Protein–RNA interactions for Protein: Q8NEB9

PIK3C3, Phosphatidylinositol 3-kinase catalytic subunit type 3, humanhuman

Predictions only

Length 887 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PIK3C3Q8NEB9 TNRC18P2-201ENST00000417666 2714 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
PIK3C3Q8NEB9 NEK11-210ENST00000510769 2149 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PIK3C3Q8NEB9 SQSTM1-213ENST00000510187 1714 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PIK3C3Q8NEB9 AC005906.2-217ENST00000639573 1711 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PIK3C3Q8NEB9 PITHD1-201ENST00000246151 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PIK3C3Q8NEB9 AC023830.1-201ENST00000569678 1543 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PIK3C3Q8NEB9 PPP2R5D-202ENST00000394110 2894 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PIK3C3Q8NEB9 HPN-201ENST00000262626 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PIK3C3Q8NEB9 ARID5A-201ENST00000357485 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PIK3C3Q8NEB9 AC126755.1-201ENST00000525846 6405 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
PIK3C3Q8NEB9 THNSL2-202ENST00000343544 2052 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PIK3C3Q8NEB9 FNDC1-201ENST00000297267 6552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PIK3C3Q8NEB9 NEDD4-202ENST00000435532 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PIK3C3Q8NEB9 ANKMY1-203ENST00000373318 2449 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PIK3C3Q8NEB9 AP002414.2-201ENST00000591780 3365 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
PIK3C3Q8NEB9 PSD4-201ENST00000245796 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PIK3C3Q8NEB9 RGR-202ENST00000359452 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PIK3C3Q8NEB9 FP565260.3-204ENST00000623795 2238 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PIK3C3Q8NEB9 CCZ1-207ENST00000628813 2218 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PIK3C3Q8NEB9 ELFN2-207ENST00000613079 8360 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PIK3C3Q8NEB9 MCL1-201ENST00000307940 1110 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PIK3C3Q8NEB9 SWI5-201ENST00000320188 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PIK3C3Q8NEB9 SMOX-204ENST00000346595 982 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PIK3C3Q8NEB9 PRSS38-201ENST00000366757 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PIK3C3Q8NEB9 CYP4B1-203ENST00000371923 2110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PIK3C3Q8NEB9 LINC01972-201ENST00000422271 553 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PIK3C3Q8NEB9 MRPL28-203ENST00000429738 310 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PIK3C3Q8NEB9 CT47A11-201ENST00000457020 1294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PIK3C3Q8NEB9 BX005266.1-201ENST00000473402 457 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
PIK3C3Q8NEB9 AC106791.1-202ENST00000508281 1148 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PIK3C3Q8NEB9 KLK12-203ENST00000525263 1077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PIK3C3Q8NEB9 ZBED5-AS1-202ENST00000529014 771 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PIK3C3Q8NEB9 MTHFSD-203ENST00000543303 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PIK3C3Q8NEB9 TBCB-205ENST00000585746 875 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PIK3C3Q8NEB9 AC064862.7-201ENST00000604520 867 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
PIK3C3Q8NEB9 REXO1L6P-202ENST00000619970 1078 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
PIK3C3Q8NEB9 MTHFSD-220ENST00000634347 1207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PIK3C3Q8NEB9 ABCG5-202ENST00000405322 2896 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PIK3C3Q8NEB9 CANX-201ENST00000247461 4260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PIK3C3Q8NEB9 NLRX1-202ENST00000409109 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PIK3C3Q8NEB9 ZNF114-204ENST00000595607 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PIK3C3Q8NEB9 RASA1-201ENST00000274376 3752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PIK3C3Q8NEB9 TMEM139-201ENST00000359333 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PIK3C3Q8NEB9 AADAT-201ENST00000337664 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PIK3C3Q8NEB9 PPHLN1-204ENST00000358314 1643 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PIK3C3Q8NEB9 SLC6A2-204ENST00000561820 2268 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PIK3C3Q8NEB9 RBM14-201ENST00000310137 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PIK3C3Q8NEB9 RHOC-201ENST00000285735 2199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PIK3C3Q8NEB9 TSR2-201ENST00000375151 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PIK3C3Q8NEB9 AC067930.6-201ENST00000623257 4947 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
