Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPQ9

TNRC6B, Trinucleotide repeat-containing gene 6B protein, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,833 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNRC6BQ9UPQ9 BTD-207ENST00000449107 1820 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
TNRC6BQ9UPQ9 ECHDC1-214ENST00000474289 2443 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
TNRC6BQ9UPQ9 TXNRD2-214ENST00000491939 2238 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
TNRC6BQ9UPQ9 MEIKIN-203ENST00000442687 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
TNRC6BQ9UPQ9 PSMF1-201ENST00000246015 2042 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
TNRC6BQ9UPQ9 ETV7-207ENST00000620358 1599 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
TNRC6BQ9UPQ9 AC007613.1-201ENST00000572811 2597 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
TNRC6BQ9UPQ9 SIGLEC12-203ENST00000598614 1434 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
TNRC6BQ9UPQ9 PFDN5-202ENST00000334478 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TNRC6BQ9UPQ9 C1QBPP1-201ENST00000400117 770 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
TNRC6BQ9UPQ9 TMEM147-AS1-201ENST00000444728 487 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
TNRC6BQ9UPQ9 ZNF454-202ENST00000519564 2142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
TNRC6BQ9UPQ9 AP001453.3-201ENST00000545800 853 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
TNRC6BQ9UPQ9 CRISPLD2-210ENST00000569090 808 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TNRC6BQ9UPQ9 RPL36-203ENST00000577222 874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
TNRC6BQ9UPQ9 MIR3615-201ENST00000581999 87 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
TNRC6BQ9UPQ9 AC005262.2-201ENST00000587701 452 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
TNRC6BQ9UPQ9 FBXL12-211ENST00000591009 1005 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TNRC6BQ9UPQ9 SCOC-211ENST00000614192 1959 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TNRC6BQ9UPQ9 TCP11-206ENST00000412155 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
TNRC6BQ9UPQ9 CCDC181-206ENST00000491570 1652 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
TNRC6BQ9UPQ9 COLQ-206ENST00000603808 1668 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TNRC6BQ9UPQ9 ACP5-202ENST00000412435 1527 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
TNRC6BQ9UPQ9 AL121723.1-201ENST00000445194 1519 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
TNRC6BQ9UPQ9 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TNRC6BQ9UPQ9 WRNIP1-202ENST00000380769 3239 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TNRC6BQ9UPQ9 LRP8-204ENST00000371454 3322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TNRC6BQ9UPQ9 MCHR2-202ENST00000369212 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TNRC6BQ9UPQ9 SKOR1-204ENST00000554240 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
TNRC6BQ9UPQ9 SLC22A16-202ENST00000368919 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TNRC6BQ9UPQ9 METTL17-202ENST00000382985 1586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TNRC6BQ9UPQ9 SEC14L2-215ENST00000617837 2632 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
TNRC6BQ9UPQ9 EPN2-203ENST00000395618 2216 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
TNRC6BQ9UPQ9 ATP6V1B1-202ENST00000412314 1805 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
TNRC6BQ9UPQ9 MEIS3-206ENST00000559524 1828 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
TNRC6BQ9UPQ9 PRSS55-201ENST00000328655 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TNRC6BQ9UPQ9 CCDC107-204ENST00000378409 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TNRC6BQ9UPQ9 AC007731.4-201ENST00000420225 652 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
TNRC6BQ9UPQ9 NCBP2-203ENST00000422610 676 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
TNRC6BQ9UPQ9 CALR4P-201ENST00000431943 946 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
TNRC6BQ9UPQ9 AL355994.3-201ENST00000437156 466 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
TNRC6BQ9UPQ9 LIMS3-201ENST00000437679 1220 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TNRC6BQ9UPQ9 KRT18P43-201ENST00000469825 1281 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
TNRC6BQ9UPQ9 RAB26-202ENST00000541451 944 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TNRC6BQ9UPQ9 AL133523.1-201ENST00000554537 331 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
TNRC6BQ9UPQ9 ANAPC11-215ENST00000578550 599 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
TNRC6BQ9UPQ9 COPS9-205ENST00000607357 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TNRC6BQ9UPQ9 AC005695.3-201ENST00000614522 232 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
