Protein–RNA interactions for Protein: Q9UG01

IFT172, Intraflagellar transport protein 172 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 1,749 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFT172Q9UG01 AC106760.1-201ENST00000508690 800 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
IFT172Q9UG01 XRCC3-210ENST00000554974 575 ntTSL 4 BASIC22.65■■□□□ 1.22
IFT172Q9UG01 AC005252.2-201ENST00000624630 1141 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
IFT172Q9UG01 HIBCH-201ENST00000359678 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
IFT172Q9UG01 CLU-215ENST00000523500 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
IFT172Q9UG01 SLC25A3-217ENST00000552981 1351 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
IFT172Q9UG01 AC106886.4-201ENST00000623557 2502 ntBASIC22.64■■□□□ 1.22
IFT172Q9UG01 TMEM8A-204ENST00000431232 3691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
IFT172Q9UG01 IQCC-202ENST00000537469 2252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
IFT172Q9UG01 HAPLN4-201ENST00000291481 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
IFT172Q9UG01 TMEM222-210ENST00000608611 1511 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
IFT172Q9UG01 PRMT2-203ENST00000355680 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
IFT172Q9UG01 AC011676.5-201ENST00000624864 2660 ntBASIC22.64■■□□□ 1.22
IFT172Q9UG01 AC020922.1-201ENST00000591954 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
IFT172Q9UG01 SLFNL1-201ENST00000302946 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
IFT172Q9UG01 TAF1B-201ENST00000263663 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
IFT172Q9UG01 OGFR-201ENST00000290291 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
IFT172Q9UG01 DRC3-201ENST00000313838 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
IFT172Q9UG01 MIR648-201ENST00000385046 94 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
IFT172Q9UG01 IGHV3-35-201ENST00000390617 366 ntAPPRIS P1 BASIC22.64■■□□□ 1.21
IFT172Q9UG01 C1orf210-201ENST00000423420 629 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
IFT172Q9UG01 AC128709.1-201ENST00000445908 600 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
IFT172Q9UG01 EHF-205ENST00000527935 557 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
IFT172Q9UG01 ZNF7-206ENST00000528130 1134 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
IFT172Q9UG01 TPD52L1-214ENST00000534199 811 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
IFT172Q9UG01 RAB26-202ENST00000541451 944 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
IFT172Q9UG01 NAA38-206ENST00000576384 424 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
IFT172Q9UG01 AC015910.1-201ENST00000579400 975 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
IFT172Q9UG01 CU634019.7-201ENST00000624153 1185 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
IFT172Q9UG01 FP236241.2-201ENST00000624906 1185 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
IFT172Q9UG01 SNRPD3-201ENST00000215829 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
IFT172Q9UG01 U73166.1-201ENST00000439898 2625 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
IFT172Q9UG01 TMEM222-211ENST00000611517 1613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
IFT172Q9UG01 IL1RN-202ENST00000354115 1747 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
IFT172Q9UG01 DTX4-204ENST00000532982 1708 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
IFT172Q9UG01 PRPSAP2-216ENST00000536323 1872 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
IFT172Q9UG01 CSF2-201ENST00000296871 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
IFT172Q9UG01 AC005229.1-201ENST00000392885 409 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
IFT172Q9UG01 BNIP3P42-201ENST00000454982 569 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
IFT172Q9UG01 CHMP2B-205ENST00000494980 1175 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
IFT172Q9UG01 AC009133.2-201ENST00000566537 547 ntTSL 4 BASIC22.63■■□□□ 1.21
IFT172Q9UG01 BNIP3P29-201ENST00000598302 571 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
IFT172Q9UG01 AC011447.5-201ENST00000616168 564 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
IFT172Q9UG01 EIF3K-203ENST00000545173 1327 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
IFT172Q9UG01 CTSB-219ENST00000530640 1389 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
IFT172Q9UG01 EID3-201ENST00000527879 1467 ntAPPRIS P1 BASIC22.63■■□□□ 1.21
IFT172Q9UG01 LRRFIP1P1-201ENST00000498774 2246 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
IFT172Q9UG01 CMKLR1-204ENST00000550402 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
IFT172Q9UG01 CRYZL1-202ENST00000361534 2224 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
