Protein–RNA interactions for Protein: Q92547

TOPBP1, DNA topoisomerase 2-binding protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,522 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TOPBP1Q92547 PGAP3-203ENST00000378011 2533 ntTSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
TOPBP1Q92547 TINCR-201ENST00000448587 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
TOPBP1Q92547 XKR8-201ENST00000373884 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
TOPBP1Q92547 NRBP1-203ENST00000379852 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
TOPBP1Q92547 RNF146-203ENST00000368314 2369 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
TOPBP1Q92547 ISLR2-210ENST00000565540 2780 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC26.82■■□□□ 1.88
TOPBP1Q92547 AGAP5-203ENST00000581191 2779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
TOPBP1Q92547 TUBA3E-201ENST00000312988 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
TOPBP1Q92547 DUSP13-202ENST00000372700 781 ntTSL 3 BASIC26.81■■□□□ 1.88
TOPBP1Q92547 ZNF593-202ENST00000374266 675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
TOPBP1Q92547 RBAK-RBAKDN-201ENST00000396904 766 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC26.81■■□□□ 1.88
TOPBP1Q92547 RBAK-RBAKDN-202ENST00000407184 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
TOPBP1Q92547 LINC01806-201ENST00000436506 765 ntTSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
TOPBP1Q92547 AL139420.1-201ENST00000439394 653 ntTSL 3 BASIC26.81■■□□□ 1.88
TOPBP1Q92547 AC020914.3-201ENST00000594712 304 ntBASIC26.81■■□□□ 1.88
TOPBP1Q92547 HCG18-245ENST00000602550 559 ntTSL 4 BASIC26.81■■□□□ 1.88
TOPBP1Q92547 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
TOPBP1Q92547 COBL-202ENST00000395540 2332 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
TOPBP1Q92547 AL138694.1-201ENST00000637731 1689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
TOPBP1Q92547 UVSSA-207ENST00000511216 2927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
TOPBP1Q92547 CFLAR-205ENST00000342795 1613 ntTSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
TOPBP1Q92547 HHATL-201ENST00000310417 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
TOPBP1Q92547 EHD2-202ENST00000538399 1766 ntTSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
TOPBP1Q92547 LINC00461-203ENST00000504246 2300 ntTSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
TOPBP1Q92547 RTN4IP1-201ENST00000369063 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
TOPBP1Q92547 AJUBA-202ENST00000361265 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
TOPBP1Q92547 AC091046.1-201ENST00000331871 207 ntBASIC26.8■■□□□ 1.88
TOPBP1Q92547 ACKR1-201ENST00000368121 1240 ntBASIC26.8■■□□□ 1.88
TOPBP1Q92547 AL662890.1-201ENST00000396818 632 ntBASIC26.8■■□□□ 1.88
TOPBP1Q92547 AC106738.2-201ENST00000559802 557 ntTSL 4 BASIC26.8■■□□□ 1.88
TOPBP1Q92547 MUS81-215ENST00000533035 2180 ntTSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
TOPBP1Q92547 ALDH3A1-205ENST00000444455 1771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
TOPBP1Q92547 WNT8B-201ENST00000343737 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
TOPBP1Q92547 PTPA-201ENST00000337738 2845 ntTSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
TOPBP1Q92547 RBM17-201ENST00000379888 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
TOPBP1Q92547 MIER1-204ENST00000371012 2420 ntTSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
TOPBP1Q92547 SGCZ-201ENST00000382080 2234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
TOPBP1Q92547 TEKT4-201ENST00000295201 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
TOPBP1Q92547 CRTC3-201ENST00000268184 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
TOPBP1Q92547 CFLAR-214ENST00000443227 1679 ntTSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
TOPBP1Q92547 AHCYP2-201ENST00000430630 1300 ntBASIC26.8■■□□□ 1.88
TOPBP1Q92547 DNAJB8-AS1-201ENST00000471626 1798 ntTSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
TOPBP1Q92547 CSH2-201ENST00000336844 1173 ntTSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
TOPBP1Q92547 CSH2-202ENST00000345366 598 ntTSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
TOPBP1Q92547 DUSP23-202ENST00000368108 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
TOPBP1Q92547 RGS10-202ENST00000369103 804 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
TOPBP1Q92547 IFITM5-201ENST00000382614 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
TOPBP1Q92547 HNRNPA1P32-201ENST00000396326 963 ntBASIC26.8■■□□□ 1.88
TOPBP1Q92547 AL157902.1-202ENST00000425010 763 ntTSL 3 BASIC26.8■■□□□ 1.88
