Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5B6

PAXBP1, PAX3- and PAX7-binding protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 917 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PAXBP1Q9Y5B6 RRM1-214ENST00000534285 2075 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
PAXBP1Q9Y5B6 CLDN15-208ENST00000611078 1509 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
PAXBP1Q9Y5B6 DMPK-202ENST00000343373 3227 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
PAXBP1Q9Y5B6 POU2F2-207ENST00000529067 2657 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
PAXBP1Q9Y5B6 APP-204ENST00000357903 3543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
PAXBP1Q9Y5B6 MCRIP2-201ENST00000307650 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
PAXBP1Q9Y5B6 FOXB1-201ENST00000396057 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
PAXBP1Q9Y5B6 DMKN-206ENST00000418261 1257 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
PAXBP1Q9Y5B6 TSTD3-201ENST00000452647 962 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
PAXBP1Q9Y5B6 BMF-207ENST00000559701 630 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
PAXBP1Q9Y5B6 FAM220A-205ENST00000578372 207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
PAXBP1Q9Y5B6 KRT85-201ENST00000257901 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
PAXBP1Q9Y5B6 IER5-201ENST00000367577 4188 ntAPPRIS P1 BASIC18.15■□□□□ 0.5
PAXBP1Q9Y5B6 AC009237.3-202ENST00000608013 3042 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
PAXBP1Q9Y5B6 ASCL1-201ENST00000266744 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
PAXBP1Q9Y5B6 KCNS1-201ENST00000306117 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
PAXBP1Q9Y5B6 SLC16A3-211ENST00000581287 4830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
PAXBP1Q9Y5B6 ARHGAP9-203ENST00000424809 2569 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
PAXBP1Q9Y5B6 PAN3-AS1-201ENST00000563843 1351 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
PAXBP1Q9Y5B6 MARVELD1-201ENST00000285605 3221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
PAXBP1Q9Y5B6 ERG28-201ENST00000256319 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
PAXBP1Q9Y5B6 BMP1-201ENST00000306349 2626 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
PAXBP1Q9Y5B6 APBA2-205ENST00000558330 3349 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
PAXBP1Q9Y5B6 OR4D1-202ENST00000641449 4925 ntAPPRIS P1 BASIC18.15■□□□□ 0.5
PAXBP1Q9Y5B6 VIPR2-202ENST00000377633 1491 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.5
PAXBP1Q9Y5B6 CYB561A3-203ENST00000447532 1803 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.5
PAXBP1Q9Y5B6 AC112504.1-201ENST00000623415 1841 ntBASIC18.14■□□□□ 0.5
PAXBP1Q9Y5B6 TMEM101-201ENST00000206380 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
PAXBP1Q9Y5B6 HCK-209ENST00000538448 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
PAXBP1Q9Y5B6 CD9-203ENST00000382518 1556 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
PAXBP1Q9Y5B6 HNF1B-207ENST00000621123 1971 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
PAXBP1Q9Y5B6 ZHX1-C8orf76-201ENST00000357082 1257 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
PAXBP1Q9Y5B6 KCNAB2-205ENST00000378092 1202 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
PAXBP1Q9Y5B6 KRTCAP3-202ENST00000407293 942 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
PAXBP1Q9Y5B6 MRPL21-208ENST00000567045 932 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
PAXBP1Q9Y5B6 BIRC5-207ENST00000590449 568 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
PAXBP1Q9Y5B6 ZSCAN1-203ENST00000601162 813 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
PAXBP1Q9Y5B6 PTENP1-AS-201ENST00000627688 873 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
PAXBP1Q9Y5B6 ZNF57-201ENST00000306908 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
PAXBP1Q9Y5B6 EED-202ENST00000327320 2033 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
PAXBP1Q9Y5B6 ZNF57-205ENST00000614108 2002 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
PAXBP1Q9Y5B6 TIGAR-201ENST00000179259 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
PAXBP1Q9Y5B6 IRF1-202ENST00000405885 2061 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
PAXBP1Q9Y5B6 REPIN1-201ENST00000397281 3292 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
PAXBP1Q9Y5B6 SERPINE2-202ENST00000409304 2161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
PAXBP1Q9Y5B6 CCDC28B-202ENST00000421922 1415 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
PAXBP1Q9Y5B6 AC016757.1-205ENST00000470346 1888 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
PAXBP1Q9Y5B6 CCDC183-AS1-201ENST00000414656 2386 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
PAXBP1Q9Y5B6 SH2D6-202ENST00000389938 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