IFT172Q9UG01 B9D2-201ENST00000243578 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
IFT172Q9UG01 PQLC3-202ENST00000402361 696 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
IFT172Q9UG01 DERL3-204ENST00000406855 1063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
IFT172Q9UG01 FTH1P14-201ENST00000482930 551 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
IFT172Q9UG01 AC104596.2-201ENST00000512793 793 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
IFT172Q9UG01 NME2-206ENST00000513177 692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
IFT172Q9UG01 MFF-223ENST00000524634 647 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
IFT172Q9UG01 AC136475.5-202ENST00000524824 587 ntTSL 4 BASIC22.62■■□□□ 1.21
IFT172Q9UG01 AGAP1-213ENST00000619456 1057 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
IFT172Q9UG01 LINC01759-203ENST00000635271 888 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
IFT172Q9UG01 GRAPL-201ENST00000344415 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
IFT172Q9UG01 HACD3-202ENST00000442729 1332 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
IFT172Q9UG01 GALNT11-205ENST00000430044 2727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
IFT172Q9UG01 HCN2-201ENST00000251287 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
IFT172Q9UG01 PI16-201ENST00000373674 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
IFT172Q9UG01 MPP1-205ENST00000413259 2195 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
IFT172Q9UG01 STRN4-201ENST00000263280 3210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
IFT172Q9UG01 MRPL58-201ENST00000301585 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
IFT172Q9UG01 MAEA-202ENST00000303400 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
IFT172Q9UG01 KLC2-201ENST00000316924 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
IFT172Q9UG01 TRIML1-201ENST00000332517 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
IFT172Q9UG01 FAM169B-201ENST00000332908 579 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
IFT172Q9UG01 TRPC6-202ENST00000348423 2448 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
IFT172Q9UG01 STXBP3-201ENST00000370008 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
IFT172Q9UG01 INPP4A-205ENST00000409851 3365 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
IFT172Q9UG01 SDCBP-202ENST00000413219 2086 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
IFT172Q9UG01 TOM1-210ENST00000449058 2389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
IFT172Q9UG01 TSEN2-207ENST00000454502 1909 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
IFT172Q9UG01 SNHG12-210ENST00000483436 682 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
IFT172Q9UG01 PDCD6-202ENST00000505221 672 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
IFT172Q9UG01 RMDN1-212ENST00000519966 1164 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
IFT172Q9UG01 TIMM17BP1-201ENST00000545713 516 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
IFT172Q9UG01 AL359711.2-201ENST00000563105 872 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
IFT172Q9UG01 AC120498.3-201ENST00000568884 542 ntTSL 4 BASIC22.62■■□□□ 1.21
IFT172Q9UG01 C19orf53-206ENST00000593274 491 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
IFT172Q9UG01 ANTXRL-205ENST00000620264 2206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
IFT172Q9UG01 RIC8A-217ENST00000626818 159 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
IFT172Q9UG01 ADIRF-AS1-201ENST00000418273 2627 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
IFT172Q9UG01 EPB41-205ENST00000373797 2402 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
IFT172Q9UG01 DNM1-202ENST00000372923 3244 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
IFT172Q9UG01 PARVB-203ENST00000404989 1591 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
IFT172Q9UG01 PNMA3-202ENST00000593810 1432 ntAPPRIS P1 BASIC22.61■■□□□ 1.21
IFT172Q9UG01 PDE6D-201ENST00000287600 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
IFT172Q9UG01 NINJ2-201ENST00000305108 1252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
IFT172Q9UG01 KRTAP10-2-201ENST00000391621 1149 ntAPPRIS P1 BASIC22.61■■□□□ 1.21
IFT172Q9UG01 RPS24-203ENST00000435275 656 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
IFT172Q9UG01 GNB3-202ENST00000435982 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
IFT172Q9UG01 RPS24-214ENST00000613865 538 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
IFT172Q9UG01 CCDC184-201ENST00000316554 2343 ntAPPRIS P1 BASIC22.61■■□□□ 1.21
IFT172Q9UG01 DIABLO-206ENST00000443649 2250 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
IFT172Q9UG01 UNC5D-202ENST00000404895 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.6 ms