Protein–RNA interactions for Protein: Q99417

MYCBP, c-Myc-binding protein, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 103 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MYCBPQ99417 LMO4-201ENST00000370542 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
MYCBPQ99417 CHPF-202ENST00000373891 1079 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
MYCBPQ99417 NME1-203ENST00000393196 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
MYCBPQ99417 LINC01315-202ENST00000424852 1142 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
MYCBPQ99417 MEAF6-205ENST00000448519 666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
MYCBPQ99417 ZNF706-206ENST00000519744 785 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
MYCBPQ99417 SIVA1-207ENST00000556195 674 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
MYCBPQ99417 APIP-201ENST00000395787 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
MYCBPQ99417 SSBP3-203ENST00000371319 1578 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
MYCBPQ99417 ACP6-201ENST00000392988 1555 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
MYCBPQ99417 TUBA3C-201ENST00000400113 1551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
MYCBPQ99417 LGALS12-201ENST00000255684 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
MYCBPQ99417 HLA-A-202ENST00000376806 1854 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
MYCBPQ99417 PCSK2-205ENST00000536609 2275 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
MYCBPQ99417 SGK2-201ENST00000341458 2498 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
MYCBPQ99417 FFAR4-202ENST00000371483 3653 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
MYCBPQ99417 GAD2-203ENST00000376261 5858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
MYCBPQ99417 ITSN1-212ENST00000399367 5722 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
MYCBPQ99417 RNF145-212ENST00000611185 3624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
MYCBPQ99417 GDPD5-201ENST00000336898 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
MYCBPQ99417 USP28-214ENST00000545540 3431 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
MYCBPQ99417 AMPD2-219ENST00000528667 3134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
MYCBPQ99417 YY1AP1-201ENST00000295566 2626 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
MYCBPQ99417 AAR2-201ENST00000320849 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
MYCBPQ99417 C5AR1-201ENST00000355085 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
MYCBPQ99417 AC036214.1-201ENST00000502766 2126 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
MYCBPQ99417 MFGE8-201ENST00000268150 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
MYCBPQ99417 NUP62-212ENST00000597723 1824 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
MYCBPQ99417 GPS1-226ENST00000623691 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
MYCBPQ99417 FBXL20-205ENST00000583610 1739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
MYCBPQ99417 MACF1-233ENST00000602421 1423 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
MYCBPQ99417 IKBKB-217ENST00000520810 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
MYCBPQ99417 STRA6-203ENST00000416286 2750 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
MYCBPQ99417 ZNF782-205ENST00000481138 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
MYCBPQ99417 ATP11B-201ENST00000323116 7325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
MYCBPQ99417 SUOX-201ENST00000266971 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
MYCBPQ99417 RABL2A-204ENST00000393167 2179 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
MYCBPQ99417 ETV3L-201ENST00000454449 1976 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
MYCBPQ99417 ANHX-201ENST00000419717 1765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
MYCBPQ99417 AC138969.2-201ENST00000532739 9932 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
MYCBPQ99417 FCER2-201ENST00000346664 1596 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
MYCBPQ99417 FCER2-205ENST00000597921 1560 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
MYCBPQ99417 RFX1-201ENST00000254325 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
MYCBPQ99417 RGS9-210ENST00000635833 2308 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
MYCBPQ99417 PDXDC2P-202ENST00000527016 543 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
MYCBPQ99417 LINC01301-204ENST00000530725 577 ntTSL 4 BASIC15.93■□□□□ 0.14
MYCBPQ99417 SIDT2-217ENST00000532062 2143 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
MYCBPQ99417 TSG101-204ENST00000536719 2101 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
MYCBPQ99417 ETV4-203ENST00000538265 2147 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
MYCBPQ99417 BX088651.1-201ENST00000540551 451 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
MYCBPQ99417 TGIF1-222ENST00000577543 729 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
MYCBPQ99417 TRAPPC5-203ENST00000595985 411 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
MYCBPQ99417 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
MYCBPQ99417 AC005885.1-204ENST00000637885 2885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
MYCBPQ99417 AMT-221ENST00000538581 2038 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
MYCBPQ99417 DNASE1L1-206ENST00000393638 2665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
MYCBPQ99417 WWOX-203ENST00000406884 1701 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
MYCBPQ99417 HOXA11-AS-205ENST00000522863 1723 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
MYCBPQ99417 RHPN1-201ENST00000289013 3683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
MYCBPQ99417 ACP5-201ENST00000218758 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
MYCBPQ99417 IL34-201ENST00000288098 1607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
MYCBPQ99417 CHRNA7-201ENST00000306901 6181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
MYCBPQ99417 BEAN1-201ENST00000299694 2160 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
MYCBPQ99417 CIAPIN1-201ENST00000394391 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
MYCBPQ99417 FAM49B-223ENST00000522746 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
MYCBPQ99417 BCL2L11-201ENST00000308659 1522 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
MYCBPQ99417 PHLDB1-223ENST00000600882 5479 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
MYCBPQ99417 SLC35A2-217ENST00000635589 1424 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
MYCBPQ99417 TMEM212-201ENST00000334567 1881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
MYCBPQ99417 STX16-NPEPL1-202ENST00000530122 3433 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
MYCBPQ99417 NAPA-AS1-201ENST00000593284 1753 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
MYCBPQ99417 RGS3-210ENST00000462143 2759 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
MYCBPQ99417 KIF1C-201ENST00000320785 7919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
MYCBPQ99417 ZSCAN25-201ENST00000262941 1652 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
MYCBPQ99417 FAM72B-207ENST00000619376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
MYCBPQ99417 KRBA2-202ENST00000396267 2562 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
MYCBPQ99417 FCGRT-202ENST00000426395 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
MYCBPQ99417 MAPT-201ENST00000262410 6762 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
MYCBPQ99417 AC092053.1-201ENST00000605787 1936 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
MYCBPQ99417 NR1H2-202ENST00000411902 1466 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
MYCBPQ99417 AC013726.1-201ENST00000563747 2285 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
MYCBPQ99417 GPS2-201ENST00000380728 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
MYCBPQ99417 CNKSR1-202ENST00000374253 2538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
MYCBPQ99417 IL3RA-201ENST00000331035 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
MYCBPQ99417 ASB10-202ENST00000377867 1738 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
MYCBPQ99417 CRYBG1-204ENST00000633556 9909 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
MYCBPQ99417 COL11A2-202ENST00000361917 6104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
MYCBPQ99417 MPG-201ENST00000219431 1193 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
MYCBPQ99417 AL050404.1-201ENST00000424566 802 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
MYCBPQ99417 AL355355.2-201ENST00000442321 338 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
MYCBPQ99417 ADAMTS19-AS1-201ENST00000502827 786 ntTSL 4 BASIC15.92■□□□□ 0.14
MYCBPQ99417 UBE2K-204ENST00000503368 891 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
MYCBPQ99417 TK2-204ENST00000525974 1178 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
MYCBPQ99417 GRAMD1B-209ENST00000533341 707 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
MYCBPQ99417 CR769767.2-201ENST00000622735 460 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
MYCBPQ99417 DLGAP4-205ENST00000401952 4881 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
MYCBPQ99417 DNM2-204ENST00000408974 3013 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
MYCBPQ99417 GDAP1L1-207ENST00000612599 2585 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
MYCBPQ99417 PRF1-201ENST00000373209 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
MYCBPQ99417 MBD1-210ENST00000457839 2473 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.5 ms