Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRB3

CHST12, Carbohydrate sulfotransferase 12, humanhuman

Predictions only

Length 414 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHST12Q9NRB3 ZNF76-202ENST00000339411 2447 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
CHST12Q9NRB3 TCP11L2-201ENST00000299045 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
CHST12Q9NRB3 FAM109A-204ENST00000548163 2317 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
CHST12Q9NRB3 CACNA1A-253ENST00000637927 6847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
CHST12Q9NRB3 ABCB9-207ENST00000442833 2587 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
CHST12Q9NRB3 AC007541.1-201ENST00000570282 1469 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
CHST12Q9NRB3 ADIRF-AS1-201ENST00000418273 2627 ntTSL 3 BASIC17.65■□□□□ 0.42
CHST12Q9NRB3 FAM66C-209ENST00000544214 2623 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
CHST12Q9NRB3 EFNA4-201ENST00000359751 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
CHST12Q9NRB3 ASB12-201ENST00000362002 1289 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
CHST12Q9NRB3 GNG4-205ENST00000484517 684 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
CHST12Q9NRB3 CDK4-206ENST00000549606 558 ntTSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
CHST12Q9NRB3 AC044860.1-202ENST00000559481 777 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
CHST12Q9NRB3 TP53TG3HP-202ENST00000569755 579 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
CHST12Q9NRB3 ARMC7-205ENST00000584947 445 ntTSL 3 BASIC17.65■□□□□ 0.42
CHST12Q9NRB3 AC005523.1-201ENST00000598782 418 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
CHST12Q9NRB3 FHL2-205ENST00000393353 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
CHST12Q9NRB3 ITGB2-AS1-202ENST00000441379 2282 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
CHST12Q9NRB3 PRKACG-201ENST00000377276 1585 ntAPPRIS P1 BASIC17.65■□□□□ 0.42
CHST12Q9NRB3 PARP12-201ENST00000263549 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
CHST12Q9NRB3 MTMR14-203ENST00000353332 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
CHST12Q9NRB3 LGMN-202ENST00000393218 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
CHST12Q9NRB3 RPS9-207ENST00000441429 1600 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
CHST12Q9NRB3 AL391825.1-201ENST00000457671 1364 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
CHST12Q9NRB3 TRA2A-211ENST00000538367 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
CHST12Q9NRB3 MAP4K2-202ENST00000377350 2931 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
CHST12Q9NRB3 GCK-202ENST00000345378 2421 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.42
CHST12Q9NRB3 PLEKHG6-203ENST00000396988 2963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.42
CHST12Q9NRB3 TUBB8-201ENST00000561967 1413 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.42
CHST12Q9NRB3 RUBCNL-203ENST00000378787 2731 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.42
CHST12Q9NRB3 GNAS-212ENST00000371098 1719 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
CHST12Q9NRB3 ZNF584-209ENST00000599238 2288 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
CHST12Q9NRB3 FDPS-201ENST00000356657 1478 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
CHST12Q9NRB3 SRF-201ENST00000265354 4202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
CHST12Q9NRB3 GPAT3-202ENST00000395226 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
CHST12Q9NRB3 RAD51D-218ENST00000590016 1528 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
CHST12Q9NRB3 CDKN1B-201ENST00000228872 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
CHST12Q9NRB3 EIF4H-201ENST00000265753 2679 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
CHST12Q9NRB3 RPLP2-201ENST00000321153 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
CHST12Q9NRB3 MRPS6-201ENST00000399312 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
CHST12Q9NRB3 FO393414.2-201ENST00000405153 598 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
CHST12Q9NRB3 DNAJB6-209ENST00000443280 1159 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
CHST12Q9NRB3 LINC00473-201ENST00000444465 798 ntTSL 3 BASIC17.64■□□□□ 0.41
CHST12Q9NRB3 SLC35B4-204ENST00000470969 1033 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
CHST12Q9NRB3 PSEN2-206ENST00000472139 1163 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
CHST12Q9NRB3 SLC25A30-AS1-201ENST00000506633 701 ntTSL 3 BASIC17.64■□□□□ 0.41
CHST12Q9NRB3 SPATA8-AS1-201ENST00000558722 465 ntTSL 3 BASIC17.64■□□□□ 0.41
CHST12Q9NRB3 AL596325.1-201ENST00000563991 1082 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
CHST12Q9NRB3 AC015688.8-201ENST00000577746 656 ntTSL 4 BASIC17.64■□□□□ 0.41
