Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5X2

SNX8, Sorting nexin-8, humanhuman

Predictions only

Length 465 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX8Q9Y5X2 TPD52L2-201ENST00000217121 2362 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
SNX8Q9Y5X2 TVP23B-201ENST00000307767 2064 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
SNX8Q9Y5X2 ACP5-212ENST00000592828 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
SNX8Q9Y5X2 MARK3-204ENST00000416682 2969 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
SNX8Q9Y5X2 AFAP1-201ENST00000358461 7516 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
SNX8Q9Y5X2 TXNRD2-214ENST00000491939 2238 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
SNX8Q9Y5X2 GATA4-201ENST00000335135 3414 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
SNX8Q9Y5X2 SPATC1-201ENST00000377470 2007 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
SNX8Q9Y5X2 ORMDL1-203ENST00000392350 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
SNX8Q9Y5X2 ABHD10-201ENST00000273359 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
SNX8Q9Y5X2 CALB2-202ENST00000349553 1373 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
SNX8Q9Y5X2 MICA-209ENST00000449934 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
SNX8Q9Y5X2 STAT5B-201ENST00000293328 5103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
SNX8Q9Y5X2 KLF11-201ENST00000305883 4030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
SNX8Q9Y5X2 SLC27A5-201ENST00000263093 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
SNX8Q9Y5X2 CUL3-202ENST00000344951 6592 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
SNX8Q9Y5X2 WNT10B-203ENST00000407467 1802 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
SNX8Q9Y5X2 NDUFB9-201ENST00000276689 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
SNX8Q9Y5X2 FGF8-203ENST00000346714 694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
SNX8Q9Y5X2 OLFM1-207ENST00000371801 568 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
SNX8Q9Y5X2 AL049795.1-201ENST00000373604 642 ntTSL 3 BASIC15.67■□□□□ 0.1
SNX8Q9Y5X2 ODF3B-204ENST00000405135 917 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
SNX8Q9Y5X2 MCFD2-208ENST00000409973 821 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
SNX8Q9Y5X2 NTMT1-207ENST00000482347 1072 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
SNX8Q9Y5X2 AP000688.1-201ENST00000535199 1221 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
SNX8Q9Y5X2 AL162171.1-201ENST00000556328 718 ntTSL 3 BASIC15.67■□□□□ 0.1
SNX8Q9Y5X2 ZFPM1-203ENST00000562437 502 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
SNX8Q9Y5X2 MIR4751-201ENST00000578027 74 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
SNX8Q9Y5X2 AC020909.1-201ENST00000599632 1265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
SNX8Q9Y5X2 AL031008.1-201ENST00000619963 541 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
SNX8Q9Y5X2 AC117500.6-201ENST00000624871 588 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
SNX8Q9Y5X2 ATE1-209ENST00000543447 4826 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
SNX8Q9Y5X2 SLC6A9-204ENST00000372307 2162 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
SNX8Q9Y5X2 AL512625.3-203ENST00000445604 1602 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
SNX8Q9Y5X2 AC004233.2-201ENST00000573315 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
SNX8Q9Y5X2 CASR-202ENST00000498619 5009 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
SNX8Q9Y5X2 SMIM10-201ENST00000330288 1536 ntAPPRIS P1 BASIC15.67■□□□□ 0.1
SNX8Q9Y5X2 HOXD3-201ENST00000249440 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
SNX8Q9Y5X2 PCGF3-213ENST00000620529 1899 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
SNX8Q9Y5X2 FBXL5-201ENST00000341285 3385 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
SNX8Q9Y5X2 PCGF1-201ENST00000233630 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
SNX8Q9Y5X2 GPAA1P2-202ENST00000606848 1787 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
SNX8Q9Y5X2 KIF25-201ENST00000351261 1326 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
SNX8Q9Y5X2 CGREF1-206ENST00000405600 1346 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC15.67■□□□□ 0.1
SNX8Q9Y5X2 CDH15-201ENST00000289746 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
SNX8Q9Y5X2 NFIX-210ENST00000588228 1692 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
SNX8Q9Y5X2 CCDC83-201ENST00000280245 2358 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
SNX8Q9Y5X2 PRICKLE1-211ENST00000639566 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
SNX8Q9Y5X2 FOSL2-201ENST00000264716 6708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
