Protein–RNA interactions for Protein: Q8NCD3

HJURP, Holliday junction recognition protein, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 748 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HJURPQ8NCD3 WASHC2C-209ENST00000540872 4519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
HJURPQ8NCD3 ATP4B-201ENST00000335288 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
HJURPQ8NCD3 CD1E-212ENST00000368167 1458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
HJURPQ8NCD3 ASB1-201ENST00000264607 6994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
HJURPQ8NCD3 IL11RA-215ENST00000602473 1388 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
HJURPQ8NCD3 APBA2-207ENST00000558402 4031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
HJURPQ8NCD3 AC007388.1-210ENST00000415640 458 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
HJURPQ8NCD3 AC241585.1-201ENST00000433527 519 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
HJURPQ8NCD3 U52111.1-201ENST00000434284 914 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
HJURPQ8NCD3 TMEM176B-205ENST00000450753 1006 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
HJURPQ8NCD3 INGX-202ENST00000489074 768 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
HJURPQ8NCD3 PKD2-202ENST00000502363 1222 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
HJURPQ8NCD3 LINC01336-202ENST00000506086 479 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
HJURPQ8NCD3 AC008481.3-201ENST00000585656 727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
HJURPQ8NCD3 ZNF667-AS1-202ENST00000586091 678 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
HJURPQ8NCD3 GGT5-203ENST00000398292 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
HJURPQ8NCD3 DIXDC1-208ENST00000615255 4825 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
HJURPQ8NCD3 CCKAR-201ENST00000295589 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
HJURPQ8NCD3 DRG1-201ENST00000331457 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
HJURPQ8NCD3 MGEA5-202ENST00000361464 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
HJURPQ8NCD3 JMJD4-206ENST00000615711 2591 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
HJURPQ8NCD3 MKRN3-203ENST00000568252 1312 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
HJURPQ8NCD3 DIP2A-204ENST00000457905 3044 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
HJURPQ8NCD3 NRBP2-202ENST00000442628 3587 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
HJURPQ8NCD3 TSC2-201ENST00000219476 6156 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
HJURPQ8NCD3 ZYG11A-202ENST00000371532 3942 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
HJURPQ8NCD3 HGS-201ENST00000329138 2970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
HJURPQ8NCD3 PLXNB3-201ENST00000361971 6146 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
HJURPQ8NCD3 TEX261-201ENST00000272438 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
HJURPQ8NCD3 LTBP2-205ENST00000556690 5614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
HJURPQ8NCD3 DNAJC7-201ENST00000316603 1468 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
HJURPQ8NCD3 CHST8-201ENST00000262622 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
HJURPQ8NCD3 SERAC1-201ENST00000367101 1907 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
HJURPQ8NCD3 GPER1-206ENST00000617001 1900 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
HJURPQ8NCD3 CSHL1-204ENST00000392824 823 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
HJURPQ8NCD3 RBM39-205ENST00000397370 612 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
HJURPQ8NCD3 BAX-206ENST00000415969 540 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
HJURPQ8NCD3 FAM8A3P-201ENST00000427218 844 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
HJURPQ8NCD3 AL512638.1-201ENST00000457493 794 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
HJURPQ8NCD3 TMEM161B-AS1-202ENST00000501715 1101 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
HJURPQ8NCD3 LY6E-204ENST00000519546 971 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
HJURPQ8NCD3 MTFR1L-218ENST00000526894 733 ntTSL 4 BASIC16.69■□□□□ 0.26
HJURPQ8NCD3 AL139349.1-201ENST00000530479 577 ntTSL 4 BASIC16.69■□□□□ 0.26
HJURPQ8NCD3 RNF24-204ENST00000545616 1128 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
HJURPQ8NCD3 AL031717.1-201ENST00000569670 565 ntTSL 4 BASIC16.69■□□□□ 0.26
HJURPQ8NCD3 NAA60-208ENST00000570819 833 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
HJURPQ8NCD3 INO80C-206ENST00000586489 594 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
HJURPQ8NCD3 AC011491.2-201ENST00000599584 447 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
HJURPQ8NCD3 AC026803.2-201ENST00000599784 819 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
