Protein–RNA interactions for Protein: Q8N3P4

VPS8, Vacuolar protein sorting-associated protein 8 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 1,428 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VPS8Q8N3P4 TEX48-201ENST00000436752 708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
VPS8Q8N3P4 AL512638.1-201ENST00000457493 794 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
VPS8Q8N3P4 CD300LG-205ENST00000586233 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
VPS8Q8N3P4 LINC02084-201ENST00000606069 1096 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
VPS8Q8N3P4 TEX48-202ENST00000612244 662 ntTSL 3 BASIC25.27■■□□□ 1.64
VPS8Q8N3P4 SFT2D2-204ENST00000630869 1073 ntTSL 4 BASIC25.27■■□□□ 1.64
VPS8Q8N3P4 C14orf93-202ENST00000341470 2221 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
VPS8Q8N3P4 SSPN-201ENST00000242729 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
VPS8Q8N3P4 DOK4-201ENST00000340099 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
VPS8Q8N3P4 ELFN2-208ENST00000430883 1970 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.64
VPS8Q8N3P4 C10orf10-201ENST00000298295 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
VPS8Q8N3P4 PYCR3-201ENST00000220966 2678 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
VPS8Q8N3P4 IDH3G-204ENST00000427365 1526 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
VPS8Q8N3P4 LTA-214ENST00000454783 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
VPS8Q8N3P4 ASAH1-254ENST00000637636 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
VPS8Q8N3P4 HGNC:18790-211ENST00000621129 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
VPS8Q8N3P4 KCNQ2-207ENST00000370224 3004 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
VPS8Q8N3P4 SLC22A16-202ENST00000368919 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
VPS8Q8N3P4 CLN3-201ENST00000333496 1608 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
VPS8Q8N3P4 NPM2-201ENST00000289820 1100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
VPS8Q8N3P4 NPM2-202ENST00000381530 925 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
VPS8Q8N3P4 SNCA-205ENST00000394991 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
VPS8Q8N3P4 OARD1-208ENST00000469104 704 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
VPS8Q8N3P4 AC009065.5-201ENST00000565937 596 ntTSL 3 BASIC25.26■■□□□ 1.63
VPS8Q8N3P4 AL391069.4-201ENST00000609583 481 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
VPS8Q8N3P4 MIR6069-201ENST00000620069 79 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
VPS8Q8N3P4 OARD1-216ENST00000628419 1188 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
VPS8Q8N3P4 AC105277.1-203ENST00000635492 1293 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
VPS8Q8N3P4 AC084018.2-201ENST00000613093 2607 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
VPS8Q8N3P4 BORCS8-MEF2B-203ENST00000514819 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
VPS8Q8N3P4 ELN-221ENST00000445912 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
VPS8Q8N3P4 TTC29-202ENST00000398886 1729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
VPS8Q8N3P4 PTGES3-202ENST00000414274 1547 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
VPS8Q8N3P4 RHOT1-201ENST00000333942 3133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
VPS8Q8N3P4 CDH24-204ENST00000487137 3438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
VPS8Q8N3P4 PLK2-215ENST00000617412 2792 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
VPS8Q8N3P4 HEYL-201ENST00000372852 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
VPS8Q8N3P4 TOM1-201ENST00000382034 1300 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
VPS8Q8N3P4 PROSER2-201ENST00000277570 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
VPS8Q8N3P4 MYLK3-202ENST00000536476 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
VPS8Q8N3P4 CBSL-201ENST00000398168 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
VPS8Q8N3P4 H1FOO-201ENST00000324382 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
VPS8Q8N3P4 KRTAP6-3-201ENST00000391624 636 ntAPPRIS P1 BASIC25.25■■□□□ 1.63
VPS8Q8N3P4 TCTN1-202ENST00000397655 1879 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
VPS8Q8N3P4 AC008443.3-201ENST00000412295 549 ntTSL 4 BASIC25.25■■□□□ 1.63
VPS8Q8N3P4 APH1A-204ENST00000414276 1718 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
VPS8Q8N3P4 AC136604.1-201ENST00000418535 575 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
VPS8Q8N3P4 AP1M1-202ENST00000429941 1578 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
VPS8Q8N3P4 LEPROTL1-202ENST00000442880 908 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
VPS8Q8N3P4 AL356441.1-201ENST00000452618 492 ntTSL 3 BASIC25.25■■□□□ 1.63
