Protein–RNA interactions for Protein: Q9UMW8

USP18, Ubl carboxyl-terminal hydrolase 18, humanhuman

Predictions only

Length 372 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP18Q9UMW8 RAB37-208ENST00000402449 1560 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
USP18Q9UMW8 MTHFR-217ENST00000641820 1569 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
USP18Q9UMW8 SSH3-201ENST00000308127 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
USP18Q9UMW8 FBXL12-206ENST00000588922 1843 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
USP18Q9UMW8 PLPPR5-202ENST00000370188 4139 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
USP18Q9UMW8 KLF10-201ENST00000285407 3097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
USP18Q9UMW8 OR8S1-201ENST00000310194 1080 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
USP18Q9UMW8 ASTL-201ENST00000342380 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
USP18Q9UMW8 AL354836.1-201ENST00000414042 681 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
USP18Q9UMW8 CNN2P2-201ENST00000443536 909 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
USP18Q9UMW8 CNN2P3-201ENST00000450201 906 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
USP18Q9UMW8 AL807752.3-201ENST00000456356 748 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
USP18Q9UMW8 PRKAG2-AS1-202ENST00000467458 1064 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
USP18Q9UMW8 VPS29-207ENST00000549970 818 ntTSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
USP18Q9UMW8 AL583722.3-202ENST00000554954 486 ntTSL 4 BASIC17.29■□□□□ 0.36
USP18Q9UMW8 TVP23B-206ENST00000574226 1080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
USP18Q9UMW8 AC021097.1-201ENST00000607902 574 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
USP18Q9UMW8 AL136317.3-201ENST00000618497 906 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
USP18Q9UMW8 GFAP-233ENST00000639277 1783 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
USP18Q9UMW8 AC026691.1-201ENST00000602502 2017 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
USP18Q9UMW8 ARHGAP27-208ENST00000528384 2296 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
USP18Q9UMW8 CASZ1-202ENST00000377022 7936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
USP18Q9UMW8 RPS6KB1-203ENST00000406116 1982 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
USP18Q9UMW8 SRRM2-201ENST00000301740 9353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
USP18Q9UMW8 CPVL-202ENST00000396276 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
USP18Q9UMW8 ZDHHC13-202ENST00000446113 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
USP18Q9UMW8 LHCGR-203ENST00000403273 1921 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
USP18Q9UMW8 IRF5-215ENST00000619830 1652 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
USP18Q9UMW8 LITAF-209ENST00000571688 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
USP18Q9UMW8 TMEM65-201ENST00000297632 9029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
USP18Q9UMW8 SSFA2-201ENST00000320370 4965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
USP18Q9UMW8 SIGLEC10-205ENST00000439889 2126 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
USP18Q9UMW8 TXNDC2-201ENST00000306084 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
USP18Q9UMW8 F3-202ENST00000370207 1879 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
USP18Q9UMW8 FAM210B-201ENST00000371384 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
USP18Q9UMW8 AC100830.1-201ENST00000560387 1609 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
USP18Q9UMW8 XRCC3-209ENST00000554913 2539 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
USP18Q9UMW8 R3HDML-201ENST00000217043 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
USP18Q9UMW8 MAP2K7-202ENST00000397981 3430 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
USP18Q9UMW8 ADAM6-201ENST00000606026 1843 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
USP18Q9UMW8 BANP-204ENST00000393208 2283 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
USP18Q9UMW8 PCDHGA11-202ENST00000518882 2263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
USP18Q9UMW8 BTN1A1-202ENST00000613186 2266 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
USP18Q9UMW8 CIAPIN1-209ENST00000567518 2016 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
USP18Q9UMW8 FOXS1-201ENST00000375978 1319 ntAPPRIS P1 BASIC17.28■□□□□ 0.36
USP18Q9UMW8 CEP72-201ENST00000264935 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
USP18Q9UMW8 ESR2-201ENST00000267525 1518 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
USP18Q9UMW8 RALYL-208ENST00000522455 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
USP18Q9UMW8 CLPTM1L-209ENST00000507807 1740 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
