Protein–RNA interactions for Protein: Q9UN30

SCML1, Sex comb on midleg-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 329 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCML1Q9UN30 AC245100.5-201ENST00000452108 331 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
SCML1Q9UN30 AC015688.8-201ENST00000577746 656 ntTSL 4 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SCML1Q9UN30 ZNF586-205ENST00000598885 578 ntTSL 4 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SCML1Q9UN30 TEX48-202ENST00000612244 662 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SCML1Q9UN30 Metazoa_SRP.112-201ENST00000613101 279 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
SCML1Q9UN30 NRP1-204ENST00000374822 2213 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SCML1Q9UN30 GSKIP-205ENST00000555181 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SCML1Q9UN30 ANXA4-202ENST00000409920 1414 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SCML1Q9UN30 OLA1-201ENST00000284719 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SCML1Q9UN30 CPZ-203ENST00000382480 2538 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SCML1Q9UN30 PRKACG-201ENST00000377276 1585 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SCML1Q9UN30 GATA6-201ENST00000269216 3770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SCML1Q9UN30 TMEFF2-201ENST00000272771 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SCML1Q9UN30 FBXO4-201ENST00000281623 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SCML1Q9UN30 QRFP-202ENST00000623824 1658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SCML1Q9UN30 CTSB-232ENST00000534510 1989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SCML1Q9UN30 PODXL-202ENST00000378555 2105 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SCML1Q9UN30 TRIM45-203ENST00000369464 3495 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SCML1Q9UN30 RASSF5-205ENST00000581503 5586 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SCML1Q9UN30 C9orf62-201ENST00000623103 1924 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SCML1Q9UN30 BEX4-202ENST00000372695 1328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SCML1Q9UN30 ZNF470-201ENST00000330619 7151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SCML1Q9UN30 ANAPC2-201ENST00000323927 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SCML1Q9UN30 AC005915.1-201ENST00000624912 2018 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
SCML1Q9UN30 APH1A-203ENST00000369109 1713 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SCML1Q9UN30 FNDC5-201ENST00000373471 2732 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SCML1Q9UN30 OR6D1P-203ENST00000641209 4860 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
SCML1Q9UN30 ACBD3-201ENST00000366812 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SCML1Q9UN30 BORCS8-MEF2B-203ENST00000514819 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SCML1Q9UN30 LMF1-AS1-202ENST00000569574 1408 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SCML1Q9UN30 PDE2A-226ENST00000544570 3119 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SCML1Q9UN30 VCX2-201ENST00000317103 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SCML1Q9UN30 LINC01116-202ENST00000339037 838 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SCML1Q9UN30 TSPAN4-201ENST00000346501 882 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SCML1Q9UN30 AC098614.1-201ENST00000368528 745 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
SCML1Q9UN30 ADIRF-201ENST00000372013 917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SCML1Q9UN30 RASL12-203ENST00000434605 982 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SCML1Q9UN30 DLX2-AS1-201ENST00000448117 950 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SCML1Q9UN30 AC008406.2-201ENST00000507058 532 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SCML1Q9UN30 DOC2GP-202ENST00000514950 1163 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
SCML1Q9UN30 FAU-205ENST00000527548 538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SCML1Q9UN30 AP003068.1-201ENST00000528887 544 ntTSL 4 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SCML1Q9UN30 API5-211ENST00000534695 560 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SCML1Q9UN30 CD4-210ENST00000541982 1187 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SCML1Q9UN30 RIC8B-209ENST00000549643 571 ntTSL 4 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SCML1Q9UN30 AC044860.1-202ENST00000559481 777 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
SCML1Q9UN30 NUBP2-208ENST00000565987 1049 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SCML1Q9UN30 AC104794.3-201ENST00000566840 1248 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
SCML1Q9UN30 ARMC7-205ENST00000584947 445 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SCML1Q9UN30 VCX-203ENST00000620630 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SCML1Q9UN30 DOK5-201ENST00000262593 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SCML1Q9UN30 LFNG-207ENST00000614382 1969 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SCML1Q9UN30 PYCR3-201ENST00000220966 2678 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SCML1Q9UN30 TEKT2-201ENST00000207457 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SCML1Q9UN30 PTGES3-202ENST00000414274 1547 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SCML1Q9UN30 BFSP1-205ENST00000536626 2075 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SCML1Q9UN30 CD1B-201ENST00000368168 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SCML1Q9UN30 NPBWR2-201ENST00000369768 1352 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SCML1Q9UN30 EIF2B3-210ENST00000620860 1923 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SCML1Q9UN30 BTBD1-201ENST00000261721 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SCML1Q9UN30 TBC1D4-202ENST00000377636 6364 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SCML1Q9UN30 C1QTNF6-202ENST00000397110 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SCML1Q9UN30 SPAST-202ENST00000345662 5116 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SCML1Q9UN30 AL391005.1-201ENST00000623953 2435 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
SCML1Q9UN30 IPMK-201ENST00000373935 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SCML1Q9UN30 ZNF302-202ENST00000446502 2635 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SCML1Q9UN30 LINC00921-202ENST00000573951 2468 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SCML1Q9UN30 HYAL3-201ENST00000336307 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SCML1Q9UN30 BATF2-202ENST00000435842 1949 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SCML1Q9UN30 UBXN1-201ENST00000294119 1291 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SCML1Q9UN30 HRCT1-201ENST00000354323 950 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SCML1Q9UN30 FAM166B-201ENST00000399742 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SCML1Q9UN30 OSM-203ENST00000403463 464 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SCML1Q9UN30 DNAJB6-209ENST00000443280 1159 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SCML1Q9UN30 HEBP2-202ENST00000448741 661 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SCML1Q9UN30 YEATS4-202ENST00000548020 1100 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SCML1Q9UN30 MRNIP-225ENST00000610475 810 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SCML1Q9UN30 ALDH3B1-203ENST00000612297 1231 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SCML1Q9UN30 IFI27-210ENST00000616764 716 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SCML1Q9UN30 IFI27-213ENST00000620066 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SCML1Q9UN30 LCMT2-202ENST00000567039 1545 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SCML1Q9UN30 MYO1B-204ENST00000392318 5082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SCML1Q9UN30 MAGEA8-201ENST00000286482 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SCML1Q9UN30 HLA-A-202ENST00000376806 1854 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
SCML1Q9UN30 SFTPB-202ENST00000409383 1867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SCML1Q9UN30 GUCY1B3-206ENST00000507146 2709 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SCML1Q9UN30 AVPR1B-201ENST00000367126 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SCML1Q9UN30 FLAD1-203ENST00000315144 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SCML1Q9UN30 STX2-201ENST00000261653 3331 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SCML1Q9UN30 CBSL-202ENST00000617706 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SCML1Q9UN30 CCDC144A-210ENST00000456009 2306 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SCML1Q9UN30 SDCBP-202ENST00000413219 2086 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SCML1Q9UN30 SH2D3C-205ENST00000420366 2682 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SCML1Q9UN30 OLIG2-201ENST00000333337 3262 ntAPPRIS P1 BASIC16.21■□□□□ 0.19
SCML1Q9UN30 ASXL1-202ENST00000375687 7031 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
SCML1Q9UN30 PITPNA-202ENST00000539476 3612 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
SCML1Q9UN30 ARHGEF28-212ENST00000513042 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
SCML1Q9UN30 TRAPPC11-201ENST00000334690 4552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SCML1Q9UN30 MLXIP-201ENST00000319080 8427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SCML1Q9UN30 SERAC1-201ENST00000367101 1907 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.2 ms