SNX8Q9Y5X2 YARS-201ENST00000373477 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
SNX8Q9Y5X2 CBSL-201ENST00000398168 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
SNX8Q9Y5X2 WIPF3-202ENST00000409123 3491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
SNX8Q9Y5X2 DHRS1-201ENST00000288111 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
SNX8Q9Y5X2 AFF2-204ENST00000370458 1488 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
SNX8Q9Y5X2 SLC2A13-201ENST00000280871 7003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
SNX8Q9Y5X2 MFSD1-203ENST00000415822 2423 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
SNX8Q9Y5X2 ABCB6-201ENST00000265316 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
SNX8Q9Y5X2 ZFAND5-204ENST00000376960 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
SNX8Q9Y5X2 AL353997.2-201ENST00000579352 4955 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
SNX8Q9Y5X2 DIS3-202ENST00000377780 5232 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
SNX8Q9Y5X2 FANCA-203ENST00000389302 1641 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
SNX8Q9Y5X2 FADS3-207ENST00000527697 1640 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
SNX8Q9Y5X2 CNST-203ENST00000366513 5126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
SNX8Q9Y5X2 PPP1R26-206ENST00000605660 4502 ntAPPRIS P1 BASIC15.66■□□□□ 0.1
SNX8Q9Y5X2 MIR600HG-201ENST00000449175 5984 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
SNX8Q9Y5X2 TM9SF1-201ENST00000261789 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
SNX8Q9Y5X2 SLC22A12-201ENST00000336464 1854 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
SNX8Q9Y5X2 MFSD13A-202ENST00000369931 823 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
SNX8Q9Y5X2 HUS1B-201ENST00000380907 1025 ntAPPRIS P1 BASIC15.66■□□□□ 0.1
SNX8Q9Y5X2 ISPD-202ENST00000407010 5524 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
SNX8Q9Y5X2 SLC4A1APP2-201ENST00000424054 1259 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
SNX8Q9Y5X2 AC091180.3-201ENST00000506504 963 ntTSL 3 BASIC15.66■□□□□ 0.1
SNX8Q9Y5X2 AL356056.2-201ENST00000506914 669 ntTSL 4 BASIC15.66■□□□□ 0.1
SNX8Q9Y5X2 EEF1E1-205ENST00000507463 654 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
SNX8Q9Y5X2 AL160237.2-201ENST00000556165 472 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
SNX8Q9Y5X2 IFT20-215ENST00000585313 852 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC15.66■□□□□ 0.1
SNX8Q9Y5X2 TBC1D3D-201ENST00000616101 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
SNX8Q9Y5X2 AL773604.1-201ENST00000617417 272 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
SNX8Q9Y5X2 TBC1D3K-201ENST00000620247 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
SNX8Q9Y5X2 AC012569.1-201ENST00000591191 1524 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
SNX8Q9Y5X2 AP000487.1-202ENST00000500185 2602 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
SNX8Q9Y5X2 NPR3-203ENST00000415167 1753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
SNX8Q9Y5X2 NBEA-203ENST00000379939 10738 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
SNX8Q9Y5X2 CD72-204ENST00000396757 2035 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
SNX8Q9Y5X2 IL11-201ENST00000264563 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
SNX8Q9Y5X2 C16orf89-202ENST00000472572 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
SNX8Q9Y5X2 CBX3P2-201ENST00000579647 1429 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
SNX8Q9Y5X2 FUT5-201ENST00000252675 1916 ntAPPRIS P1 BASIC15.66■□□□□ 0.1
SNX8Q9Y5X2 SERF2-203ENST00000381359 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
SNX8Q9Y5X2 OSGIN1-203ENST00000393306 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
SNX8Q9Y5X2 WASHC2C-208ENST00000537517 4417 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
SNX8Q9Y5X2 GPR176-205ENST00000561100 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
SNX8Q9Y5X2 SGO1-203ENST00000412997 2587 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
SNX8Q9Y5X2 DGAT2-202ENST00000376262 2324 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
SNX8Q9Y5X2 PAK2-201ENST00000327134 6139 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
SNX8Q9Y5X2 RASA4-204ENST00000462172 2634 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
SNX8Q9Y5X2 PKD1L2-209ENST00000531391 1488 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
SNX8Q9Y5X2 PRKAG1-217ENST00000552212 1497 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
SNX8Q9Y5X2 ORMDL3-201ENST00000304046 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
SNX8Q9Y5X2 AC100830.1-201ENST00000560387 1609 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.4 ms