USP18Q9UMW8 CDCA5-201ENST00000275517 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
USP18Q9UMW8 S100A14-204ENST00000368702 1218 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
USP18Q9UMW8 GBGT1-201ENST00000372036 871 ntTSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
USP18Q9UMW8 DPM2-202ENST00000373110 738 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
USP18Q9UMW8 SELENOH-201ENST00000388857 833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
USP18Q9UMW8 CBX7-202ENST00000401405 784 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
USP18Q9UMW8 TIMM8BP1-201ENST00000452384 211 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
USP18Q9UMW8 CCDC159-201ENST00000458408 1062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
USP18Q9UMW8 S100A14-206ENST00000476873 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
USP18Q9UMW8 REEP2-206ENST00000506158 1021 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
USP18Q9UMW8 AC106897.1-201ENST00000512874 394 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
USP18Q9UMW8 AC015911.4-201ENST00000588022 1070 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
USP18Q9UMW8 DLG4-201ENST00000302955 3184 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
USP18Q9UMW8 ACAT2-201ENST00000367048 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
USP18Q9UMW8 HPSE-207ENST00000513463 1458 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
USP18Q9UMW8 PRKAG1-217ENST00000552212 1497 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
USP18Q9UMW8 DNM2-202ENST00000359692 3588 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
USP18Q9UMW8 SRPX-201ENST00000378533 1874 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
USP18Q9UMW8 NPM2-203ENST00000397940 1874 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
USP18Q9UMW8 AC004233.2-201ENST00000573315 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
USP18Q9UMW8 TAP2-202ENST00000374899 2497 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
USP18Q9UMW8 CD72-204ENST00000396757 2035 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
USP18Q9UMW8 DACH1-203ENST00000619232 2986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
USP18Q9UMW8 SYBU-230ENST00000532779 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
USP18Q9UMW8 TCP10L2-202ENST00000366832 2185 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
USP18Q9UMW8 GULP1-209ENST00000410051 1595 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
USP18Q9UMW8 PLXNB2-214ENST00000614805 1387 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
USP18Q9UMW8 UNC5D-203ENST00000416672 3532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
USP18Q9UMW8 RNF157-202ENST00000319945 2937 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
USP18Q9UMW8 AIFM3-203ENST00000405089 2333 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
USP18Q9UMW8 AC104809.1-201ENST00000425110 2345 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
USP18Q9UMW8 MAGEA2B-201ENST00000331220 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
USP18Q9UMW8 WDR45-239ENST00000634944 1745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
USP18Q9UMW8 ACTR3-208ENST00000535589 1530 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
USP18Q9UMW8 TSPAN3-201ENST00000267970 6467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
USP18Q9UMW8 SCAP-201ENST00000265565 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
USP18Q9UMW8 SYT3-202ENST00000593901 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
USP18Q9UMW8 GRAMD1A-211ENST00000599564 2825 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
USP18Q9UMW8 CHTF18-220ENST00000631357 3555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
USP18Q9UMW8 BBS2-218ENST00000568104 2623 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
USP18Q9UMW8 CARD14-202ENST00000570421 2607 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
USP18Q9UMW8 CCDC120-202ENST00000496529 2415 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
USP18Q9UMW8 AASDHPPT-201ENST00000278618 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
USP18Q9UMW8 SNAI2-201ENST00000020945 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
USP18Q9UMW8 NR2C1-201ENST00000330677 2014 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
USP18Q9UMW8 RGS11-202ENST00000316163 2376 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
USP18Q9UMW8 LTC4S-201ENST00000292596 666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
USP18Q9UMW8 ANAPC11-201ENST00000344877 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
USP18Q9UMW8 TSSC4-202ENST00000380992 992 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
USP18Q9UMW8 MIR943-201ENST00000401286 94 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
USP18Q9UMW8 CENPM-205ENST00000404067 905 ntTSL 3 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.8 ms