Protein–RNA interactions for Protein: Q9UIL8

PHF11, PHD finger protein 11, humanhuman

Predictions only

Length 331 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHF11Q9UIL8 ZNF133-204ENST00000396026 2717 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PHF11Q9UIL8 ROMO1-201ENST00000336695 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PHF11Q9UIL8 ALKBH6-202ENST00000378875 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PHF11Q9UIL8 YBX2P1-201ENST00000394192 760 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
PHF11Q9UIL8 PIK3CD-AS2-201ENST00000415330 939 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PHF11Q9UIL8 MKNK2P1-201ENST00000437526 628 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
PHF11Q9UIL8 TTC31-205ENST00000442235 958 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PHF11Q9UIL8 CTBP1-AS2-204ENST00000514984 533 ntTSL 4 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PHF11Q9UIL8 AC116021.1-201ENST00000530049 653 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PHF11Q9UIL8 ZPBP2-204ENST00000584588 1277 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PHF11Q9UIL8 MTX1-207ENST00000609421 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PHF11Q9UIL8 RCAN3-210ENST00000618490 2386 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PHF11Q9UIL8 PLEKHA2-208ENST00000616927 1748 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PHF11Q9UIL8 WDR45-239ENST00000634944 1745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PHF11Q9UIL8 SYCE1-203ENST00000368517 1377 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PHF11Q9UIL8 RUFY2-203ENST00000388768 4502 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PHF11Q9UIL8 SAMD4A-204ENST00000554335 3003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PHF11Q9UIL8 UBE3A-227ENST00000638011 8742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PHF11Q9UIL8 AC087289.2-201ENST00000587267 1419 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PHF11Q9UIL8 TMEM237-202ENST00000409444 5592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PHF11Q9UIL8 RDH10-201ENST00000240285 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PHF11Q9UIL8 PLPPR2-201ENST00000251473 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PHF11Q9UIL8 PRKAG1-217ENST00000552212 1497 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PHF11Q9UIL8 FMNL1-201ENST00000328118 2330 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PHF11Q9UIL8 SHROOM2-201ENST00000380913 7447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PHF11Q9UIL8 NRP1-203ENST00000374821 1988 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
PHF11Q9UIL8 SULT1A2-204ENST00000533150 1991 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
PHF11Q9UIL8 IQCE-212ENST00000476665 2400 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
PHF11Q9UIL8 C12orf66-204ENST00000544871 2441 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
PHF11Q9UIL8 PANX2-201ENST00000159647 2964 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
PHF11Q9UIL8 ATP6V0E2-201ENST00000421974 2605 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PHF11Q9UIL8 MAPK8IP1-202ENST00000395629 3180 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
PHF11Q9UIL8 NUS1-201ENST00000368494 4676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PHF11Q9UIL8 TACR2-202ENST00000373307 1740 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
PHF11Q9UIL8 FBXW9-201ENST00000393261 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PHF11Q9UIL8 OAZ2-207ENST00000560258 1744 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
PHF11Q9UIL8 TERT-202ENST00000334602 3210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PHF11Q9UIL8 PRDM6-201ENST00000407847 9267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
PHF11Q9UIL8 ESPNL-201ENST00000343063 4836 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
PHF11Q9UIL8 TNNC2-202ENST00000372557 780 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
PHF11Q9UIL8 AL355306.1-201ENST00000415580 579 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
PHF11Q9UIL8 SAPCD1-209ENST00000425424 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
PHF11Q9UIL8 RN7SL589P-201ENST00000481268 310 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
PHF11Q9UIL8 LINC01485-205ENST00000523617 586 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
PHF11Q9UIL8 AP000777.2-201ENST00000539897 501 ntTSL 4 BASIC15.58■□□□□ 0.08
PHF11Q9UIL8 BRF1-219ENST00000551787 824 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PHF11Q9UIL8 ARHGDIA-208ENST00000581876 709 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
PHF11Q9UIL8 C19orf33-202ENST00000588605 520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PHF11Q9UIL8 METTL23-215ENST00000615984 1171 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
