Protein–RNA interactions for Protein: Q9BRJ9

MESP1, Mesoderm posterior protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 268 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MESP1Q9BRJ9 AC015922.1-201ENST00000421102 1152 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
MESP1Q9BRJ9 CPLX2-206ENST00000512824 518 ntTSL 4 BASIC15.17■□□□□ 0.02
MESP1Q9BRJ9 TAGLN-206ENST00000530649 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
MESP1Q9BRJ9 AC123777.1-201ENST00000534827 1247 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
MESP1Q9BRJ9 PTHLH-206ENST00000538310 854 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
MESP1Q9BRJ9 NAA38-207ENST00000576861 556 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
MESP1Q9BRJ9 HIST1H3D-202ENST00000635200 948 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
MESP1Q9BRJ9 AC004840.1-201ENST00000636359 365 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
MESP1Q9BRJ9 SIPA1-201ENST00000394224 3628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
MESP1Q9BRJ9 U73166.1-201ENST00000439898 2625 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
MESP1Q9BRJ9 ZNFX1-203ENST00000371754 5235 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
MESP1Q9BRJ9 AJ239322.1-201ENST00000419362 2209 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
MESP1Q9BRJ9 SCARB2-223ENST00000640640 4608 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
MESP1Q9BRJ9 SNED1-202ENST00000342631 1930 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
MESP1Q9BRJ9 HNF1B-202ENST00000614313 1819 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
MESP1Q9BRJ9 HNF1B-203ENST00000617272 1820 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
MESP1Q9BRJ9 AL136982.4-201ENST00000437689 1740 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
MESP1Q9BRJ9 ANKMY1-202ENST00000361678 2499 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
MESP1Q9BRJ9 VKORC1L1-201ENST00000360768 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
MESP1Q9BRJ9 SARAF-201ENST00000256255 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
MESP1Q9BRJ9 AC112229.1-202ENST00000490013 2918 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
MESP1Q9BRJ9 NDUFS2-202ENST00000392179 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
MESP1Q9BRJ9 SMC4-201ENST00000344722 5356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
MESP1Q9BRJ9 TXNDC2-201ENST00000306084 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
MESP1Q9BRJ9 DNAJB8-AS1-201ENST00000471626 1798 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
MESP1Q9BRJ9 QRFP-202ENST00000623824 1658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
MESP1Q9BRJ9 MAEA-202ENST00000303400 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
MESP1Q9BRJ9 CFC1B-202ENST00000619050 1554 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
MESP1Q9BRJ9 TACC3-201ENST00000313288 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
MESP1Q9BRJ9 HGNC:18790-211ENST00000621129 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
MESP1Q9BRJ9 FAM181B-201ENST00000329203 3924 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
MESP1Q9BRJ9 MRPL16-201ENST00000300151 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
MESP1Q9BRJ9 OR52W1-201ENST00000311352 1114 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
MESP1Q9BRJ9 CCDC84-201ENST00000334418 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
MESP1Q9BRJ9 FCRLB-204ENST00000367946 1152 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
MESP1Q9BRJ9 CIB3-202ENST00000379859 467 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
MESP1Q9BRJ9 NQO2-203ENST00000380441 1021 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
MESP1Q9BRJ9 CSHL1-204ENST00000392824 823 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
MESP1Q9BRJ9 CENPM-206ENST00000407253 818 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
MESP1Q9BRJ9 C2orf76-202ENST00000409466 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
MESP1Q9BRJ9 EFHD1-202ENST00000409613 1156 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
MESP1Q9BRJ9 RNF183-202ENST00000416588 849 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
MESP1Q9BRJ9 AC073283.1-201ENST00000421759 860 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
MESP1Q9BRJ9 IQCF3-201ENST00000437810 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
MESP1Q9BRJ9 TMEM120A-203ENST00000439537 1161 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
MESP1Q9BRJ9 LINC01160-201ENST00000441004 768 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
MESP1Q9BRJ9 CD28-203ENST00000458610 705 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
MESP1Q9BRJ9 AC002310.2-201ENST00000486926 950 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
MESP1Q9BRJ9 TERF1P3-201ENST00000505638 1227 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
