Protein–RNA interactions for Protein: Q8NHH9

ATL2, Atlastin-2, humanhuman

Predictions only

Length 583 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATL2Q8NHH9 SLC12A5-209ENST00000616201 2955 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
ATL2Q8NHH9 AHRR-201ENST00000316418 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
ATL2Q8NHH9 KTN1-AS1-202ENST00000412224 2185 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
ATL2Q8NHH9 HAPLN3-201ENST00000359595 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
ATL2Q8NHH9 MMP15-201ENST00000219271 4250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
ATL2Q8NHH9 NPL-204ENST00000367554 3027 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
ATL2Q8NHH9 ASIC1-201ENST00000228468 4072 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
ATL2Q8NHH9 LYAR-201ENST00000343470 1569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
ATL2Q8NHH9 LCA10-201ENST00000618311 1392 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
ATL2Q8NHH9 ATG13-216ENST00000530500 2030 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.34
ATL2Q8NHH9 TMPO-203ENST00000343315 2465 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.34
ATL2Q8NHH9 PPHLN1-204ENST00000358314 1643 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
ATL2Q8NHH9 NEO1-201ENST00000261908 7088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
ATL2Q8NHH9 NFATC3-222ENST00000575270 3824 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
ATL2Q8NHH9 COPS8-202ENST00000392008 1654 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
ATL2Q8NHH9 ALPI-201ENST00000295463 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
ATL2Q8NHH9 ZNF514-201ENST00000295208 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
ATL2Q8NHH9 MAPKAP1-202ENST00000350766 3256 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
ATL2Q8NHH9 KIF13B-206ENST00000524189 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
ATL2Q8NHH9 WDR4-201ENST00000330317 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
ATL2Q8NHH9 AP2A2-222ENST00000534328 1491 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
ATL2Q8NHH9 STT3B-201ENST00000295770 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
ATL2Q8NHH9 RHOC-201ENST00000285735 2199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
ATL2Q8NHH9 NFE2L2-201ENST00000397062 2853 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
ATL2Q8NHH9 GABRB3-215ENST00000622697 5876 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
ATL2Q8NHH9 NRSN1-203ENST00000378478 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
ATL2Q8NHH9 LYPLA2-204ENST00000374505 907 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
ATL2Q8NHH9 CD99-204ENST00000381187 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
ATL2Q8NHH9 AL121672.1-201ENST00000439423 1181 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
ATL2Q8NHH9 RPS15P9-201ENST00000494093 319 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
ATL2Q8NHH9 AC107918.2-201ENST00000530817 355 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
ATL2Q8NHH9 AC092865.5-201ENST00000545435 363 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
ATL2Q8NHH9 ICAM2-205ENST00000578379 1064 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
ATL2Q8NHH9 ICAM2-206ENST00000578892 1056 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
ATL2Q8NHH9 AC008667.4-201ENST00000607370 168 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
ATL2Q8NHH9 ATP6AP2-220ENST00000636970 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
ATL2Q8NHH9 ABTB1-202ENST00000453791 1961 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
ATL2Q8NHH9 ZNF382-202ENST00000423582 2657 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
ATL2Q8NHH9 SMIM10-201ENST00000330288 1536 ntAPPRIS P1 BASIC17.14■□□□□ 0.33
ATL2Q8NHH9 SEMA7A-201ENST00000261918 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
ATL2Q8NHH9 CARD11-203ENST00000396946 4366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
ATL2Q8NHH9 MAGI3-203ENST00000369615 6508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
ATL2Q8NHH9 ORMDL1-203ENST00000392350 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
ATL2Q8NHH9 AXIN2-202ENST00000375702 2541 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
ATL2Q8NHH9 ANXA11-203ENST00000422982 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
ATL2Q8NHH9 HSP90B1-210ENST00000614327 1338 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
ATL2Q8NHH9 TBC1D1-203ENST00000402522 1567 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
ATL2Q8NHH9 PDXP-202ENST00000403251 1571 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
ATL2Q8NHH9 GBA2-202ENST00000378094 3757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