PIK3C3Q8NEB9 AZIN2-203ENST00000373441 1443 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PIK3C3Q8NEB9 CTCFL-215ENST00000608158 1984 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PIK3C3Q8NEB9 TAP2-205ENST00000620123 5676 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
PIK3C3Q8NEB9 ATP5S-201ENST00000245448 1671 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PIK3C3Q8NEB9 CCDC183-201ENST00000338005 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PIK3C3Q8NEB9 ELAVL3-201ENST00000359227 4729 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
PIK3C3Q8NEB9 TRH-202ENST00000507066 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
PIK3C3Q8NEB9 ARHGEF1-219ENST00000599846 3393 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
PIK3C3Q8NEB9 FOXRED2-204ENST00000397224 4967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PIK3C3Q8NEB9 CALHM2-202ENST00000369788 1843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
PIK3C3Q8NEB9 STBD1-201ENST00000237642 3420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PIK3C3Q8NEB9 SRPK1-204ENST00000373825 4592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PIK3C3Q8NEB9 DBN1-202ENST00000309007 2995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PIK3C3Q8NEB9 SSH3-203ENST00000376757 2990 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
PIK3C3Q8NEB9 GOLGA8DP-202ENST00000341390 2184 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
PIK3C3Q8NEB9 LYPLA1-214ENST00000618741 2526 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
PIK3C3Q8NEB9 CHAD-201ENST00000258969 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PIK3C3Q8NEB9 AL512652.2-201ENST00000625156 1716 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
PIK3C3Q8NEB9 SLC25A48-203ENST00000425402 2062 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
PIK3C3Q8NEB9 PTPMT1-201ENST00000326656 928 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PIK3C3Q8NEB9 PTRHD1-201ENST00000328379 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PIK3C3Q8NEB9 GNMT-201ENST00000372808 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PIK3C3Q8NEB9 YDJC-202ENST00000398873 1066 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PIK3C3Q8NEB9 ELOB-202ENST00000409477 997 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PIK3C3Q8NEB9 AC093459.1-201ENST00000444567 481 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
PIK3C3Q8NEB9 SAPCD2P3-201ENST00000455031 850 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
PIK3C3Q8NEB9 ITGB1BP1-205ENST00000456913 1043 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
PIK3C3Q8NEB9 IDH3B-206ENST00000474315 1279 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PIK3C3Q8NEB9 ITGB1BP1-216ENST00000488451 874 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
PIK3C3Q8NEB9 PLPP5-214ENST00000531823 875 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
PIK3C3Q8NEB9 IRF8-202ENST00000562492 946 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
PIK3C3Q8NEB9 MIR4492-201ENST00000581627 80 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
PIK3C3Q8NEB9 IFNL4P1-201ENST00000607083 540 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
PIK3C3Q8NEB9 SSBP1-215ENST00000612337 884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
PIK3C3Q8NEB9 AL139288.1-201ENST00000623748 933 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
PIK3C3Q8NEB9 AL022326.1-202ENST00000641533 845 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
PIK3C3Q8NEB9 SERPINB6-201ENST00000335686 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PIK3C3Q8NEB9 PLVAP-201ENST00000252590 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PIK3C3Q8NEB9 AC092198.1-201ENST00000447651 2691 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
PIK3C3Q8NEB9 AC013268.4-201ENST00000637413 2228 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
PIK3C3Q8NEB9 ARMC6-203ENST00000392336 1866 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
PIK3C3Q8NEB9 HLA-B-249ENST00000412585 1547 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
PIK3C3Q8NEB9 HHIP-202ENST00000434550 1770 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PIK3C3Q8NEB9 ZHX1-201ENST00000297857 5200 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
PIK3C3Q8NEB9 HOXD3-202ENST00000410016 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
PIK3C3Q8NEB9 ARHGAP45-212ENST00000590577 3218 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
PIK3C3Q8NEB9 PDCL3-201ENST00000264254 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PIK3C3Q8NEB9 SARDH-202ENST00000371867 1326 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PIK3C3Q8NEB9 ZNF563-201ENST00000293725 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PIK3C3Q8NEB9 SLC6A13-201ENST00000343164 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.6 ms