Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQ16

SPOCK3, Testican-3, humanhuman

Predictions only

Length 436 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPOCK3Q9BQ16 RPS5-201ENST00000196551 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
SPOCK3Q9BQ16 SOD1-201ENST00000270142 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
SPOCK3Q9BQ16 BANF1-201ENST00000312175 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
SPOCK3Q9BQ16 RPLP2-201ENST00000321153 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
SPOCK3Q9BQ16 ECSIT-203ENST00000417981 970 ntTSL 2 BASIC14.21□□□□□ -0.13
SPOCK3Q9BQ16 RALY-AS1-203ENST00000440595 660 ntTSL 3 BASIC14.21□□□□□ -0.13
SPOCK3Q9BQ16 AC092910.3-201ENST00000484076 969 ntTSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
SPOCK3Q9BQ16 ELK1P1-201ENST00000485699 580 ntBASIC14.21□□□□□ -0.13
SPOCK3Q9BQ16 SPDYE18-201ENST00000510091 1050 ntBASIC14.21□□□□□ -0.13
SPOCK3Q9BQ16 NME2-206ENST00000513177 692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.21□□□□□ -0.13
SPOCK3Q9BQ16 AC009446.1-201ENST00000519840 808 ntTSL 2 BASIC14.21□□□□□ -0.13
SPOCK3Q9BQ16 AC008115.1-201ENST00000542291 150 ntTSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
SPOCK3Q9BQ16 AC034102.5-201ENST00000548731 540 ntTSL 4 BASIC14.21□□□□□ -0.13
SPOCK3Q9BQ16 NAA38-207ENST00000576861 556 ntTSL 3 BASIC14.21□□□□□ -0.13
SPOCK3Q9BQ16 MIR4259-201ENST00000584466 101 ntBASIC14.21□□□□□ -0.13
SPOCK3Q9BQ16 RAMP2-202ENST00000587142 549 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
SPOCK3Q9BQ16 RAMP2-203ENST00000588576 573 ntTSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.13
SPOCK3Q9BQ16 C19orf70-206ENST00000590389 769 ntTSL 3 BASIC14.21□□□□□ -0.13
SPOCK3Q9BQ16 AC015936.2-201ENST00000593177 259 ntBASIC14.21□□□□□ -0.13
SPOCK3Q9BQ16 AC012183.1-201ENST00000625197 499 ntBASIC14.21□□□□□ -0.13
SPOCK3Q9BQ16 AL160035.1-201ENST00000637583 576 ntTSL 4 BASIC14.21□□□□□ -0.13
SPOCK3Q9BQ16 DNAJB9-201ENST00000249356 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
SPOCK3Q9BQ16 FAM178B-204ENST00000490605 2710 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.13
SPOCK3Q9BQ16 LAD1-201ENST00000367313 2336 ntTSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
SPOCK3Q9BQ16 TMEM120A-201ENST00000417509 1444 ntTSL 2 BASIC14.21□□□□□ -0.13
SPOCK3Q9BQ16 LMF1-AS1-202ENST00000569574 1408 ntTSL 3 BASIC14.21□□□□□ -0.13
SPOCK3Q9BQ16 TBC1D2-202ENST00000375063 2100 ntTSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
SPOCK3Q9BQ16 NME9-203ENST00000383180 2133 ntTSL 2 BASIC14.21□□□□□ -0.13
SPOCK3Q9BQ16 NPNT-203ENST00000427316 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.21□□□□□ -0.13
SPOCK3Q9BQ16 SYNGAP1-202ENST00000418600 5828 ntTSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.14
SPOCK3Q9BQ16 QRICH1-202ENST00000395443 3549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
SPOCK3Q9BQ16 PMAIP1-202ENST00000316660 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
SPOCK3Q9BQ16 TNFAIP8L3-201ENST00000327536 2262 ntTSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
SPOCK3Q9BQ16 KRT81-201ENST00000327741 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
SPOCK3Q9BQ16 U73166.1-201ENST00000439898 2625 ntTSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
SPOCK3Q9BQ16 ALDH3A1-206ENST00000457500 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
SPOCK3Q9BQ16 RAB11FIP5-205ENST00000486777 6120 ntTSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.14
SPOCK3Q9BQ16 PRPSAP2-216ENST00000536323 1872 ntTSL 2 BASIC14.21□□□□□ -0.14
SPOCK3Q9BQ16 ADAM15-205ENST00000360674 2732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
SPOCK3Q9BQ16 BANP-223ENST00000538234 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
SPOCK3Q9BQ16 MYO1D-201ENST00000318217 5563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
SPOCK3Q9BQ16 NEUROD2-201ENST00000302584 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
SPOCK3Q9BQ16 ACAP1-201ENST00000158762 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
SPOCK3Q9BQ16 GLUL-202ENST00000331872 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
