Protein–RNA interactions for Protein: Q99674

CGREF1, Cell growth regulator with EF hand domain protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 301 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CGREF1Q99674 MEAF6-201ENST00000296214 1525 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CGREF1Q99674 CD83-201ENST00000379153 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CGREF1Q99674 ATP6AP2-201ENST00000378438 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CGREF1Q99674 ADGRE2-208ENST00000595839 2046 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CGREF1Q99674 BICD1-205ENST00000550207 1328 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CGREF1Q99674 SH2D3C-206ENST00000429553 2794 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CGREF1Q99674 KIAA1755-206ENST00000496900 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CGREF1Q99674 ILF3-210ENST00000588657 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CGREF1Q99674 GOLGA8DP-202ENST00000341390 2184 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
CGREF1Q99674 CCT7-216ENST00000540468 1674 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CGREF1Q99674 AC016027.1-202ENST00000607927 1699 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
CGREF1Q99674 PPP1R26-206ENST00000605660 4502 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CGREF1Q99674 NTRK3-203ENST00000357724 2980 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CGREF1Q99674 PRR30-202ENST00000432962 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CGREF1Q99674 STAT1-202ENST00000392322 2716 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CGREF1Q99674 KIF18B-204ENST00000593135 2745 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CGREF1Q99674 C19orf68-203ENST00000614654 3588 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CGREF1Q99674 GALNT9-202ENST00000397325 1727 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CGREF1Q99674 AC005622.1-201ENST00000636801 1703 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
CGREF1Q99674 PA2G4-201ENST00000303305 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CGREF1Q99674 RBFOX1-212ENST00000550418 4775 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CGREF1Q99674 SHTN1-201ENST00000260777 5308 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CGREF1Q99674 AKAP1-202ENST00000337714 3970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CGREF1Q99674 XPO5-201ENST00000265351 5364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CGREF1Q99674 CFLAR-204ENST00000341582 2056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CGREF1Q99674 SYT3-201ENST00000338916 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CGREF1Q99674 NANS-201ENST00000210444 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CGREF1Q99674 AP4S1-202ENST00000313566 839 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CGREF1Q99674 CLCNKB-201ENST00000375667 2129 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CGREF1Q99674 CRELD2-202ENST00000403427 1242 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CGREF1Q99674 NPY-203ENST00000407573 705 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CGREF1Q99674 LSM5-204ENST00000409909 740 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CGREF1Q99674 TMEM139-205ENST00000410004 2114 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CGREF1Q99674 SEC61G-203ENST00000415949 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CGREF1Q99674 C16orf91-201ENST00000442039 978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CGREF1Q99674 FGFR3P6-201ENST00000457012 610 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
CGREF1Q99674 RBPMS-AS1-202ENST00000519753 1031 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CGREF1Q99674 LINC00596-201ENST00000559615 937 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CGREF1Q99674 WT1-AS_2.1-201ENST00000613208 137 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
CGREF1Q99674 AC027682.6-202ENST00000621378 795 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CGREF1Q99674 AC005906.2-206ENST00000638180 1029 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CGREF1Q99674 AC005064.1-201ENST00000422488 2725 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CGREF1Q99674 KIAA0319L-201ENST00000325722 4789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CGREF1Q99674 PPP1R26-202ENST00000401470 4769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CGREF1Q99674 NDOR1-202ENST00000371521 2497 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CGREF1Q99674 AC129492.6-201ENST00000611383 1305 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
CGREF1Q99674 ZXDC-202ENST00000389709 3405 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CGREF1Q99674 RUSC1-209ENST00000471876 1749 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CGREF1Q99674 BCL11A-203ENST00000358510 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CGREF1Q99674 RFK-201ENST00000376736 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CGREF1Q99674 NECAP2-201ENST00000337132 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CGREF1Q99674 KAT7-213ENST00000510819 1769 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CGREF1Q99674 VIPR2-202ENST00000377633 1491 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CGREF1Q99674 PHB-201ENST00000300408 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CGREF1Q99674 UCKL1-201ENST00000354216 1837 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CGREF1Q99674 FRMPD4-201ENST00000380682 8465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CGREF1Q99674 TBXAS1-201ENST00000336425 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CGREF1Q99674 MYH14-204ENST00000440075 4247 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CGREF1Q99674 TNKS1BP1-201ENST00000358252 5795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CGREF1Q99674 STX10-201ENST00000242770 1099 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CGREF1Q99674 ARMC10P1-201ENST00000313754 855 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
CGREF1Q99674 CLDN14-205ENST00000399139 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CGREF1Q99674 POM121L12-201ENST00000408890 1283 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CGREF1Q99674 AC134772.1-202ENST00000435578 549 ntTSL 4 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CGREF1Q99674 CT47A11-201ENST00000457020 1294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CGREF1Q99674 AC106771.1-201ENST00000502209 372 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CGREF1Q99674 FIBP-212ENST00000533045 1173 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CGREF1Q99674 STX10-204ENST00000587230 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CGREF1Q99674 Metazoa_SRP.33-201ENST00000613468 285 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
CGREF1Q99674 PHOSPHO2-207ENST00000616524 1253 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CGREF1Q99674 XPO1-201ENST00000401558 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CGREF1Q99674 SLC4A2-214ENST00000485713 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CGREF1Q99674 CICP13-201ENST00000422015 2789 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
CGREF1Q99674 MAGI3-204ENST00000369617 3911 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CGREF1Q99674 GJA8-201ENST00000369235 1302 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CGREF1Q99674 IGLL5-203ENST00000532223 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CGREF1Q99674 GRID2IP-201ENST00000435185 3215 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CGREF1Q99674 PAPOLA-223ENST00000557320 3264 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CGREF1Q99674 IRF8-203ENST00000563180 1394 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CGREF1Q99674 CNOT10-202ENST00000331889 2573 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CGREF1Q99674 COL18A1-203ENST00000359759 6586 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CGREF1Q99674 TMEM51-202ENST00000376014 1843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CGREF1Q99674 CDC25B-203ENST00000344256 3071 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CGREF1Q99674 POU2F2-207ENST00000529067 2657 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CGREF1Q99674 USP42-201ENST00000306177 5155 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CGREF1Q99674 CYLD-202ENST00000398568 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CGREF1Q99674 UBAP1-201ENST00000297661 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CGREF1Q99674 IL3RA-202ENST00000381469 1476 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CGREF1Q99674 PLVAP-201ENST00000252590 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CGREF1Q99674 HSPA12B-201ENST00000254963 3151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CGREF1Q99674 HPCAL1-208ENST00000622018 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
CGREF1Q99674 ELFN1-202ENST00000561626 3742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
CGREF1Q99674 ATP6AP2-215ENST00000636409 1962 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
CGREF1Q99674 LDLR-204ENST00000545707 2429 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
CGREF1Q99674 TBC1D1-203ENST00000402522 1567 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
CGREF1Q99674 ATP6V1C2-204ENST00000635370 1578 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
CGREF1Q99674 MDFIC-202ENST00000393486 4393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
CGREF1Q99674 NDRG2-211ENST00000397858 2054 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
CGREF1Q99674 RNF168-201ENST00000318037 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
CGREF1Q99674 CRAMP1-202ENST00000397412 7772 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.2 ms