MESP1Q9BRJ9 SLC25A30-AS1-201ENST00000506633 701 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
MESP1Q9BRJ9 LY6E-204ENST00000519546 971 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
MESP1Q9BRJ9 TMEM5-AS1-201ENST00000546214 563 ntTSL 4 BASIC15.16■□□□□ 0.02
MESP1Q9BRJ9 AL512361.1-201ENST00000554200 418 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
MESP1Q9BRJ9 AC012173.1-201ENST00000567942 430 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
MESP1Q9BRJ9 AC067852.1-201ENST00000585572 594 ntTSL 4 BASIC15.16■□□□□ 0.02
MESP1Q9BRJ9 PCDHA14-201ENST00000506751 2298 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
MESP1Q9BRJ9 ABCG5-201ENST00000260645 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
MESP1Q9BRJ9 PNKD-202ENST00000258362 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
MESP1Q9BRJ9 SPAG9-202ENST00000357122 4761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
MESP1Q9BRJ9 FBLIM1-206ENST00000441801 1543 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
MESP1Q9BRJ9 C2orf48-201ENST00000381786 1897 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
MESP1Q9BRJ9 MANSC1-201ENST00000396349 2220 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
MESP1Q9BRJ9 TMEM161A-206ENST00000587583 1654 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
MESP1Q9BRJ9 GRAMD4P3-201ENST00000621665 1669 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
MESP1Q9BRJ9 TOM1-210ENST00000449058 2389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
MESP1Q9BRJ9 FNDC5-201ENST00000373471 2732 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
MESP1Q9BRJ9 KCNB1-203ENST00000635465 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
MESP1Q9BRJ9 SGPP1-201ENST00000247225 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
MESP1Q9BRJ9 PRKACG-201ENST00000377276 1585 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
MESP1Q9BRJ9 PCDHA2-201ENST00000378132 2626 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
MESP1Q9BRJ9 GAL3ST1-203ENST00000402321 1908 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
MESP1Q9BRJ9 MIB2-217ENST00000504599 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
MESP1Q9BRJ9 MPP5-201ENST00000261681 5552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
MESP1Q9BRJ9 SLC29A2-202ENST00000357440 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
MESP1Q9BRJ9 SLC29A2-205ENST00000544554 2505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
MESP1Q9BRJ9 CYP21A2-221ENST00000418967 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
MESP1Q9BRJ9 CD24-201ENST00000606017 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
MESP1Q9BRJ9 TLE2-202ENST00000426948 2406 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
MESP1Q9BRJ9 SYNC-202ENST00000409190 3398 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
MESP1Q9BRJ9 C1orf56-201ENST00000368926 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
MESP1Q9BRJ9 PPAN-P2RY11-202ENST00000428358 2661 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
MESP1Q9BRJ9 CD276-213ENST00000561213 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
MESP1Q9BRJ9 TCF3-212ENST00000588136 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
MESP1Q9BRJ9 PLA2R1-202ENST00000392771 5160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
MESP1Q9BRJ9 LINC01144-201ENST00000626198 1710 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
MESP1Q9BRJ9 ATP2A3-201ENST00000309890 4826 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
MESP1Q9BRJ9 DUSP18-206ENST00000407308 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
MESP1Q9BRJ9 ARID1A-201ENST00000324856 8577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
MESP1Q9BRJ9 TFRC-202ENST00000392396 5032 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
MESP1Q9BRJ9 EBI3-201ENST00000221847 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
MESP1Q9BRJ9 ENDOV-201ENST00000323854 1226 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
MESP1Q9BRJ9 AGER-204ENST00000375067 1250 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
MESP1Q9BRJ9 RBM3-202ENST00000376755 1130 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
MESP1Q9BRJ9 PSMB8-203ENST00000395339 1025 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
MESP1Q9BRJ9 ZDHHC20-IT1-201ENST00000417513 440 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
MESP1Q9BRJ9 AC093702.1-201ENST00000423433 367 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
MESP1Q9BRJ9 AC099552.3-201ENST00000454149 367 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
MESP1Q9BRJ9 SNRK-204ENST00000454177 2961 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
MESP1Q9BRJ9 SLC30A5-203ENST00000502979 681 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
MESP1Q9BRJ9 AC137894.1-201ENST00000526431 547 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.9 ms