TNRC6BQ9UPQ9 TEAD4-203ENST00000397122 1396 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TNRC6BQ9UPQ9 NHEG1-202ENST00000432330 1357 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TNRC6BQ9UPQ9 TBCEL-205ENST00000529397 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TNRC6BQ9UPQ9 AMT-233ENST00000636522 1620 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
TNRC6BQ9UPQ9 XXYLT1-201ENST00000310380 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TNRC6BQ9UPQ9 TMEM138-201ENST00000278826 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TNRC6BQ9UPQ9 P2RY4-201ENST00000374519 1595 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TNRC6BQ9UPQ9 SPIN2A-201ENST00000374906 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TNRC6BQ9UPQ9 AC134312.5-201ENST00000568031 1313 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
TNRC6BQ9UPQ9 SLC44A3-206ENST00000527077 1943 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TNRC6BQ9UPQ9 LRCH3-201ENST00000334859 2258 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TNRC6BQ9UPQ9 SLC25A2-201ENST00000239451 1417 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TNRC6BQ9UPQ9 AC010478.1-202ENST00000559112 2367 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TNRC6BQ9UPQ9 MLKL-201ENST00000306247 1781 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TNRC6BQ9UPQ9 PPM1G-201ENST00000344034 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TNRC6BQ9UPQ9 KRT27-201ENST00000301656 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TNRC6BQ9UPQ9 RPL18A-201ENST00000222247 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TNRC6BQ9UPQ9 MRPL58-201ENST00000301585 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TNRC6BQ9UPQ9 POLD4-201ENST00000312419 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TNRC6BQ9UPQ9 NOSIP-201ENST00000339093 1000 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TNRC6BQ9UPQ9 MIR326-201ENST00000362220 95 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
TNRC6BQ9UPQ9 RBM8A-201ENST00000369307 796 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TNRC6BQ9UPQ9 AC017104.1-201ENST00000415129 720 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TNRC6BQ9UPQ9 AL583835.2-202ENST00000421363 1104 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TNRC6BQ9UPQ9 TMEM107-204ENST00000437139 747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TNRC6BQ9UPQ9 AL160290.2-201ENST00000448347 831 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TNRC6BQ9UPQ9 GTF2H2C-215ENST00000514162 610 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TNRC6BQ9UPQ9 AC005833.2-201ENST00000527518 1249 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TNRC6BQ9UPQ9 VASH1-AS1-201ENST00000554058 871 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TNRC6BQ9UPQ9 RAB11B-202ENST00000594216 894 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TNRC6BQ9UPQ9 AL118558.3-201ENST00000607414 1079 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
TNRC6BQ9UPQ9 HTT-AS1_1.1-201ENST00000612914 230 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
TNRC6BQ9UPQ9 PRKN-211ENST00000615065 261 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TNRC6BQ9UPQ9 FP565260.5-201ENST00000623188 479 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TNRC6BQ9UPQ9 SNAI3-AS1-202ENST00000563475 2081 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TNRC6BQ9UPQ9 LARGE2-201ENST00000325468 2522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TNRC6BQ9UPQ9 XAF1-201ENST00000346752 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TNRC6BQ9UPQ9 MYO3A-206ENST00000543632 2203 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TNRC6BQ9UPQ9 AP005717.1-201ENST00000500705 1899 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TNRC6BQ9UPQ9 AC009292.1-201ENST00000502156 1986 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TNRC6BQ9UPQ9 AC078925.2-201ENST00000624013 1973 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
TNRC6BQ9UPQ9 LCMT2-202ENST00000567039 1545 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TNRC6BQ9UPQ9 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TNRC6BQ9UPQ9 TLE2-204ENST00000455444 2253 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TNRC6BQ9UPQ9 LINC01144-201ENST00000626198 1710 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
TNRC6BQ9UPQ9 KLHDC3-202ENST00000326974 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TNRC6BQ9UPQ9 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TNRC6BQ9UPQ9 LCN9-201ENST00000277526 531 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TNRC6BQ9UPQ9 AGRP-201ENST00000290953 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TNRC6BQ9UPQ9 ISCA1-201ENST00000311534 813 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TNRC6BQ9UPQ9 MBP-203ENST00000359645 1255 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TNRC6BQ9UPQ9 C9orf16-201ENST00000372994 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.3 ms