HJURPQ8NCD3 AL133215.2-201ENST00000609242 977 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
HJURPQ8NCD3 PCDHGC4-204ENST00000618371 812 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
HJURPQ8NCD3 AJ011932.1-201ENST00000621707 465 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
HJURPQ8NCD3 DBI-212ENST00000627305 620 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
HJURPQ8NCD3 ATG5-210ENST00000636437 2261 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
HJURPQ8NCD3 ZNF84-201ENST00000327668 7162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
HJURPQ8NCD3 PRR19-204ENST00000598490 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
HJURPQ8NCD3 ARHGAP33-201ENST00000007510 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
HJURPQ8NCD3 EPB41-205ENST00000373797 2402 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
HJURPQ8NCD3 MRTO4-201ENST00000330263 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
HJURPQ8NCD3 TXNDC2-201ENST00000306084 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
HJURPQ8NCD3 WBP2-204ENST00000585462 1895 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
HJURPQ8NCD3 RNLS-201ENST00000331772 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
HJURPQ8NCD3 AC100757.3-201ENST00000622361 1406 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
HJURPQ8NCD3 MAEA-202ENST00000303400 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
HJURPQ8NCD3 NKILA-202ENST00000614771 2598 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
HJURPQ8NCD3 USP13-201ENST00000263966 8323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
HJURPQ8NCD3 ORMDL3-201ENST00000304046 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
HJURPQ8NCD3 AL139130.1-201ENST00000451362 5586 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
HJURPQ8NCD3 NSFL1C-206ENST00000476071 2800 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
HJURPQ8NCD3 APBB2-204ENST00000502841 1681 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
HJURPQ8NCD3 CLU-215ENST00000523500 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
HJURPQ8NCD3 SYVN1-203ENST00000377190 3052 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
HJURPQ8NCD3 SLC5A2-201ENST00000330498 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
HJURPQ8NCD3 TOM1L1-221ENST00000575882 2507 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
HJURPQ8NCD3 BNIP2-213ENST00000612191 2515 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
HJURPQ8NCD3 LTK-204ENST00000561619 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
HJURPQ8NCD3 CIAPIN1-207ENST00000565961 1814 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
HJURPQ8NCD3 PIGT-221ENST00000638594 1835 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
HJURPQ8NCD3 CLN3-229ENST00000567963 1452 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
HJURPQ8NCD3 MEST-202ENST00000341441 2443 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
HJURPQ8NCD3 GLOD4-202ENST00000301329 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
HJURPQ8NCD3 LHCGR-204ENST00000405626 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
HJURPQ8NCD3 ELAC2-203ENST00000426905 2671 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
HJURPQ8NCD3 ARPC1B-211ENST00000451682 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
HJURPQ8NCD3 PARP12-201ENST00000263549 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
HJURPQ8NCD3 GRB7-201ENST00000309156 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
HJURPQ8NCD3 AC005052.1-201ENST00000625181 2492 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
HJURPQ8NCD3 USE1-201ENST00000263897 843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
HJURPQ8NCD3 C1orf43-203ENST00000368516 872 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
HJURPQ8NCD3 ZUFSP-201ENST00000368573 1225 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
HJURPQ8NCD3 AL139010.1-201ENST00000454878 894 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
HJURPQ8NCD3 TMSB15B-204ENST00000540220 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
HJURPQ8NCD3 DRAM1-202ENST00000544152 1048 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
HJURPQ8NCD3 TMSB15B-205ENST00000563257 590 ntTSL 4 BASIC16.68■□□□□ 0.26
HJURPQ8NCD3 AC020978.5-201ENST00000564147 533 ntTSL 4 BASIC16.68■□□□□ 0.26
HJURPQ8NCD3 HCFC1R1-203ENST00000572355 610 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
HJURPQ8NCD3 AC116003.1-201ENST00000578340 536 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
HJURPQ8NCD3 LIM2-202ENST00000596399 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
HJURPQ8NCD3 RCAN3-211ENST00000630217 658 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
HJURPQ8NCD3 ZBTB44-201ENST00000357899 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.9 ms