Protein–RNA interactions for Protein: Q9P219

CCDC88C, Protein Daple, humanhuman

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Length 2,028 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC88CQ9P219 COL4A1-204ENST00000543140 2547 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CCDC88CQ9P219 SCP2-213ENST00000528311 1896 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CCDC88CQ9P219 TMEM131-201ENST00000186436 6640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CCDC88CQ9P219 TRIM24-202ENST00000415680 3799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CCDC88CQ9P219 PDXDC1-204ENST00000455313 2183 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CCDC88CQ9P219 WDR81-204ENST00000419248 3315 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CCDC88CQ9P219 AMACR-202ENST00000382068 862 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CCDC88CQ9P219 HNRNPFP1-201ENST00000391730 1133 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
CCDC88CQ9P219 NDUFAF3-203ENST00000395458 808 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CCDC88CQ9P219 FAM86GP-201ENST00000448322 971 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
CCDC88CQ9P219 AC105233.2-201ENST00000523697 349 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
CCDC88CQ9P219 AC069120.2-201ENST00000524091 540 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
CCDC88CQ9P219 AF228730.5-201ENST00000530288 346 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
CCDC88CQ9P219 ALG1L8P-201ENST00000533887 760 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
CCDC88CQ9P219 TMEM88-202ENST00000574668 510 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CCDC88CQ9P219 AC010336.3-201ENST00000597156 667 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CCDC88CQ9P219 HNRNPDL-206ENST00000602300 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CCDC88CQ9P219 AC084121.4-201ENST00000641598 221 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
CCDC88CQ9P219 AF228730.8-201ENST00000642140 221 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
CCDC88CQ9P219 ADORA1-203ENST00000367235 2219 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CCDC88CQ9P219 F10-202ENST00000375559 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CCDC88CQ9P219 PDCD5-203ENST00000419343 1799 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CCDC88CQ9P219 NR2C1-201ENST00000330677 2014 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CCDC88CQ9P219 BX276092.9-201ENST00000636797 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CCDC88CQ9P219 DYRK1B-205ENST00000597639 1806 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CCDC88CQ9P219 NBL1-211ENST00000618761 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CCDC88CQ9P219 AC007950.2-201ENST00000615045 2347 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
CCDC88CQ9P219 NPM2-203ENST00000397940 1874 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CCDC88CQ9P219 GRAMD2B-217ENST00000515200 3109 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CCDC88CQ9P219 PC-204ENST00000524491 1714 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CCDC88CQ9P219 PPRC1-201ENST00000278070 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CCDC88CQ9P219 PAX3-207ENST00000409551 1782 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CCDC88CQ9P219 SNX33P1-201ENST00000592116 1762 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
CCDC88CQ9P219 EIF2B4-212ENST00000622434 1771 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CCDC88CQ9P219 VCAN-204ENST00000502527 2087 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CCDC88CQ9P219 CIB3-201ENST00000269878 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CCDC88CQ9P219 CABP5-201ENST00000293255 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CCDC88CQ9P219 TNNC2-201ENST00000372555 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CCDC88CQ9P219 CAPG-205ENST00000409921 1195 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
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CCDC88CQ9P219 AL391069.2-202ENST00000447795 622 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
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CCDC88CQ9P219 ALDH3A1-212ENST00000494157 1572 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CCDC88CQ9P219 MLLT6-210ENST00000620609 2714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CCDC88CQ9P219 GLYCTK-207ENST00000477382 1304 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
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CCDC88CQ9P219 SAP130-202ENST00000259235 4065 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
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CCDC88CQ9P219 DKC1-213ENST00000620277 3079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CCDC88CQ9P219 C16orf92-201ENST00000300575 895 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CCDC88CQ9P219 FAM220BP-201ENST00000377689 816 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
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CCDC88CQ9P219 FBXO4-201ENST00000281623 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
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CCDC88CQ9P219 HNRNPA3-201ENST00000392524 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CCDC88CQ9P219 OTUD7A-201ENST00000307050 10770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CCDC88CQ9P219 GSAP-201ENST00000257626 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CCDC88CQ9P219 NKX3-1-201ENST00000380871 3271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CCDC88CQ9P219 FSTL3-206ENST00000592947 2144 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CCDC88CQ9P219 APLNR-203ENST00000611099 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CCDC88CQ9P219 ZNF764-202ENST00000395091 2970 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CCDC88CQ9P219 PPP2R5D-206ENST00000472118 2963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CCDC88CQ9P219 INTS11-247ENST00000540437 2629 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CCDC88CQ9P219 TMEM229B-201ENST00000357461 4068 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CCDC88CQ9P219 ATXN2-219ENST00000550104 4648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CCDC88CQ9P219 SLC9A3P2-201ENST00000447821 2021 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
CCDC88CQ9P219 BLK-205ENST00000529894 2017 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CCDC88CQ9P219 MFHAS1-201ENST00000276282 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CCDC88CQ9P219 CCDC183-201ENST00000338005 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CCDC88CQ9P219 ENC1-201ENST00000302351 5520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CCDC88CQ9P219 PES1-202ENST00000354694 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CCDC88CQ9P219 AC024909.3-201ENST00000611513 2257 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
CCDC88CQ9P219 BAD-202ENST00000394531 631 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CCDC88CQ9P219 WRB-204ENST00000398753 699 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
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