Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYQ3

KRTAP9-3, Keratin-associated protein 9-3, humanhuman

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Length 159 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRTAP9-3Q9BYQ3 HM13-202ENST00000340852 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
KRTAP9-3Q9BYQ3 AC068944.1-201ENST00000514855 1604 ntTSL 2 BASIC7.56□□□□□ -1.2
KRTAP9-3Q9BYQ3 GINM1-201ENST00000367419 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
KRTAP9-3Q9BYQ3 TRIM58-201ENST00000366481 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
KRTAP9-3Q9BYQ3 CD1E-212ENST00000368167 1458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
KRTAP9-3Q9BYQ3 LINC00221-202ENST00000619530 1499 ntTSL 2 BASIC7.55□□□□□ -1.2
KRTAP9-3Q9BYQ3 SLC25A48-201ENST00000274513 1880 ntTSL 2 BASIC7.55□□□□□ -1.2
KRTAP9-3Q9BYQ3 PALM3-201ENST00000340790 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.55□□□□□ -1.2
KRTAP9-3Q9BYQ3 HS3ST3A1-201ENST00000284110 2527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
KRTAP9-3Q9BYQ3 KLHL40-201ENST00000287777 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
KRTAP9-3Q9BYQ3 CCDC151-201ENST00000356392 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
KRTAP9-3Q9BYQ3 IDUA-210ENST00000514224 2130 ntTSL 2 BASIC7.55□□□□□ -1.2
KRTAP9-3Q9BYQ3 CCDC105-201ENST00000292574 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
KRTAP9-3Q9BYQ3 FBXO4-202ENST00000296812 1731 ntTSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
KRTAP9-3Q9BYQ3 TRIM46-209ENST00000543729 1703 ntTSL 5 BASIC7.55□□□□□ -1.2
KRTAP9-3Q9BYQ3 AL583722.1-201ENST00000540171 1307 ntTSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
KRTAP9-3Q9BYQ3 FTCDNL1-204ENST00000622774 1997 ntTSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
KRTAP9-3Q9BYQ3 MTMR12-201ENST00000264934 2215 ntTSL 2 BASIC7.55□□□□□ -1.2
KRTAP9-3Q9BYQ3 MVB12A-201ENST00000317040 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
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KRTAP9-3Q9BYQ3 SLC18A1-203ENST00000381608 1419 ntTSL 5 BASIC7.55□□□□□ -1.2
KRTAP9-3Q9BYQ3 AC002310.1-201ENST00000457283 1445 ntTSL 2 BASIC7.55□□□□□ -1.2
KRTAP9-3Q9BYQ3 SYT14P1-202ENST00000600441 1448 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
KRTAP9-3Q9BYQ3 LINC00574-201ENST00000420557 2318 ntTSL 2 BASIC7.55□□□□□ -1.2
KRTAP9-3Q9BYQ3 FOXRED2-203ENST00000397223 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
KRTAP9-3Q9BYQ3 AC068446.2-201ENST00000500487 2165 ntTSL 2 BASIC7.55□□□□□ -1.2
KRTAP9-3Q9BYQ3 RPS19-201ENST00000221975 500 ntTSL 3 BASIC7.55□□□□□ -1.2
KRTAP9-3Q9BYQ3 NMU-201ENST00000264218 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
KRTAP9-3Q9BYQ3 CCDC12-201ENST00000292314 1017 ntTSL 5 BASIC7.55□□□□□ -1.2
KRTAP9-3Q9BYQ3 ZNF138-201ENST00000307355 1141 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC7.55□□□□□ -1.2
KRTAP9-3Q9BYQ3 ANAPC10-201ENST00000309439 868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
KRTAP9-3Q9BYQ3 SPATC1L-202ENST00000330205 1182 ntTSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
KRTAP9-3Q9BYQ3 FAM86MP-201ENST00000340703 885 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
KRTAP9-3Q9BYQ3 Metazoa_SRP.4-201ENST00000366232 298 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
KRTAP9-3Q9BYQ3 S100A16-202ENST00000368704 1146 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.55□□□□□ -1.2