SPOCK3Q9BQ16 FBXL17-201ENST00000359660 4510 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
SPOCK3Q9BQ16 AC108860.2-201ENST00000562760 2183 ntBASIC14.2□□□□□ -0.14
SPOCK3Q9BQ16 GPS1-201ENST00000306823 1842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
SPOCK3Q9BQ16 AHR-201ENST00000242057 6276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
SPOCK3Q9BQ16 AC084018.2-201ENST00000613093 2607 ntBASIC14.2□□□□□ -0.14
SPOCK3Q9BQ16 FAF1-202ENST00000396153 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
SPOCK3Q9BQ16 GBGT1-208ENST00000540636 1934 ntTSL 2 BASIC14.2□□□□□ -0.14
SPOCK3Q9BQ16 ABALON-201ENST00000629058 1903 ntBASIC14.2□□□□□ -0.14
SPOCK3Q9BQ16 NIPAL2-202ENST00000430223 4496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
SPOCK3Q9BQ16 GPR132-202ENST00000392585 2887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
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SPOCK3Q9BQ16 AKIP1-204ENST00000396648 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.2□□□□□ -0.14
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SPOCK3Q9BQ16 TEX26-AS1-201ENST00000411835 1203 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
SPOCK3Q9BQ16 LINC01784-201ENST00000438401 378 ntTSL 2 BASIC14.2□□□□□ -0.14
SPOCK3Q9BQ16 FAM25G-201ENST00000452267 345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
SPOCK3Q9BQ16 PACS1-203ENST00000524815 628 ntTSL 4 BASIC14.2□□□□□ -0.14
SPOCK3Q9BQ16 KBTBD4-203ENST00000525720 980 ntTSL 3 BASIC14.2□□□□□ -0.14
SPOCK3Q9BQ16 AL096870.1-201ENST00000555591 930 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.2□□□□□ -0.14
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SPOCK3Q9BQ16 CTBP2P3-201ENST00000585629 1255 ntBASIC14.2□□□□□ -0.14
SPOCK3Q9BQ16 MIR6069-201ENST00000620069 79 ntBASIC14.2□□□□□ -0.14
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SPOCK3Q9BQ16 APH1A-202ENST00000360244 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
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SPOCK3Q9BQ16 STX16-NPEPL1-202ENST00000530122 3433 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
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SPOCK3Q9BQ16 AC068446.2-201ENST00000500487 2165 ntTSL 2 BASIC14.2□□□□□ -0.14
SPOCK3Q9BQ16 ZNF140-210ENST00000544426 2340 ntTSL 2 BASIC14.2□□□□□ -0.14
SPOCK3Q9BQ16 GGT7-201ENST00000336431 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
SPOCK3Q9BQ16 ARHGEF28-212ENST00000513042 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
SPOCK3Q9BQ16 B9D1-209ENST00000477478 1353 ntTSL 3 BASIC14.2□□□□□ -0.14
SPOCK3Q9BQ16 AC012414.7-201ENST00000621235 1507 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
SPOCK3Q9BQ16 PLCG1-201ENST00000244007 5285 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
SPOCK3Q9BQ16 TXNRD3-203ENST00000524230 2950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
SPOCK3Q9BQ16 GPC2-201ENST00000292377 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
SPOCK3Q9BQ16 AIFM3-202ENST00000399167 2387 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.19□□□□□ -0.14
SPOCK3Q9BQ16 PRKAG1-206ENST00000548065 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
SPOCK3Q9BQ16 LINC00538-201ENST00000626109 1906 ntBASIC14.19□□□□□ -0.14
SPOCK3Q9BQ16 EPHA2-201ENST00000358432 3964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
SPOCK3Q9BQ16 PRR18-201ENST00000322583 3084 ntAPPRIS P2 BASIC14.19□□□□□ -0.14
SPOCK3Q9BQ16 WWP1-202ENST00000517970 4686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
SPOCK3Q9BQ16 EVPL-202ENST00000586740 6223 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
SPOCK3Q9BQ16 CTSB-204ENST00000453527 2011 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.19□□□□□ -0.14
SPOCK3Q9BQ16 NR2E3-204ENST00000621736 2032 ntTSL 2 BASIC14.19□□□□□ -0.14
SPOCK3Q9BQ16 BAZ1A-203ENST00000382422 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
SPOCK3Q9BQ16 ARSI-201ENST00000328668 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
SPOCK3Q9BQ16 SLC35A1-202ENST00000369556 1720 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
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