Protein–RNA interactions for Protein: Q96M83

CCDC7, Coiled-coil domain-containing protein 7, humanhuman

Predictions only

Length 1,385 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC7Q96M83 SH3BP5-202ENST00000383791 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CCDC7Q96M83 GPR176-205ENST00000561100 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CCDC7Q96M83 EGLN2-207ENST00000593726 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CCDC7Q96M83 CYP21A2-221ENST00000418967 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CCDC7Q96M83 MIB2-202ENST00000378708 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CCDC7Q96M83 KRT73-201ENST00000305748 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CCDC7Q96M83 DXO-203ENST00000375356 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CCDC7Q96M83 LEF1-201ENST00000265165 3068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CCDC7Q96M83 ZNF418-208ENST00000599852 2501 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CCDC7Q96M83 ZMYND12-201ENST00000372565 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CCDC7Q96M83 LRRC20-206ENST00000395011 2903 ntTSL 4 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CCDC7Q96M83 TSHZ3-201ENST00000240587 5176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CCDC7Q96M83 GFM1-208ENST00000478576 2147 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CCDC7Q96M83 ATP11A-AS1-201ENST00000446442 2192 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CCDC7Q96M83 LINC00942-201ENST00000515614 2417 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CCDC7Q96M83 CKS1B-202ENST00000368436 820 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CCDC7Q96M83 ZDHHC20-IT1-201ENST00000417513 440 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CCDC7Q96M83 AC125807.1-201ENST00000483097 614 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
CCDC7Q96M83 SLC50A1-209ENST00000484157 886 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CCDC7Q96M83 PUDP-206ENST00000540122 825 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CCDC7Q96M83 GNAO1-210ENST00000569295 930 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CCDC7Q96M83 RN7SL204P-201ENST00000582831 262 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
CCDC7Q96M83 ZDHHC11-209ENST00000511539 1303 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CCDC7Q96M83 ZDHHC11B-204ENST00000622126 1301 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CCDC7Q96M83 NFYC-210ENST00000425457 1536 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CCDC7Q96M83 REPS1-201ENST00000258062 3161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CCDC7Q96M83 THOP1-201ENST00000307741 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CCDC7Q96M83 AC069224.1-201ENST00000566372 1715 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
CCDC7Q96M83 TSPEAR-202ENST00000397916 2114 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CCDC7Q96M83 BAIAP2-219ENST00000575245 2229 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CCDC7Q96M83 LINC02199-201ENST00000506655 2702 ntBASIC22.7■■□□□ 1.23
CCDC7Q96M83 PLBD2-201ENST00000280800 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CCDC7Q96M83 BCL2-203ENST00000589955 5011 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
CCDC7Q96M83 MRPL53-201ENST00000258105 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CCDC7Q96M83 BTBD1-201ENST00000261721 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CCDC7Q96M83 ZNF524-201ENST00000301073 1102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CCDC7Q96M83 PPP1R27-201ENST00000330261 782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CCDC7Q96M83 LRRC37A5P-201ENST00000374304 1103 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CCDC7Q96M83 CENPM-205ENST00000404067 905 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CCDC7Q96M83 NFIC-203ENST00000443272 1716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CCDC7Q96M83 FAM207CP-201ENST00000443486 507 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
CCDC7Q96M83 EIF2B4-206ENST00000451130 1633 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CCDC7Q96M83 TMEM176A-202ENST00000461345 635 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CCDC7Q96M83 RAB9A-202ENST00000464506 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CCDC7Q96M83 OARD1-208ENST00000469104 704 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CCDC7Q96M83 AL391335.1-201ENST00000504583 535 ntTSL 4 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CCDC7Q96M83 AC005225.4-201ENST00000557330 545 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
CCDC7Q96M83 AC027088.1-201ENST00000557966 1117 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CCDC7Q96M83 AC140878.1-201ENST00000565277 250 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
CCDC7Q96M83 AP000842.3-202ENST00000569238 1080 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
CCDC7Q96M83 C1QTNF1-208ENST00000580474 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CCDC7Q96M83 AC022188.1-201ENST00000620960 1664 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
CCDC7Q96M83 OARD1-216ENST00000628419 1188 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CCDC7Q96M83 AC020934.3-201ENST00000639810 348 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CCDC7Q96M83 CLIP2-201ENST00000223398 5563 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CCDC7Q96M83 TM9SF1-201ENST00000261789 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CCDC7Q96M83 MBD4-203ENST00000429544 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CCDC7Q96M83 PSMF1-201ENST00000246015 2042 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CCDC7Q96M83 LINC01660-203ENST00000618517 1859 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CCDC7Q96M83 PARVB-210ENST00000619710 1530 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CCDC7Q96M83 CHST10-201ENST00000264249 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CCDC7Q96M83 CD300LG-204ENST00000539718 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CCDC7Q96M83 TPM2-201ENST00000329305 1018 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CCDC7Q96M83 MIR346-201ENST00000362234 95 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
CCDC7Q96M83 MIR648-201ENST00000385046 94 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
CCDC7Q96M83 AC016735.2-201ENST00000438736 569 ntTSL 4 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CCDC7Q96M83 AP001471.1-201ENST00000454245 672 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CCDC7Q96M83 AC123777.1-201ENST00000534827 1247 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CCDC7Q96M83 CERNA1-201ENST00000559779 908 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CCDC7Q96M83 AC006116.8-201ENST00000587004 987 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CCDC7Q96M83 MOB3A-209ENST00000592280 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CCDC7Q96M83 BCL2L12-206ENST00000598306 510 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CCDC7Q96M83 RBP1-207ENST00000619087 516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CCDC7Q96M83 HFE2-206ENST00000634927 506 ntTSL 4 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CCDC7Q96M83 AC084121.4-201ENST00000641598 221 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
CCDC7Q96M83 AF228730.8-201ENST00000642140 221 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
CCDC7Q96M83 ABHD2-207ENST00000565973 2347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CCDC7Q96M83 CDKN1A-203ENST00000405375 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CCDC7Q96M83 RASAL3-201ENST00000343625 3293 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CCDC7Q96M83 CLCNKB-201ENST00000375667 2129 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CCDC7Q96M83 RAB35-201ENST00000229340 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CCDC7Q96M83 GPR89B-201ENST00000314163 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CCDC7Q96M83 HPCAL1-207ENST00000620771 1941 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CCDC7Q96M83 CHRNA4-207ENST00000615287 5643 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CCDC7Q96M83 MYB-203ENST00000341911 3672 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CCDC7Q96M83 SEPT8-205ENST00000378701 1817 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CCDC7Q96M83 SELENOF-208ENST00000616787 1835 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CCDC7Q96M83 SLC29A1-203ENST00000371724 2275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CCDC7Q96M83 NEUROD1-201ENST00000295108 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CCDC7Q96M83 AC063926.2-201ENST00000623766 1308 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
CCDC7Q96M83 LSM1-201ENST00000311351 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CCDC7Q96M83 POP5-202ENST00000357500 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CCDC7Q96M83 BAD-202ENST00000394531 631 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CCDC7Q96M83 CYTH4-203ENST00000405206 636 ntTSL 4 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CCDC7Q96M83 TSPY16P-201ENST00000449843 468 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
CCDC7Q96M83 RPS3A-212ENST00000514682 985 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CCDC7Q96M83 BAD-207ENST00000544785 525 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CCDC7Q96M83 AC015712.4-202ENST00000558641 1007 ntTSL 4 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CCDC7Q96M83 ZNF667-AS1-204ENST00000588158 921 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CCDC7Q96M83 AC141424.1-203ENST00000599026 887 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.7 ms