ntAPPRIS P1 BASIC14.49□□□□□ -0.09
NBASA2RRP1 SLC7A5-201ENST00000261622 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
NBASA2RRP1 C18orf63-201ENST00000579455 5127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
NBASA2RRP1 ULBP2-201ENST00000367351 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
NBASA2RRP1 SUZ12-204ENST00000580398 3977 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
NBASA2RRP1 EXOC5-201ENST00000340918 2632 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
NBASA2RRP1 ZDHHC4-205ENST00000396713 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
NBASA2RRP1 SIPA1-201ENST00000394224 3628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
NBASA2RRP1 THOC5-202ENST00000397871 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
NBASA2RRP1 ANKRD35-202ENST00000544626 3093 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
NBASA2RRP1 ITPA-201ENST00000380113 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
NBASA2RRP1 ZG16B-201ENST00000382280 831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
NBASA2RRP1 ATP5D-202ENST00000395633 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
NBASA2RRP1 WDR53-204ENST00000433160 887 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
NBASA2RRP1 AC009163.1-201ENST00000530512 573 ntTSL 4 BASIC14.48□□□□□ -0.09
NBASA2RRP1 ACTG1P17-201ENST00000558391 1119 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
NBASA2RRP1 AC010328.2-201ENST00000597698 1111 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
NBASA2RRP1 CR381653.1-201ENST00000622961 812 ntTSL 3 BASIC14.48□□□□□ -0.09
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