CHST12Q9NRB3 PDLIM3-213ENST00000629667 1016 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
CHST12Q9NRB3 TAX1BP1-201ENST00000265393 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
CHST12Q9NRB3 DKFZP434K028-202ENST00000536405 2466 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
CHST12Q9NRB3 NMD3-202ENST00000460469 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
CHST12Q9NRB3 BEX4-202ENST00000372695 1328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
CHST12Q9NRB3 EIF2B3-210ENST00000620860 1923 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
CHST12Q9NRB3 PKM-216ENST00000565184 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
CHST12Q9NRB3 NSFL1C-206ENST00000476071 2800 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
CHST12Q9NRB3 SLC39A13-202ENST00000362021 2296 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
CHST12Q9NRB3 PSEN2-211ENST00000626989 1972 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
CHST12Q9NRB3 IGF2-204ENST00000381406 5179 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
CHST12Q9NRB3 SLC12A2-208ENST00000628403 3617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
CHST12Q9NRB3 ANXA4-202ENST00000409920 1414 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
CHST12Q9NRB3 SUZ12-204ENST00000580398 3977 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
CHST12Q9NRB3 RNF216P1-203ENST00000404404 2427 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
CHST12Q9NRB3 TRPV4-205ENST00000537083 2436 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
CHST12Q9NRB3 ZSWIM8-223ENST00000605216 6004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
CHST12Q9NRB3 SWAP70-202ENST00000447399 3538 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
CHST12Q9NRB3 RAPGEFL1-212ENST00000620260 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
CHST12Q9NRB3 KLK10-202ENST00000358789 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
CHST12Q9NRB3 NR2E1-202ENST00000368986 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
CHST12Q9NRB3 SCP2-213ENST00000528311 1896 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
CHST12Q9NRB3 ASIC3-203ENST00000357922 2232 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
CHST12Q9NRB3 GXYLT2-201ENST00000389617 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
CHST12Q9NRB3 RAB40C-205ENST00000539661 2609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.63■□□□□ 0.41
CHST12Q9NRB3 FICD-204ENST00000552695 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
CHST12Q9NRB3 DDX1-207ENST00000617198 2257 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
CHST12Q9NRB3 LTBP4-205ENST00000396819 4764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
CHST12Q9NRB3 TAAR5-201ENST00000258034 1014 ntAPPRIS P1 BASIC17.63■□□□□ 0.41
CHST12Q9NRB3 H1FOO-201ENST00000324382 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
CHST12Q9NRB3 RPUSD3-204ENST00000424438 1005 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
CHST12Q9NRB3 DFFBP1-201ENST00000433250 979 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
CHST12Q9NRB3 RASL12-203ENST00000434605 982 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
CHST12Q9NRB3 DLX2-AS1-201ENST00000448117 950 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
CHST12Q9NRB3 FAM92A-214ENST00000522324 1072 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
CHST12Q9NRB3 CCDC25-209ENST00000522915 785 ntTSL 3 BASIC17.63■□□□□ 0.41
CHST12Q9NRB3 AC004233.1-201ENST00000570515 608 ntTSL 4 BASIC17.63■□□□□ 0.41
CHST12Q9NRB3 VAT1-205ENST00000587173 1174 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
CHST12Q9NRB3 AL132655.2-201ENST00000596276 594 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
CHST12Q9NRB3 TMTC4-203ENST00000376234 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
CHST12Q9NRB3 GLRB-201ENST00000264428 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
CHST12Q9NRB3 SLC1A5-205ENST00000594991 2031 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
CHST12Q9NRB3 NADSYN1-201ENST00000319023 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
CHST12Q9NRB3 RSBN1-205ENST00000615321 2418 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
CHST12Q9NRB3 NOS3-210ENST00000484524 2537 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
CHST12Q9NRB3 OR6D1P-203ENST00000641209 4860 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
CHST12Q9NRB3 NPBWR2-201ENST00000369768 1352 ntAPPRIS P1 BASIC17.63■□□□□ 0.41
CHST12Q9NRB3 TRAPPC11-201ENST00000334690 4552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
CHST12Q9NRB3 CD1E-213ENST00000444681 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
CHST12Q9NRB3 HFE2-205ENST00000497365 1419 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
CHST12Q9NRB3 BORCS8-MEF2B-203ENST00000514819 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.7 ms