KRTAP9-3Q9BYQ3 SDHB-201ENST00000375499 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
KRTAP9-3Q9BYQ3 MRNIP-202ENST00000376931 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.55□□□□□ -1.2
KRTAP9-3Q9BYQ3 PIR-201ENST00000380420 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
KRTAP9-3Q9BYQ3 ATP5J-205ENST00000400094 589 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.55□□□□□ -1.2
KRTAP9-3Q9BYQ3 IFNL3-201ENST00000413851 656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
KRTAP9-3Q9BYQ3 RHCE-206ENST00000413854 1198 ntTSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
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KRTAP9-3Q9BYQ3 LINC00116-202ENST00000426713 461 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC7.55□□□□□ -1.2
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KRTAP9-3Q9BYQ3 AC103923.1-201ENST00000453229 1228 ntTSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
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KRTAP9-3Q9BYQ3 HSPB7-207ENST00000487046 844 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
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KRTAP9-3Q9BYQ3 AC139099.1-204ENST00000575205 425 ntTSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
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KRTAP9-3Q9BYQ3 MIR4525-201ENST00000580000 75 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
KRTAP9-3Q9BYQ3 AC135178.3-201ENST00000583963 531 ntTSL 4 BASIC7.55□□□□□ -1.2
KRTAP9-3Q9BYQ3 GADD45B-204ENST00000587345 765 ntTSL 2 BASIC7.55□□□□□ -1.2
KRTAP9-3Q9BYQ3 AC005253.2-201ENST00000593791 432 ntTSL 3 BASIC7.55□□□□□ -1.2
KRTAP9-3Q9BYQ3 RPS19-202ENST00000593863 526 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.55□□□□□ -1.2
KRTAP9-3Q9BYQ3 AC004597.1-201ENST00000595525 561 ntTSL 4 BASIC7.55□□□□□ -1.2
KRTAP9-3Q9BYQ3 AC116165.1-201ENST00000611806 668 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
KRTAP9-3Q9BYQ3 AC016911.1-201ENST00000613297 452 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
KRTAP9-3Q9BYQ3 AC123768.3-201ENST00000613733 523 ntTSL 3 BASIC7.55□□□□□ -1.2
KRTAP9-3Q9BYQ3 PDCD6-212ENST00000614778 1050 ntTSL 2 BASIC7.55□□□□□ -1.2
KRTAP9-3Q9BYQ3 HIST1H3I-201ENST00000616365 411 ntAPPRIS P1 BASIC7.55□□□□□ -1.2
KRTAP9-3Q9BYQ3 AL136981.2-201ENST00000617319 734 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
KRTAP9-3Q9BYQ3 AL035661.1-201ENST00000620459 1144 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
KRTAP9-3Q9BYQ3 DLG2-AS1_1.1-201ENST00000622319 213 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
KRTAP9-3Q9BYQ3 AC010435.1-201ENST00000623353 1177 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
KRTAP9-3Q9BYQ3 AC021766.1-201ENST00000624404 741 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
KRTAP9-3Q9BYQ3 AC004461.2-201ENST00000629517 803 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
KRTAP9-3Q9BYQ3 AL391650.2-201ENST00000640097 941 ntTSL 5 BASIC7.55□□□□□ -1.2
KRTAP9-3Q9BYQ3 PTRH1-204ENST00000419060 2692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.55□□□□□ -1.2
KRTAP9-3Q9BYQ3 PHKG2-201ENST00000328273 1536 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC7.55□□□□□ -1.2
KRTAP9-3Q9BYQ3 MRPS22-212ENST00000495075 1547 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
KRTAP9-3Q9BYQ3 AC012414.7-201ENST00000621235 1507 ntTSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
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