Protein–RNA interactions for Protein: Q9P0J7

KCMF1, E3 ubiquitin-protein ligase KCMF1, humanhuman

Predictions only

Length 381 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCMF1Q9P0J7 ADARB1-202ENST00000360697 6604 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
KCMF1Q9P0J7 TCF3-212ENST00000588136 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
KCMF1Q9P0J7 C10orf107-201ENST00000330194 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
KCMF1Q9P0J7 CHFR-203ENST00000432561 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
KCMF1Q9P0J7 UGCG-201ENST00000374279 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
KCMF1Q9P0J7 ABHD10-201ENST00000273359 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
KCMF1Q9P0J7 TMEM86B-201ENST00000327042 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
KCMF1Q9P0J7 AC100830.1-201ENST00000560387 1609 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
KCMF1Q9P0J7 MFNG-201ENST00000356998 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
KCMF1Q9P0J7 ACIN1-205ENST00000457657 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
KCMF1Q9P0J7 AP1AR-201ENST00000274000 2902 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
KCMF1Q9P0J7 NRSN1-203ENST00000378478 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
KCMF1Q9P0J7 AP000787.1-201ENST00000501356 1926 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
KCMF1Q9P0J7 GPER1-206ENST00000617001 1900 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
KCMF1Q9P0J7 LIMS2-208ENST00000410011 2335 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
KCMF1Q9P0J7 C20orf166-AS1-201ENST00000412495 2302 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
KCMF1Q9P0J7 MYEOV-203ENST00000535407 2306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
KCMF1Q9P0J7 NSFL1C-201ENST00000216879 3568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
KCMF1Q9P0J7 NEO1-202ENST00000339362 7342 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
KCMF1Q9P0J7 C7orf31-201ENST00000283905 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
KCMF1Q9P0J7 PPAN-P2RY11-202ENST00000428358 2661 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
KCMF1Q9P0J7 PRR30-202ENST00000432962 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
KCMF1Q9P0J7 SLC17A7-204ENST00000600601 2237 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
KCMF1Q9P0J7 ASAP3-212ENST00000618240 2226 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
KCMF1Q9P0J7 MANSC1-202ENST00000535902 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
KCMF1Q9P0J7 XPO5-201ENST00000265351 5364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
KCMF1Q9P0J7 NUTM2F-201ENST00000253262 2561 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
KCMF1Q9P0J7 ZMYND11-208ENST00000397962 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
KCMF1Q9P0J7 RASIP1-201ENST00000222145 3308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
KCMF1Q9P0J7 SLC22A12-205ENST00000473690 2522 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
KCMF1Q9P0J7 SAP130-202ENST00000259235 4065 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
KCMF1Q9P0J7 ORMDL3-201ENST00000304046 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
KCMF1Q9P0J7 FOXN1-203ENST00000579795 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
KCMF1Q9P0J7 PRKCSH-217ENST00000592741 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
KCMF1Q9P0J7 FOXA1-201ENST00000250448 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
KCMF1Q9P0J7 AARSD1-202ENST00000427569 1322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
KCMF1Q9P0J7 ARHGEF4-205ENST00000409359 5489 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
KCMF1Q9P0J7 DLG4-201ENST00000302955 3184 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
KCMF1Q9P0J7 SMARCA4-201ENST00000344626 5392 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
KCMF1Q9P0J7 ICA1L-201ENST00000358299 3457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
KCMF1Q9P0J7 TRAPPC1-201ENST00000303731 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
KCMF1Q9P0J7 AMACR-202ENST00000382068 862 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
KCMF1Q9P0J7 ITGB2-204ENST00000397846 422 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
KCMF1Q9P0J7 CRIP1-203ENST00000409393 677 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
KCMF1Q9P0J7 NKIRAS1-204ENST00000416026 795 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
KCMF1Q9P0J7 C6orf47-AS1-203ENST00000422049 673 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
KCMF1Q9P0J7 SPCS2P4-201ENST00000436160 681 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
KCMF1Q9P0J7 AC092183.1-201ENST00000469884 875 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
KCMF1Q9P0J7 C8orf46-205ENST00000480005 865 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
