Protein–RNA interactions for Protein: Q8NBK3

SUMF1, Sulfatase-modifying factor 1, humanhuman

Predictions only

Length 374 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SUMF1Q8NBK3 AC244452.3-201ENST00000636814 210 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
SUMF1Q8NBK3 HMGA1-204ENST00000401473 1887 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SUMF1Q8NBK3 IQSEC2-202ENST00000396435 6015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SUMF1Q8NBK3 CGRRF1-201ENST00000216420 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SUMF1Q8NBK3 MAEA-201ENST00000264750 2058 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SUMF1Q8NBK3 NDUFS2-202ENST00000392179 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SUMF1Q8NBK3 ANKS3-202ENST00000446014 2265 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SUMF1Q8NBK3 IFFO1-204ENST00000396840 2677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SUMF1Q8NBK3 ISLR2-210ENST00000565540 2780 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SUMF1Q8NBK3 SYNPO-201ENST00000307662 5374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SUMF1Q8NBK3 SLC9A6-208ENST00000636206 4711 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SUMF1Q8NBK3 ZNF205-206ENST00000620094 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SUMF1Q8NBK3 TCAP-201ENST00000309889 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SUMF1Q8NBK3 FKBP8-201ENST00000222308 1710 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SUMF1Q8NBK3 APH1A-204ENST00000414276 1718 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SUMF1Q8NBK3 FKBP10-201ENST00000321562 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SUMF1Q8NBK3 NOX4-201ENST00000263317 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SUMF1Q8NBK3 AL355312.1-201ENST00000407115 2176 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
SUMF1Q8NBK3 TNK2-AS1-201ENST00000458180 2096 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SUMF1Q8NBK3 HARBI1-201ENST00000326737 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SUMF1Q8NBK3 GOLGA7-204ENST00000520817 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SUMF1Q8NBK3 B3GALNT1-202ENST00000392779 3221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SUMF1Q8NBK3 RFC5-204ENST00000454402 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SUMF1Q8NBK3 FGFR1-206ENST00000397091 5702 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SUMF1Q8NBK3 MRPL13-201ENST00000306185 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SUMF1Q8NBK3 AC083949.1-201ENST00000422013 657 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SUMF1Q8NBK3 AL845321.1-202ENST00000432011 786 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SUMF1Q8NBK3 OLR1-203ENST00000432556 950 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SUMF1Q8NBK3 METTL21A-209ENST00000448823 869 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SUMF1Q8NBK3 AC083949.1-202ENST00000458490 552 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SUMF1Q8NBK3 RUVBL1-202ENST00000464873 2126 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SUMF1Q8NBK3 MTX3-202ENST00000512528 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SUMF1Q8NBK3 AC009686.1-201ENST00000522494 364 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SUMF1Q8NBK3 AP000721.1-201ENST00000535431 559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SUMF1Q8NBK3 AC090502.1-201ENST00000549905 748 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SUMF1Q8NBK3 AC090502.1-204ENST00000551210 469 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SUMF1Q8NBK3 AC025810.1-201ENST00000569986 981 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SUMF1Q8NBK3 MIR4706-201ENST00000582134 82 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
SUMF1Q8NBK3 AC011497.1-201ENST00000596781 561 ntTSL 4 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SUMF1Q8NBK3 AC013467.2-201ENST00000605472 835 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
SUMF1Q8NBK3 AC244669.2-201ENST00000612320 853 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
SUMF1Q8NBK3 HADH-212ENST00000638621 741 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SUMF1Q8NBK3 AL358215.2-201ENST00000639693 946 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SUMF1Q8NBK3 TBRG4-202ENST00000361278 1917 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SUMF1Q8NBK3 WDR90-215ENST00000549091 5589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SUMF1Q8NBK3 MADD-208ENST00000405573 1823 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SUMF1Q8NBK3 AC006277.1-201ENST00000624348 1610 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
SUMF1Q8NBK3 DCST1-204ENST00000423025 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SUMF1Q8NBK3 AHSA1-201ENST00000216479 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SUMF1Q8NBK3 KRT8P39-201ENST00000396270 1433 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
