Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPX0

IGSF9B, Protein turtle homolog B, humanhuman

Predictions only

Length 1,349 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IGSF9BQ9UPX0 TSPY16P-201ENST00000449843 468 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
IGSF9BQ9UPX0 CCDC159-201ENST00000458408 1062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
IGSF9BQ9UPX0 LINC02242-201ENST00000507298 641 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
IGSF9BQ9UPX0 TMEM5-AS1-201ENST00000546214 563 ntTSL 4 BASIC18.22■□□□□ 0.51
IGSF9BQ9UPX0 COMMD4-207ENST00000562789 746 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
IGSF9BQ9UPX0 LITAF-210ENST00000571976 548 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
IGSF9BQ9UPX0 LITAF-214ENST00000574703 486 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
IGSF9BQ9UPX0 AC024267.1-201ENST00000582320 895 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
IGSF9BQ9UPX0 DBI-212ENST00000627305 620 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
IGSF9BQ9UPX0 UBFD1-201ENST00000395878 5110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
IGSF9BQ9UPX0 FLAD1-203ENST00000315144 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
IGSF9BQ9UPX0 TXNDC2-204ENST00000536353 1703 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
IGSF9BQ9UPX0 FAM222B-211ENST00000582266 2613 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
IGSF9BQ9UPX0 TCAF2-203ENST00000425618 2448 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
IGSF9BQ9UPX0 TEAD3-204ENST00000639578 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
IGSF9BQ9UPX0 MAGI3-201ENST00000307546 6430 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
IGSF9BQ9UPX0 CDCP1-201ENST00000296129 6006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
IGSF9BQ9UPX0 KPNA2-202ENST00000537025 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
IGSF9BQ9UPX0 SIPA1-201ENST00000394224 3628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
IGSF9BQ9UPX0 CT62-201ENST00000449977 1825 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
IGSF9BQ9UPX0 NOL4L-210ENST00000616976 1376 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
IGSF9BQ9UPX0 SH3YL1-206ENST00000405430 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
IGSF9BQ9UPX0 C10orf10-201ENST00000298295 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
IGSF9BQ9UPX0 PHF23-202ENST00000454255 1662 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
IGSF9BQ9UPX0 DLG4-202ENST00000399506 3185 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
IGSF9BQ9UPX0 MRPS21-201ENST00000581066 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
IGSF9BQ9UPX0 CALCR-207ENST00000426151 1741 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
IGSF9BQ9UPX0 AC005622.1-201ENST00000636801 1703 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
IGSF9BQ9UPX0 CCDC40-201ENST00000269318 1970 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
IGSF9BQ9UPX0 RPS6KA3-201ENST00000379565 7918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
IGSF9BQ9UPX0 HAGH-202ENST00000397356 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
IGSF9BQ9UPX0 SART1-201ENST00000312397 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
IGSF9BQ9UPX0 MRNIP-202ENST00000376931 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
IGSF9BQ9UPX0 SNRPB-201ENST00000381342 1154 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
IGSF9BQ9UPX0 AC104135.1-201ENST00000418001 763 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
IGSF9BQ9UPX0 SNRPB-202ENST00000438552 1008 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
IGSF9BQ9UPX0 FAM207CP-201ENST00000443486 507 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
IGSF9BQ9UPX0 RAD51D-205ENST00000460118 1064 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
IGSF9BQ9UPX0 POU5F1P6-201ENST00000466990 990 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
IGSF9BQ9UPX0 OARD1-208ENST00000469104 704 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
IGSF9BQ9UPX0 HLA-V-204ENST00000476601 1289 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
IGSF9BQ9UPX0 AC105021.1-202ENST00000570572 669 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
IGSF9BQ9UPX0 YTHDF3-AS1-201ENST00000603538 718 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
IGSF9BQ9UPX0 AL133215.2-201ENST00000609242 977 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
IGSF9BQ9UPX0 GPER1-207ENST00000619052 571 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
IGSF9BQ9UPX0 OARD1-216ENST00000628419 1188 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
IGSF9BQ9UPX0 HFE2-206ENST00000634927 506 ntTSL 4 BASIC18.21■□□□□ 0.51
IGSF9BQ9UPX0 ZNF503-201ENST00000372524 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
IGSF9BQ9UPX0 LINC00323-202ENST00000441268 2095 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.5