VPS8Q8N3P4 FAU-205ENST00000527548 538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
VPS8Q8N3P4 EHF-205ENST00000527935 557 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
VPS8Q8N3P4 TMEM258-204ENST00000537328 575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
VPS8Q8N3P4 ZNF586-205ENST00000598885 578 ntTSL 4 BASIC25.25■■□□□ 1.63
VPS8Q8N3P4 PLCL1-201ENST00000428675 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
VPS8Q8N3P4 TRMT1-203ENST00000437766 2263 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
VPS8Q8N3P4 RAD51D-218ENST00000590016 1528 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
VPS8Q8N3P4 PARVB-210ENST00000619710 1530 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
VPS8Q8N3P4 AIRN-201ENST00000601203 4374 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
VPS8Q8N3P4 CCDC90B-203ENST00000525503 1919 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
VPS8Q8N3P4 NUP58-201ENST00000381718 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
VPS8Q8N3P4 CARD10-202ENST00000403299 4113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
VPS8Q8N3P4 CMKLR1-206ENST00000552995 1890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
VPS8Q8N3P4 FAM69C-201ENST00000343998 3671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
VPS8Q8N3P4 WT1-209ENST00000530998 2421 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
VPS8Q8N3P4 FKBP8-201ENST00000222308 1710 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
VPS8Q8N3P4 ASAH1-223ENST00000636171 2283 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
VPS8Q8N3P4 TBC1D2-202ENST00000375063 2100 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
VPS8Q8N3P4 CASR-204ENST00000638421 5088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
VPS8Q8N3P4 NR2C1-203ENST00000393101 1822 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
VPS8Q8N3P4 FXYD1-202ENST00000455515 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
VPS8Q8N3P4 TERF1P3-201ENST00000505638 1227 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
VPS8Q8N3P4 AC008406.2-201ENST00000507058 532 ntTSL 3 BASIC25.24■■□□□ 1.63
VPS8Q8N3P4 SPSB2-204ENST00000523102 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
VPS8Q8N3P4 SPSB2-205ENST00000524270 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
VPS8Q8N3P4 AC135586.1-201ENST00000539323 574 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
VPS8Q8N3P4 RHBDL2-203ENST00000540558 697 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
VPS8Q8N3P4 FOLR3-204ENST00000611028 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
VPS8Q8N3P4 HSPA1A-201ENST00000375651 2483 ntAPPRIS P1 BASIC25.24■■□□□ 1.63
VPS8Q8N3P4 LIMS2-208ENST00000410011 2335 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
VPS8Q8N3P4 GPR89B-201ENST00000314163 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
VPS8Q8N3P4 ABCA1-203ENST00000423487 1540 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
VPS8Q8N3P4 IL18BP-204ENST00000393703 1788 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC25.24■■□□□ 1.63
VPS8Q8N3P4 CRLF2-203ENST00000400841 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
VPS8Q8N3P4 GRN-214ENST00000589265 1632 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
VPS8Q8N3P4 PCDHB19P-201ENST00000570871 2371 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
VPS8Q8N3P4 GPAT3-208ENST00000611707 2633 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
VPS8Q8N3P4 TRIM11-201ENST00000284551 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
VPS8Q8N3P4 INTS14-209ENST00000567744 2419 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
VPS8Q8N3P4 RHOC-201ENST00000285735 2199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
VPS8Q8N3P4 SLC4A5-203ENST00000377632 3123 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
VPS8Q8N3P4 PIP5K1C-201ENST00000335312 5080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
VPS8Q8N3P4 AC012414.7-201ENST00000621235 1507 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
VPS8Q8N3P4 COL15A1-205ENST00000610452 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
VPS8Q8N3P4 MRPL13-201ENST00000306185 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
VPS8Q8N3P4 LCE3E-201ENST00000368789 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
VPS8Q8N3P4 MORN4-202ENST00000370635 419 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
VPS8Q8N3P4 AC093904.3-201ENST00000492300 368 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
VPS8Q8N3P4 AC138761.1-201ENST00000584393 385 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
VPS8Q8N3P4 AC004461.2-201ENST00000629517 803 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
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