KCMF1Q9P0J7 PRYP6-201ENST00000514804 343 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
KCMF1Q9P0J7 AC009053.3-201ENST00000567148 574 ntTSL 4 BASIC15.52■□□□□ 0.08
KCMF1Q9P0J7 PYCR1-207ENST00000577756 1144 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
KCMF1Q9P0J7 AP000894.3-201ENST00000582554 351 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
KCMF1Q9P0J7 AP002449.1-201ENST00000588211 474 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
KCMF1Q9P0J7 RAMP2-205ENST00000589683 858 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
KCMF1Q9P0J7 AC027307.2-201ENST00000591252 911 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
KCMF1Q9P0J7 CKMT1B-215ENST00000627381 1074 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
KCMF1Q9P0J7 GTF2H1-203ENST00000453096 2707 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
KCMF1Q9P0J7 SLC9A2-201ENST00000233969 5410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
KCMF1Q9P0J7 BAP1-202ENST00000460680 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
KCMF1Q9P0J7 REXO1L8P-201ENST00000604378 1897 ntBASIC15.52■□□□□ 0.07
KCMF1Q9P0J7 TJP1-201ENST00000346128 7950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
KCMF1Q9P0J7 SIRT6-203ENST00000594279 1507 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.07
KCMF1Q9P0J7 ADAM6-201ENST00000606026 1843 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
KCMF1Q9P0J7 SNX31-201ENST00000311812 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
KCMF1Q9P0J7 NEO1-201ENST00000261908 7088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
KCMF1Q9P0J7 GPSM3-206ENST00000375040 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
KCMF1Q9P0J7 BEND4-202ENST00000504360 8692 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
KCMF1Q9P0J7 ZDHHC13-202ENST00000446113 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
KCMF1Q9P0J7 C17orf100-201ENST00000542475 1756 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.07
KCMF1Q9P0J7 SYNC-202ENST00000409190 3398 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
KCMF1Q9P0J7 ZNF503-201ENST00000372524 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
KCMF1Q9P0J7 OAZ2-207ENST00000560258 1744 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
KCMF1Q9P0J7 SQLE-201ENST00000265896 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
KCMF1Q9P0J7 HOXB5-201ENST00000239151 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
KCMF1Q9P0J7 F11R-206ENST00000621309 4770 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
KCMF1Q9P0J7 MAP4K1-203ENST00000586296 1363 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
KCMF1Q9P0J7 HIST1H2AC-202ENST00000377791 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
KCMF1Q9P0J7 DOK5-201ENST00000262593 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
KCMF1Q9P0J7 TMPRSS13-203ENST00000524993 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
KCMF1Q9P0J7 AP2A2-201ENST00000332231 4656 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
KCMF1Q9P0J7 STAT5A-201ENST00000345506 4301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
KCMF1Q9P0J7 AC026412.1-202ENST00000512335 2231 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
KCMF1Q9P0J7 OSGIN1-203ENST00000393306 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
KCMF1Q9P0J7 BRD2-201ENST00000374825 4894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
KCMF1Q9P0J7 GLOD4-203ENST00000536578 2497 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
KCMF1Q9P0J7 MPP1-205ENST00000413259 2195 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
KCMF1Q9P0J7 TPD52L2-209ENST00000611972 2197 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
KCMF1Q9P0J7 LINC00554-201ENST00000564841 3011 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
KCMF1Q9P0J7 PHACTR3-204ENST00000371015 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
KCMF1Q9P0J7 NDUFV1-201ENST00000322776 1596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
KCMF1Q9P0J7 MIR346-201ENST00000362234 95 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
KCMF1Q9P0J7 C9orf116-202ENST00000371789 1278 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
KCMF1Q9P0J7 MRPS18A-202ENST00000372133 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
KCMF1Q9P0J7 AZIN1-AS1-212ENST00000520538 476 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
KCMF1Q9P0J7 C17orf49-203ENST00000546760 764 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
KCMF1Q9P0J7 HOPX-214ENST00000556614 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
KCMF1Q9P0J7 SNHG9-202ENST00000564014 471 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
KCMF1Q9P0J7 PRELID3A-208ENST00000590956 777 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
KCMF1Q9P0J7 AC022145.2-201ENST00000598203 171 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.7 ms