PAXBP1Q9Y5B6 RGS19-202ENST00000395042 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
PAXBP1Q9Y5B6 PCK2-203ENST00000545054 2505 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
PAXBP1Q9Y5B6 SOX14-201ENST00000306087 2055 ntAPPRIS P1 BASIC18.13■□□□□ 0.49
PAXBP1Q9Y5B6 NDRG2-207ENST00000397847 2084 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
PAXBP1Q9Y5B6 FADS3-207ENST00000527697 1640 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
PAXBP1Q9Y5B6 PCDHA6-203ENST00000529310 5374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
PAXBP1Q9Y5B6 AC006486.2-201ENST00000624246 2199 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
PAXBP1Q9Y5B6 FBXO44-204ENST00000376762 1734 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
PAXBP1Q9Y5B6 TMEM14A-201ENST00000211314 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
PAXBP1Q9Y5B6 NDUFS7-201ENST00000233627 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
PAXBP1Q9Y5B6 ZNF746-201ENST00000340622 3806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
PAXBP1Q9Y5B6 CMTM2-202ENST00000379486 904 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
PAXBP1Q9Y5B6 FAM3A-205ENST00000393572 1041 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
PAXBP1Q9Y5B6 DUX4L17-201ENST00000557360 1267 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
PAXBP1Q9Y5B6 ANKRD34C-AS1-203ENST00000559225 528 ntTSL 4 BASIC18.13■□□□□ 0.49
PAXBP1Q9Y5B6 AC092725.1-201ENST00000565783 499 ntTSL 4 BASIC18.13■□□□□ 0.49
PAXBP1Q9Y5B6 MIR22HG-204ENST00000571595 767 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
PAXBP1Q9Y5B6 THRA-203ENST00000450525 4895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
PAXBP1Q9Y5B6 TFAP2C-201ENST00000201031 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
PAXBP1Q9Y5B6 PHKG2-204ENST00000563588 5539 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
PAXBP1Q9Y5B6 TRAPPC3-209ENST00000616395 1336 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
PAXBP1Q9Y5B6 TRAPPC3-210ENST00000617904 1305 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
PAXBP1Q9Y5B6 PIPOX-201ENST00000323372 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
PAXBP1Q9Y5B6 IMPDH1-202ENST00000348127 2479 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
PAXBP1Q9Y5B6 ARMC5-204ENST00000538189 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
PAXBP1Q9Y5B6 C16orf70-208ENST00000569600 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
PAXBP1Q9Y5B6 NRXN1-204ENST00000401669 5870 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
PAXBP1Q9Y5B6 NTRK2-205ENST00000376208 8178 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
PAXBP1Q9Y5B6 CRB3-203ENST00000598494 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
PAXBP1Q9Y5B6 KCNT1-206ENST00000486577 3760 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
PAXBP1Q9Y5B6 TRPC6-206ENST00000532133 2648 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
PAXBP1Q9Y5B6 UBR5-207ENST00000520539 10297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
PAXBP1Q9Y5B6 LZTS1-202ENST00000381569 5706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
PAXBP1Q9Y5B6 NFIX-214ENST00000592199 1509 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
PAXBP1Q9Y5B6 RASA4B-207ENST00000541662 2794 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
PAXBP1Q9Y5B6 TFAP2A-AS1-201ENST00000420777 1575 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
PAXBP1Q9Y5B6 SLC25A37-206ENST00000519973 4823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
PAXBP1Q9Y5B6 KCTD15-201ENST00000284006 4918 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
PAXBP1Q9Y5B6 SLAIN2-201ENST00000264313 6299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
PAXBP1Q9Y5B6 PC-204ENST00000524491 1714 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
PAXBP1Q9Y5B6 MAGEA12-202ENST00000393869 1761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
PAXBP1Q9Y5B6 RAB3IP-207ENST00000483530 1755 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
PAXBP1Q9Y5B6 TEN1-CDK3-202ENST00000569284 3287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
PAXBP1Q9Y5B6 CATSPER4-202ENST00000456354 1912 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
PAXBP1Q9Y5B6 SLC36A1-207ENST00000520701 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
PAXBP1Q9Y5B6 CRY2-201ENST00000417225 2053 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
PAXBP1Q9Y5B6 NANS-201ENST00000210444 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
PAXBP1Q9Y5B6 ELMSAN1-201ENST00000286523 8091 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
PAXBP1Q9Y5B6 ZNHIT1-201ENST00000305105 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
PAXBP1Q9Y5B6 RPLP2-201ENST00000321153 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
PAXBP1Q9Y5B6 TYMS-202ENST00000323250 693 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.9 ms