SUMF1Q8NBK3 SLC10A3-203ENST00000393586 1893 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SUMF1Q8NBK3 LINC00461-203ENST00000504246 2300 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SUMF1Q8NBK3 SLCO4A1-201ENST00000217159 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SUMF1Q8NBK3 HDAC10-205ENST00000448072 2133 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SUMF1Q8NBK3 MGLL-204ENST00000434178 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SUMF1Q8NBK3 PLCH2-203ENST00000378486 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SUMF1Q8NBK3 PLCH2-204ENST00000419816 4837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SUMF1Q8NBK3 TLX1-201ENST00000370196 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SUMF1Q8NBK3 HNF1A-212ENST00000544413 2014 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SUMF1Q8NBK3 LGI4-201ENST00000310123 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SUMF1Q8NBK3 TACSTD2-201ENST00000371225 2351 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SUMF1Q8NBK3 DMKN-201ENST00000339686 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SUMF1Q8NBK3 GAL3ST1-203ENST00000402321 1908 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SUMF1Q8NBK3 ARHGEF18-201ENST00000319670 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SUMF1Q8NBK3 ITGB4-201ENST00000200181 5919 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SUMF1Q8NBK3 RCAN3-209ENST00000616511 2527 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SUMF1Q8NBK3 SP3-203ENST00000418194 3937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SUMF1Q8NBK3 MIOX-201ENST00000216075 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SUMF1Q8NBK3 EIF4E-201ENST00000280892 1097 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SUMF1Q8NBK3 WDR3-202ENST00000369441 1035 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SUMF1Q8NBK3 C9orf16-201ENST00000372994 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SUMF1Q8NBK3 C1QC-202ENST00000374639 1183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SUMF1Q8NBK3 BAATP1-201ENST00000412284 1225 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
SUMF1Q8NBK3 AC243836.1-201ENST00000416696 438 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SUMF1Q8NBK3 NUS1P3-201ENST00000423502 862 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
SUMF1Q8NBK3 SNHG11-212ENST00000449351 954 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SUMF1Q8NBK3 CENPBD1P1-203ENST00000479047 569 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SUMF1Q8NBK3 AC115284.1-201ENST00000488257 547 ntTSL 4 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SUMF1Q8NBK3 PMF1-BGLAP-203ENST00000490491 1007 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SUMF1Q8NBK3 GTF2H2-204ENST00000517900 659 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SUMF1Q8NBK3 FADS2-212ENST00000522639 360 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SUMF1Q8NBK3 FADS2-215ENST00000574708 385 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SUMF1Q8NBK3 PSENEN-203ENST00000591949 833 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SUMF1Q8NBK3 U62317.3-201ENST00000608319 855 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
SUMF1Q8NBK3 AL358473.2-201ENST00000610411 556 ntTSL 4 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SUMF1Q8NBK3 AGAP1-213ENST00000619456 1057 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SUMF1Q8NBK3 SIRT6-202ENST00000337491 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SUMF1Q8NBK3 Z97205.2-201ENST00000564697 1639 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
SUMF1Q8NBK3 VPS37B-201ENST00000267202 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SUMF1Q8NBK3 HFE2-201ENST00000336751 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SUMF1Q8NBK3 CHRND-201ENST00000258385 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SUMF1Q8NBK3 DUS3L-201ENST00000309061 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SUMF1Q8NBK3 WSCD1-209ENST00000574232 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SUMF1Q8NBK3 SLC7A9-204ENST00000590341 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SUMF1Q8NBK3 BANP-223ENST00000538234 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SUMF1Q8NBK3 GOLGA2P9-203ENST00000600260 2033 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SUMF1Q8NBK3 KCNJ2-202ENST00000535240 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SUMF1Q8NBK3 HMBS-209ENST00000537841 1559 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SUMF1Q8NBK3 KLHDC3-203ENST00000332245 1494 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SUMF1Q8NBK3 TONSL-203ENST00000613741 1713 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28 ms