Protein–RNA interactions for Protein: Q9NWW5

CLN6, Ceroid-lipofuscinosis neuronal protein 6, humanhuman

Predictions only

Length 311 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLN6Q9NWW5 FUOM-202ENST00000368551 628 ntTSL 3 BASIC15.01□□□□□ -0.01
CLN6Q9NWW5 SUV39H2-204ENST00000378325 1292 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
CLN6Q9NWW5 DYNLL1-203ENST00000392509 814 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.01□□□□□ -0.01
CLN6Q9NWW5 HDAC11-202ENST00000402259 1000 ntTSL 3 BASIC15.01□□□□□ -0.01
CLN6Q9NWW5 AL031133.1-201ENST00000406807 723 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
CLN6Q9NWW5 ING5-202ENST00000406941 946 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
CLN6Q9NWW5 HAGLR-204ENST00000425005 623 ntTSL 3 BASIC15.01□□□□□ -0.01
CLN6Q9NWW5 NDUFA13-201ENST00000428459 576 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
CLN6Q9NWW5 PTK2-216ENST00000519881 863 ntTSL 3 BASIC15.01□□□□□ -0.01
CLN6Q9NWW5 ZNF688-207ENST00000567855 540 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
CLN6Q9NWW5 TMEM220-AS1-202ENST00000580899 561 ntTSL 4 BASIC15.01□□□□□ -0.01
CLN6Q9NWW5 MIR4492-201ENST00000581627 80 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
CLN6Q9NWW5 MPDU1-223ENST00000582151 728 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
CLN6Q9NWW5 AC002091.2-201ENST00000585297 402 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
CLN6Q9NWW5 C19orf25-204ENST00000586564 1265 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.01□□□□□ -0.01
CLN6Q9NWW5 AC010463.1-201ENST00000596542 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
CLN6Q9NWW5 AC114341.1-201ENST00000618070 349 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
CLN6Q9NWW5 FBXL22-204ENST00000638704 729 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
CLN6Q9NWW5 PARP16-201ENST00000261888 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
CLN6Q9NWW5 TNRC18P2-201ENST00000417666 2714 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
CLN6Q9NWW5 COG3-201ENST00000349995 4498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
CLN6Q9NWW5 WNT2-201ENST00000265441 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
CLN6Q9NWW5 USH1C-202ENST00000318024 2237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
CLN6Q9NWW5 NFE2L2-201ENST00000397062 2853 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
CLN6Q9NWW5 SYN1-202ENST00000340666 3172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
CLN6Q9NWW5 GPN1-212ENST00000616939 1832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
CLN6Q9NWW5 HOGA1-202ENST00000370646 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
CLN6Q9NWW5 PSMC5-202ENST00000375812 1494 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
CLN6Q9NWW5 LINGO1-201ENST00000355300 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
CLN6Q9NWW5 ARVCF-201ENST00000263207 4041 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
CLN6Q9NWW5 AC023157.3-201ENST00000619086 2088 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
CLN6Q9NWW5 NR2E3-203ENST00000621098 2064 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
CLN6Q9NWW5 LRRC57-202ENST00000397130 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
CLN6Q9NWW5 AC003986.2-201ENST00000419944 1711 ntTSL 3 BASIC15□□□□□ -0.01
CLN6Q9NWW5 FAM49B-224ENST00000522941 1700 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
CLN6Q9NWW5 INPP5K-204ENST00000421807 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
CLN6Q9NWW5 MAPKAPK3-203ENST00000446044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
CLN6Q9NWW5 ST14-201ENST00000278742 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
CLN6Q9NWW5 QRICH1-202ENST00000395443 3549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
CLN6Q9NWW5 FAM237A-203ENST00000543490 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
CLN6Q9NWW5 ARHGAP9-203ENST00000424809 2569 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
CLN6Q9NWW5 CNKSR1-202ENST00000374253 2538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
CLN6Q9NWW5 ESM1-201ENST00000381403 1326 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
CLN6Q9NWW5 GALNT14-201ENST00000324589 2169 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
CLN6Q9NWW5 SBF1P1-201ENST00000444527 5631 ntBASIC15□□□□□ -0.01
CLN6Q9NWW5 CMKLR1-206ENST00000552995 1890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
CLN6Q9NWW5 CXorf40A-209ENST00000441248 2411 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
CLN6Q9NWW5 CAMK2D-205ENST00000394524 5294 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
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CLN6Q9NWW5 SLX1A-201ENST00000251303 1091 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
CLN6Q9NWW5 SLX1B-201ENST00000330181 1165 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
CLN6Q9NWW5 ATPIF1-201ENST00000335514 494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
CLN6Q9NWW5 BOLA1-201ENST00000369150 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15□□□□□ -0.01
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CLN6Q9NWW5 PLAC8-202ENST00000411416 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
CLN6Q9NWW5 ICAM2-203ENST00000449662 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
CLN6Q9NWW5 TSSC2-201ENST00000450217 709 ntBASIC15□□□□□ -0.01
CLN6Q9NWW5 RPP14-206ENST00000466547 805 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15□□□□□ -0.01
CLN6Q9NWW5 AC113382.1-201ENST00000500267 1253 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
CLN6Q9NWW5 COX18-204ENST00000507544 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
CLN6Q9NWW5 AC021087.1-201ENST00000512642 522 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
CLN6Q9NWW5 CIB2-208ENST00000560618 804 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
CLN6Q9NWW5 TPSP2-201ENST00000561760 610 ntBASIC15□□□□□ -0.01
CLN6Q9NWW5 BLOC1S6-202ENST00000562384 494 ntTSL 4 BASIC15□□□□□ -0.01
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CLN6Q9NWW5 GNAS-AS1-203ENST00000598163 548 ntTSL 4 BASIC15□□□□□ -0.01
CLN6Q9NWW5 AC073592.4-201ENST00000623827 446 ntBASIC15□□□□□ -0.01
CLN6Q9NWW5 NPAS4-204ENST00000639555 878 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
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CLN6Q9NWW5 CHD4-201ENST00000357008 6496 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
CLN6Q9NWW5 EXT1-201ENST00000378204 8270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
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CLN6Q9NWW5 HGNC:18790-202ENST00000421177 4172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
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CLN6Q9NWW5 HOXA3-202ENST00000396352 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
CLN6Q9NWW5 PODNL1-204ENST00000538517 2744 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
CLN6Q9NWW5 LCK-206ENST00000373564 2137 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
CLN6Q9NWW5 AMZ1-201ENST00000312371 5516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
CLN6Q9NWW5 KIF18B-203ENST00000590129 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
CLN6Q9NWW5 CRY2-201ENST00000417225 2053 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
CLN6Q9NWW5 AC138969.1-205ENST00000381497 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
CLN6Q9NWW5 DGKZ-205ENST00000456247 3482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
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CLN6Q9NWW5 HSD17B10-201ENST00000168216 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
CLN6Q9NWW5 DGCR6-201ENST00000331444 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
CLN6Q9NWW5 NNAT-202ENST00000346199 1209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
CLN6Q9NWW5 TOR3A-201ENST00000352445 1182 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
CLN6Q9NWW5 GPX4-201ENST00000354171 919 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
CLN6Q9NWW5 SLC2A8-201ENST00000373352 914 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
CLN6Q9NWW5 RCN1P1-201ENST00000400413 996 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
CLN6Q9NWW5 POM121L3P-201ENST00000419331 1163 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
CLN6Q9NWW5 IGHV3-47-201ENST00000425060 335 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
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