PHF11Q9UIL8 CITED2-204ENST00000618718 901 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
PHF11Q9UIL8 NPRL3-211ENST00000611875 2881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
PHF11Q9UIL8 MELTF-201ENST00000296350 3963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PHF11Q9UIL8 PNRC1-202ENST00000354922 1345 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PHF11Q9UIL8 CABP1-204ENST00000453000 1857 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PHF11Q9UIL8 PPIC-201ENST00000306442 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PHF11Q9UIL8 GLUL-201ENST00000311223 4719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PHF11Q9UIL8 GCFC2-202ENST00000409857 2516 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
PHF11Q9UIL8 CLMAT3-201ENST00000510576 1973 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PHF11Q9UIL8 AFG3L2-201ENST00000269143 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PHF11Q9UIL8 CLDN14-201ENST00000342108 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PHF11Q9UIL8 IGSF11-209ENST00000491903 1487 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
PHF11Q9UIL8 MYOC-201ENST00000037502 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PHF11Q9UIL8 PANK4-201ENST00000378466 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PHF11Q9UIL8 PSMC3-201ENST00000298852 1544 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PHF11Q9UIL8 PTGDR2-201ENST00000332539 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PHF11Q9UIL8 SETD7-204ENST00000506866 1602 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PHF11Q9UIL8 GLS2-216ENST00000610413 2296 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
PHF11Q9UIL8 FAM53C-202ENST00000434981 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PHF11Q9UIL8 CHRNE-201ENST00000293780 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PHF11Q9UIL8 AC005052.1-201ENST00000625181 2492 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
PHF11Q9UIL8 U82695.1-201ENST00000635752 1889 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
PHF11Q9UIL8 GATA3-201ENST00000346208 2654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PHF11Q9UIL8 LHCGR-203ENST00000403273 1921 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
PHF11Q9UIL8 AP001122.1-202ENST00000501648 1916 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
PHF11Q9UIL8 CTSD-213ENST00000637915 1982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
PHF11Q9UIL8 SSPN-201ENST00000242729 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PHF11Q9UIL8 AURKAIP1-201ENST00000321751 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
PHF11Q9UIL8 HIST1H2BD-202ENST00000377777 496 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
PHF11Q9UIL8 EXOSC8-202ENST00000389704 1198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PHF11Q9UIL8 AL671277.1-201ENST00000429656 993 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
PHF11Q9UIL8 IL32-206ENST00000440815 920 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
PHF11Q9UIL8 IL32-207ENST00000444393 892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
PHF11Q9UIL8 AL390729.1-201ENST00000456651 587 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
PHF11Q9UIL8 AKR1A1-204ENST00000471651 1018 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PHF11Q9UIL8 CPSF1-207ENST00000531727 704 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
PHF11Q9UIL8 IL32-219ENST00000531965 746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PHF11Q9UIL8 IL32-223ENST00000534507 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
PHF11Q9UIL8 IL32-226ENST00000548476 1014 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
PHF11Q9UIL8 IL32-227ENST00000548652 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
PHF11Q9UIL8 IGHV3OR16-6-201ENST00000568775 360 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
PHF11Q9UIL8 AC007193.2-201ENST00000596807 472 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
PHF11Q9UIL8 BCL2L12-206ENST00000598306 510 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
PHF11Q9UIL8 AC090164.4-201ENST00000632451 313 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
PHF11Q9UIL8 AC092902.6-201ENST00000641783 218 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
PHF11Q9UIL8 LZTS1-202ENST00000381569 5706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
PHF11Q9UIL8 LETM2-205ENST00000519476 2240 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PHF11Q9UIL8 RBM6-210ENST00000442092 2260 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PHF11Q9UIL8 SLC4A3-204ENST00000373760 4134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
PHF11Q9UIL8 HNF1A-215ENST00000615446 2344 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
PHF11Q9UIL8 SGPP1-201ENST00000247225 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.5 ms