IGSF9BQ9UPX0 AC079328.2-201ENST00000561241 3354 ntBASIC18.21■□□□□ 0.5
IGSF9BQ9UPX0 PCDHA7-202ENST00000525929 5221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
IGSF9BQ9UPX0 AATK-201ENST00000326724 5257 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
IGSF9BQ9UPX0 GLYCTK-207ENST00000477382 1304 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
IGSF9BQ9UPX0 EIF1B-AS1-206ENST00000631175 1303 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
IGSF9BQ9UPX0 POTEE-204ENST00000613282 1926 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
IGSF9BQ9UPX0 POTEI-202ENST00000615053 1926 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
IGSF9BQ9UPX0 HMGXB3-206ENST00000613459 5567 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
IGSF9BQ9UPX0 PDE4DIP-230ENST00000530472 1690 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
IGSF9BQ9UPX0 GRAMD4P3-201ENST00000621665 1669 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
IGSF9BQ9UPX0 PIGQ-201ENST00000026218 2846 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
IGSF9BQ9UPX0 PCGF3-201ENST00000362003 5685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
IGSF9BQ9UPX0 MINDY2-202ENST00000450403 4820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
IGSF9BQ9UPX0 GRIN2C-202ENST00000347612 2929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
IGSF9BQ9UPX0 DNAJC7-201ENST00000316603 1468 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
IGSF9BQ9UPX0 MFSD11-207ENST00000586622 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
IGSF9BQ9UPX0 MUL1-201ENST00000264198 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
IGSF9BQ9UPX0 AC006974.1-201ENST00000637928 1501 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
IGSF9BQ9UPX0 SLC22A12-205ENST00000473690 2522 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
IGSF9BQ9UPX0 NRXN1-209ENST00000405581 5078 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
IGSF9BQ9UPX0 CD8B-201ENST00000331469 832 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
IGSF9BQ9UPX0 MUC1-201ENST00000337604 859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
IGSF9BQ9UPX0 ASMT-201ENST00000381229 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
IGSF9BQ9UPX0 RAC2-204ENST00000406508 893 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
IGSF9BQ9UPX0 MUSTN1-201ENST00000446157 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
IGSF9BQ9UPX0 TAF8-206ENST00000472818 719 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
IGSF9BQ9UPX0 TMEM176B-206ENST00000492607 1265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
IGSF9BQ9UPX0 TERF1P3-201ENST00000505638 1227 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
IGSF9BQ9UPX0 CFL1-212ENST00000531413 636 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
IGSF9BQ9UPX0 AKIP1-211ENST00000534506 576 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
IGSF9BQ9UPX0 POLD4-211ENST00000539074 714 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
IGSF9BQ9UPX0 TMSB15B-204ENST00000540220 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
IGSF9BQ9UPX0 AC190387.1-201ENST00000551683 408 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
IGSF9BQ9UPX0 TMSB15B-205ENST00000563257 590 ntTSL 4 BASIC18.2■□□□□ 0.5
IGSF9BQ9UPX0 PRR29-209ENST00000582540 967 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
IGSF9BQ9UPX0 AL138828.2-201ENST00000615812 383 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
IGSF9BQ9UPX0 AQP12B-206ENST00000621682 1080 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
IGSF9BQ9UPX0 AL359644.1-202ENST00000637541 571 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
IGSF9BQ9UPX0 ADGRB2-201ENST00000373655 5400 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
IGSF9BQ9UPX0 ING5-201ENST00000313552 5196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
IGSF9BQ9UPX0 RAB5C-201ENST00000346213 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
IGSF9BQ9UPX0 GNAS-212ENST00000371098 1719 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
IGSF9BQ9UPX0 SERINC2-205ENST00000536384 2062 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
IGSF9BQ9UPX0 PPP3CA-201ENST00000323055 4519 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
IGSF9BQ9UPX0 GTPBP8-202ENST00000383677 1787 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
IGSF9BQ9UPX0 NT5C3A-204ENST00000405342 1759 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
IGSF9BQ9UPX0 PRRG2-201ENST00000246794 1404 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
IGSF9BQ9UPX0 GPR152-201ENST00000312457 1429 ntAPPRIS P1 BASIC18.19■□□□□ 0.5
IGSF9BQ9UPX0 PRR30-202ENST00000432962 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
IGSF9BQ9UPX0 CD1E-212ENST00000368167 1458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
IGSF9BQ9UPX0 TBRG4-203ENST00000395655 2225 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 104.1 ms