Protein–RNA interactions for Protein: Q92954

PRG4, Proteoglycan 4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,404 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRG4Q92954 ADPRHL1-202ENST00000375418 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
PRG4Q92954 AHCYP2-201ENST00000430630 1300 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
PRG4Q92954 B3GNT2-201ENST00000301998 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
PRG4Q92954 GATM-201ENST00000396659 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
PRG4Q92954 ISCA1-201ENST00000311534 813 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
PRG4Q92954 AL157902.1-202ENST00000425010 763 ntTSL 3 BASIC25.49■■□□□ 1.67
PRG4Q92954 AC004471.1-201ENST00000456035 582 ntTSL 4 BASIC25.49■■□□□ 1.67
PRG4Q92954 CENPM-208ENST00000472374 541 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
PRG4Q92954 TNNT1-203ENST00000536926 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
PRG4Q92954 IFITM3-204ENST00000602735 713 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
PRG4Q92954 LILRA2-208ENST00000629481 661 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
PRG4Q92954 AC233723.1-201ENST00000635921 386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
PRG4Q92954 CLDN15-202ENST00000401528 2131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
PRG4Q92954 LRP8-204ENST00000371454 3322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
PRG4Q92954 PCGF3-213ENST00000620529 1899 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
PRG4Q92954 CCNJ-203ENST00000465148 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
PRG4Q92954 ALAS2-203ENST00000396198 1936 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
PRG4Q92954 MRPL34-201ENST00000252602 968 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
PRG4Q92954 TEX30-203ENST00000376022 828 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
PRG4Q92954 CPLX2-202ENST00000393745 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
PRG4Q92954 HNRNPA1P32-201ENST00000396326 963 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
PRG4Q92954 RBAK-RBAKDN-201ENST00000396904 766 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC25.48■■□□□ 1.67
PRG4Q92954 AC104457.1-201ENST00000401024 814 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
PRG4Q92954 RBAK-RBAKDN-202ENST00000407184 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
PRG4Q92954 EPDR1-203ENST00000425345 947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
PRG4Q92954 USP40-206ENST00000443711 628 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
PRG4Q92954 LYRM4-206ENST00000468929 1168 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
PRG4Q92954 TMEM198B-204ENST00000484016 896 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
PRG4Q92954 AP002490.2-201ENST00000524791 560 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
PRG4Q92954 AC091891.1-201ENST00000560688 688 ntTSL 3 BASIC25.48■■□□□ 1.67
PRG4Q92954 AC011447.3-204ENST00000585498 883 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
PRG4Q92954 AL096828.3-201ENST00000615354 462 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
PRG4Q92954 AL160412.1-202ENST00000616819 663 ntTSL 4 BASIC25.48■■□□□ 1.67
PRG4Q92954 AC005622.1-201ENST00000636801 1703 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
PRG4Q92954 FTSJ1-202ENST00000348411 1892 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
PRG4Q92954 TXNRD2-218ENST00000542719 2024 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
PRG4Q92954 MAPRE1-201ENST00000375571 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
PRG4Q92954 CCDC183-201ENST00000338005 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
PRG4Q92954 BTD-207ENST00000449107 1820 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
PRG4Q92954 PDE4A-202ENST00000344979 2579 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
PRG4Q92954 CORO6-202ENST00000388767 2397 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
PRG4Q92954 LAT-203ENST00000395456 1616 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
PRG4Q92954 SLC39A14-201ENST00000240095 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
PRG4Q92954 SLC38A6-202ENST00000354886 1730 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
PRG4Q92954 PBX1-215ENST00000559240 2866 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
PRG4Q92954 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
PRG4Q92954 CGB5-201ENST00000301408 841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
PRG4Q92954 TSHR-202ENST00000342443 1281 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
PRG4Q92954 PGGT1B-202ENST00000379615 903 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
PRG4Q92954 DGCR5-204ENST00000440005 1299 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
PRG4Q92954 LRRC74B-201ENST00000442047 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
PRG4Q92954 BHMT-206ENST00000524080 1207 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
PRG4Q92954 AC009133.1-202ENST00000563806 494 ntTSL 3 BASIC25.47■■□□□ 1.67
PRG4Q92954 MIR5572-201ENST00000583188 137 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
PRG4Q92954 AC243964.2-201ENST00000590796 829 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
PRG4Q92954 AC000095.1-201ENST00000603208 874 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
PRG4Q92954 AL445288.1-201ENST00000610846 654 ntTSL 4 BASIC25.47■■□□□ 1.67
PRG4Q92954 YKT6-201ENST00000223369 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
PRG4Q92954 GPS1-226ENST00000623691 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
PRG4Q92954 HOXC6-202ENST00000394331 2943 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
PRG4Q92954 RAPH1-201ENST00000308091 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
PRG4Q92954 ADCY7-203ENST00000537579 2090 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
PRG4Q92954 MECR-201ENST00000263702 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
PRG4Q92954 EIF2B4-205ENST00000445933 1608 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
PRG4Q92954 LSMEM2-201ENST00000316436 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
PRG4Q92954 KRT12-201ENST00000251643 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
PRG4Q92954 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
PRG4Q92954 CD72-211ENST00000612238 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
PRG4Q92954 DMAC2-202ENST00000301183 1134 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
PRG4Q92954 CSH2-201ENST00000336844 1173 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
PRG4Q92954 CSH2-202ENST00000345366 598 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
PRG4Q92954 GUK1-206ENST00000366723 845 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
PRG4Q92954 DUSP23-202ENST00000368108 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
PRG4Q92954 MIR33B-201ENST00000385104 96 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
PRG4Q92954 DSCR3-204ENST00000399001 821 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
PRG4Q92954 KRTAP10-13P-201ENST00000412914 571 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
PRG4Q92954 IMP3P2-201ENST00000489760 475 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
PRG4Q92954 CLRN2-201ENST00000511148 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
PRG4Q92954 TMBIM4-205ENST00000535812 766 ntTSL 4 BASIC25.46■■□□□ 1.67
PRG4Q92954 TMBIM4-212ENST00000556010 610 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
PRG4Q92954 EEF1DP1-201ENST00000585891 896 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
PRG4Q92954 MFSD11-218ENST00000591864 446 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
PRG4Q92954 AC008403.1-201ENST00000595676 443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
PRG4Q92954 AC011510.1-201ENST00000598541 286 ntTSL 3 BASIC25.46■■□□□ 1.67
PRG4Q92954 DUSP13-203ENST00000372702 1778 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
PRG4Q92954 POLR1D-221ENST00000637180 2262 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
PRG4Q92954 SMOC2-206ENST00000535039 1875 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
PRG4Q92954 OSBP2-202ENST00000401475 2468 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
PRG4Q92954 RNF121-201ENST00000361756 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
PRG4Q92954 PCDHB14-202ENST00000624896 2367 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
PRG4Q92954 CKMT2-201ENST00000254035 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
PRG4Q92954 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
PRG4Q92954 B9D1-202ENST00000268841 755 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
PRG4Q92954 SPAG11A-203ENST00000351436 534 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
PRG4Q92954 SPAG11B-204ENST00000361111 534 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
PRG4Q92954 C9orf24-203ENST00000379126 496 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
PRG4Q92954 AC096536.1-201ENST00000443284 440 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
PRG4Q92954 METTL6-204ENST00000450816 1221 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
PRG4Q92954 RN7SL769P-201ENST00000469386 295 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
PRG4Q92954 ST8SIA2-202ENST00000539113 1089 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59.5 ms