TOPBP1Q92547 AC007406.3-201ENST00000537295 1063 ntTSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
TOPBP1Q92547 GPX4-206ENST00000588919 803 ntTSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
TOPBP1Q92547 EGLN2-209ENST00000594140 991 ntTSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
TOPBP1Q92547 AC008403.1-201ENST00000595676 443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
TOPBP1Q92547 AL358473.2-201ENST00000610411 556 ntTSL 4 BASIC26.8■■□□□ 1.88
TOPBP1Q92547 P2RY4-201ENST00000374519 1595 ntAPPRIS P1 BASIC26.8■■□□□ 1.88
TOPBP1Q92547 AADAT-208ENST00000515480 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
TOPBP1Q92547 PRR19-201ENST00000341747 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
TOPBP1Q92547 CITED2-201ENST00000367651 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
TOPBP1Q92547 TNIP1-221ENST00000610874 2629 ntTSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
TOPBP1Q92547 AC011416.4-201ENST00000639283 2195 ntTSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
TOPBP1Q92547 CACNG5-201ENST00000307139 926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
TOPBP1Q92547 CXorf38-201ENST00000327877 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
TOPBP1Q92547 CAMKMT-203ENST00000403853 1114 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
TOPBP1Q92547 AC004471.1-201ENST00000456035 582 ntTSL 4 BASIC26.79■■□□□ 1.88
TOPBP1Q92547 TMBIM4-205ENST00000535812 766 ntTSL 4 BASIC26.79■■□□□ 1.88
TOPBP1Q92547 TMBIM4-212ENST00000556010 610 ntTSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
TOPBP1Q92547 FXYD6-217ENST00000584394 669 ntTSL 3 BASIC26.79■■□□□ 1.88
TOPBP1Q92547 RASSF1-205ENST00000395126 1657 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
TOPBP1Q92547 CLEC10A-201ENST00000254868 1797 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
TOPBP1Q92547 IL18BP-204ENST00000393703 1788 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC26.78■■□□□ 1.88
TOPBP1Q92547 CTSD-207ENST00000636571 1790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
TOPBP1Q92547 NDRG2-204ENST00000360463 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
TOPBP1Q92547 PKIG-204ENST00000372889 1489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
TOPBP1Q92547 GAPDH-201ENST00000229239 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
TOPBP1Q92547 ARMC6-203ENST00000392336 1866 ntTSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
TOPBP1Q92547 TXNRD2-214ENST00000491939 2238 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
TOPBP1Q92547 KIF1BP-204ENST00000626493 2337 ntTSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
TOPBP1Q92547 CYB5R1-201ENST00000367249 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
TOPBP1Q92547 WBP2-201ENST00000254806 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
TOPBP1Q92547 LARP4-219ENST00000614335 1949 ntTSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
TOPBP1Q92547 PIGX-202ENST00000392391 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
TOPBP1Q92547 VCPKMT-201ENST00000395859 795 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
TOPBP1Q92547 PSMG3-203ENST00000404674 774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
TOPBP1Q92547 CLRN2-201ENST00000511148 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
TOPBP1Q92547 AC005262.2-201ENST00000587701 452 ntTSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
TOPBP1Q92547 MFSD11-218ENST00000591864 446 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
TOPBP1Q92547 SMCO4-206ENST00000596676 180 ntAPPRIS P1 BASIC26.78■■□□□ 1.88
TOPBP1Q92547 RGL3-202ENST00000393423 2278 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
TOPBP1Q92547 STIM2-212ENST00000639640 2241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
TOPBP1Q92547 SPIDR-227ENST00000541342 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
TOPBP1Q92547 SIGLEC7-201ENST00000305628 1469 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
TOPBP1Q92547 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
TOPBP1Q92547 PLA2G2D-202ENST00000617227 1856 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
TOPBP1Q92547 NAGPA-201ENST00000312251 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
TOPBP1Q92547 DYNLRB2-201ENST00000305904 497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
TOPBP1Q92547 IGHV3-21-201ENST00000390607 430 ntAPPRIS P1 BASIC26.77■■□□□ 1.88
TOPBP1Q92547 KRTAP10-13P-201ENST00000412914 571 ntBASIC26.77■■□□□ 1.88
TOPBP1Q92547 HSPB1P2-201ENST00000448722 546 ntBASIC26.77■■□□□ 1.88
TOPBP1Q92547 PCOLCE2-208ENST00000485766 1088 ntTSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
TOPBP1Q92547 FHIT-208ENST00000492590 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.6 ms