ATL2Q8NHH9 FAM92B-201ENST00000539556 1898 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
ATL2Q8NHH9 TRIM24-201ENST00000343526 8410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
ATL2Q8NHH9 RBPMS-204ENST00000397323 2941 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
ATL2Q8NHH9 TFPI2-201ENST00000222543 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
ATL2Q8NHH9 AC012485.3-201ENST00000637634 2424 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
ATL2Q8NHH9 ZMIZ1-205ENST00000611351 2196 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
ATL2Q8NHH9 DMKN-209ENST00000429837 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
ATL2Q8NHH9 WDR1-202ENST00000382451 2722 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
ATL2Q8NHH9 Z99756.1-201ENST00000458463 1951 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
ATL2Q8NHH9 DUOX1-202ENST00000389037 5483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
ATL2Q8NHH9 FEN1-201ENST00000305885 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
ATL2Q8NHH9 SCYL1-206ENST00000525364 2584 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
ATL2Q8NHH9 COMMD6-203ENST00000377615 1793 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
ATL2Q8NHH9 TRIM24-202ENST00000415680 3799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
ATL2Q8NHH9 INHBB-201ENST00000295228 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
ATL2Q8NHH9 MAGEA2-201ENST00000595583 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
ATL2Q8NHH9 TDRD6-203ENST00000544460 8887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
ATL2Q8NHH9 PPIB-201ENST00000300026 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
ATL2Q8NHH9 ROMO1-201ENST00000336695 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
ATL2Q8NHH9 MOB1B-202ENST00000396051 1107 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
ATL2Q8NHH9 C2orf49-202ENST00000410049 854 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
ATL2Q8NHH9 AC109309.1-201ENST00000418995 435 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
ATL2Q8NHH9 SNHG17-206ENST00000436764 973 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
ATL2Q8NHH9 C11orf74-203ENST00000446510 1062 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
ATL2Q8NHH9 SMIM27-204ENST00000453396 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
ATL2Q8NHH9 TMEM258-204ENST00000537328 575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
ATL2Q8NHH9 L2HGDH-206ENST00000555610 804 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
ATL2Q8NHH9 AC092384.3-201ENST00000561980 531 ntTSL 4 BASIC17.13■□□□□ 0.33
ATL2Q8NHH9 AC005412.3-201ENST00000580309 715 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
ATL2Q8NHH9 AC006538.3-201ENST00000612495 578 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
ATL2Q8NHH9 AC020765.3-201ENST00000613051 740 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
ATL2Q8NHH9 C1QL3-202ENST00000619991 783 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
ATL2Q8NHH9 HMGXB3-202ENST00000503427 5275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
ATL2Q8NHH9 HDAC5-201ENST00000225983 5326 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
ATL2Q8NHH9 H2BFM-201ENST00000355016 1882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
ATL2Q8NHH9 MEIS3-210ENST00000561096 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
ATL2Q8NHH9 DENND1A-202ENST00000373620 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
ATL2Q8NHH9 MBD1-210ENST00000457839 2473 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
ATL2Q8NHH9 SLAIN2-201ENST00000264313 6299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
ATL2Q8NHH9 USP13-201ENST00000263966 8323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
ATL2Q8NHH9 ADARB1-202ENST00000360697 6604 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
ATL2Q8NHH9 KNOP1-205ENST00000568230 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
ATL2Q8NHH9 AC129492.6-201ENST00000611383 1305 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
ATL2Q8NHH9 NSUN5-202ENST00000310326 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
ATL2Q8NHH9 PCDHA12-201ENST00000398631 5233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
ATL2Q8NHH9 CHRNB2-201ENST00000368476 5867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
ATL2Q8NHH9 THOC5-202ENST00000397871 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
ATL2Q8NHH9 ZNF496-201ENST00000294753 5336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
ATL2Q8NHH9 ACHE-202ENST00000302913 2956 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
ATL2Q8NHH9 TBC1D9B-202ENST00000356834 5173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
ATL2Q8NHH9 GRHPR-212ENST00000607784 1704 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.8 ms