Protein–RNA interactions for Protein: Q96L34

MARK4, MAP/microtubule affinity-regulating kinase 4, humanhuman

Predictions only

Length 752 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MARK4Q96L34 GRB7-204ENST00000394211 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
MARK4Q96L34 CMKLR1-206ENST00000552995 1890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
MARK4Q96L34 WDR53-201ENST00000332629 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
MARK4Q96L34 LDB3-208ENST00000623007 1664 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
MARK4Q96L34 ZFAND6-207ENST00000558494 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
MARK4Q96L34 FTMT-201ENST00000321339 879 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
MARK4Q96L34 TMEM234-202ENST00000344461 721 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
MARK4Q96L34 GGT1-204ENST00000401885 968 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
MARK4Q96L34 TSPY19P-201ENST00000418461 509 ntBASIC16■□□□□ 0.15
MARK4Q96L34 AQP12A-202ENST00000429564 1110 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
MARK4Q96L34 TSPY18P-201ENST00000441642 509 ntBASIC16■□□□□ 0.15
MARK4Q96L34 CYP2A7P1-201ENST00000595391 815 ntBASIC16■□□□□ 0.15
MARK4Q96L34 CEACAM3-208ENST00000630848 1110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
MARK4Q96L34 TIPRL-202ENST00000367833 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
MARK4Q96L34 PPP2R5D-208ENST00000485511 3044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
MARK4Q96L34 RER1-209ENST00000605895 3044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
MARK4Q96L34 PXN-207ENST00000536957 4112 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
MARK4Q96L34 ATP6AP2-215ENST00000636409 1962 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
MARK4Q96L34 CDCP2-201ENST00000371330 2723 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
MARK4Q96L34 ZNF334-202ENST00000457685 3487 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
MARK4Q96L34 SYN1-201ENST00000295987 3299 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
MARK4Q96L34 MGEA5-201ENST00000357797 3263 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
MARK4Q96L34 PLVAP-201ENST00000252590 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
MARK4Q96L34 PARVB-203ENST00000404989 1591 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
MARK4Q96L34 PDHX-203ENST00000448838 2653 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
MARK4Q96L34 SERF2-203ENST00000381359 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
MARK4Q96L34 ULK4-203ENST00000420927 1904 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
MARK4Q96L34 REEP2-211ENST00000613650 1944 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
MARK4Q96L34 AC005906.2-217ENST00000639573 1711 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
MARK4Q96L34 ST14-201ENST00000278742 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
MARK4Q96L34 SCLT1-208ENST00000506368 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
MARK4Q96L34 LCMT2-202ENST00000567039 1545 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
MARK4Q96L34 PARVB-210ENST00000619710 1530 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
MARK4Q96L34 PAQR8-202ENST00000442253 4738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
MARK4Q96L34 PDCL3-201ENST00000264254 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
MARK4Q96L34 AGPAT1-202ENST00000375104 2017 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
MARK4Q96L34 UROC1-202ENST00000383579 2735 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
MARK4Q96L34 GOLGA2P7-202ENST00000400817 2850 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
MARK4Q96L34 ZMYND11-208ENST00000397962 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
MARK4Q96L34 STXBP5-207ENST00000546097 2160 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
MARK4Q96L34 BCL11A-203ENST00000358510 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
MARK4Q96L34 POMT1-205ENST00000404875 2821 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
MARK4Q96L34 MIR155HG-201ENST00000456917 1600 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
MARK4Q96L34 IMPDH1-202ENST00000348127 2479 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
MARK4Q96L34 ADARB2-203ENST00000381312 8421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
MARK4Q96L34 MCRIP2-201ENST00000307650 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
MARK4Q96L34 CDKN1C-201ENST00000380725 1220 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
MARK4Q96L34 DHRS4-203ENST00000397075 727 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
MARK4Q96L34 AL645608.6-201ENST00000418300 402 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
MARK4Q96L34 MOBP-208ENST00000441980 830 ntAPPRIS P4 TSL 4 BASIC15.99■□□□□ 0.15
MARK4Q96L34 PRYP5-201ENST00000451909 266 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
MARK4Q96L34 SLC25A6P2-201ENST00000497974 877 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
MARK4Q96L34 RAD52-211ENST00000536177 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
MARK4Q96L34 FICD-205ENST00000552758 603 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
MARK4Q96L34 SYNGR2-202ENST00000585591 949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
MARK4Q96L34 AL732292.2-201ENST00000609649 430 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
MARK4Q96L34 FAM238C-204ENST00000640224 1268 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
MARK4Q96L34 LINC02228-204ENST00000642115 2962 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
MARK4Q96L34 EPB41L3-202ENST00000342933 4270 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
MARK4Q96L34 FUT5-201ENST00000252675 1916 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
MARK4Q96L34 MAP1S-201ENST00000324096 3419 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
MARK4Q96L34 SHANK3-201ENST00000262795 7091 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
MARK4Q96L34 KIF18B-203ENST00000590129 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
MARK4Q96L34 CNPPD1-202ENST00000409789 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
MARK4Q96L34 PRX-201ENST00000291825 5502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
MARK4Q96L34 SLC43A1-204ENST00000528450 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
MARK4Q96L34 KRT12-201ENST00000251643 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
MARK4Q96L34 GRK5-202ENST00000392870 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
MARK4Q96L34 MAIP1-202ENST00000392290 1386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
MARK4Q96L34 AC005329.3-201ENST00000626781 1366 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
MARK4Q96L34 TBXAS1-201ENST00000336425 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
MARK4Q96L34 HLA-B-249ENST00000412585 1547 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
MARK4Q96L34 LETM2-201ENST00000297720 1693 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
MARK4Q96L34 GOLGA2P3Y-201ENST00000416946 1653 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
MARK4Q96L34 EPHA5-202ENST00000354839 3427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
MARK4Q96L34 SUN2-203ENST00000406622 2725 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
MARK4Q96L34 HSP90B1-201ENST00000299767 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
MARK4Q96L34 AP000866.1-201ENST00000499143 2886 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
MARK4Q96L34 CLDN14-204ENST00000399137 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
MARK4Q96L34 MCM3AP-AS1-202ENST00000420074 1947 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
MARK4Q96L34 ABCB9-216ENST00000542678 6051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
MARK4Q96L34 NECAP2-201ENST00000337132 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
MARK4Q96L34 CRYZL1-202ENST00000361534 2224 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
MARK4Q96L34 ASTN2-201ENST00000288520 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
MARK4Q96L34 ROR2-202ENST00000375715 2993 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
MARK4Q96L34 DBI-201ENST00000311521 714 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
MARK4Q96L34 FLAD1-203ENST00000315144 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
MARK4Q96L34 BAG1-202ENST00000379704 1128 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
MARK4Q96L34 CST3-202ENST00000398409 832 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
MARK4Q96L34 BAALC-AS2-201ENST00000436771 496 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
MARK4Q96L34 FDX1P1-201ENST00000449115 551 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
MARK4Q96L34 POU5F1P6-201ENST00000466990 990 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
MARK4Q96L34 CACFD1-207ENST00000542192 2754 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
MARK4Q96L34 BLOC1S1-204ENST00000549147 1229 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
MARK4Q96L34 AC069224.1-201ENST00000566372 1715 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
MARK4Q96L34 TMEM220-203ENST00000578345 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
MARK4Q96L34 AC020934.1-201ENST00000588469 739 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
MARK4Q96L34 STAP2-201ENST00000594605 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
MARK4Q96L34 PGPEP1-209ENST00000604499 769 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
MARK4Q96L34 PI4KAP1-204ENST00000612579 1703 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 71.2 ms