Protein–RNA interactions for Protein: Q8IW40

CCDC103, Coiled-coil domain-containing protein 103, humanhuman

Predictions only

Length 242 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC103Q8IW40 ITGAV-201ENST00000261023 7030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CCDC103Q8IW40 YPEL1-201ENST00000339468 4329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CCDC103Q8IW40 FBXL5-201ENST00000341285 3385 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CCDC103Q8IW40 CDR2L-201ENST00000337231 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CCDC103Q8IW40 GFRA2-208ENST00000524240 4921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CCDC103Q8IW40 CLN6-202ENST00000538696 1343 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CCDC103Q8IW40 GLI2-203ENST00000361492 6768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CCDC103Q8IW40 GHRHR-205ENST00000409904 1613 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CCDC103Q8IW40 MED25-202ENST00000538643 1623 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CCDC103Q8IW40 SLC27A5-201ENST00000263093 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CCDC103Q8IW40 NEURL1-201ENST00000369780 4314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CCDC103Q8IW40 PRSS27-201ENST00000302641 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CCDC103Q8IW40 VAMP5-201ENST00000306384 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CCDC103Q8IW40 B3GNT8-201ENST00000321702 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CCDC103Q8IW40 COLEC11-202ENST00000349077 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CCDC103Q8IW40 RUNDC1-201ENST00000361677 3828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CCDC103Q8IW40 CMTM2-202ENST00000379486 904 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CCDC103Q8IW40 ESR1-204ENST00000406599 1251 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CCDC103Q8IW40 POM121L12-201ENST00000408890 1283 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CCDC103Q8IW40 LINC00982-205ENST00000420957 435 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
CCDC103Q8IW40 FIGNL1-207ENST00000435566 593 ntTSL 4 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CCDC103Q8IW40 LINC01615-202ENST00000449466 603 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CCDC103Q8IW40 MOK-208ENST00000519058 917 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CCDC103Q8IW40 MSRA-206ENST00000521209 814 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CCDC103Q8IW40 MRPL49-206ENST00000531705 489 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CCDC103Q8IW40 OAZ2-207ENST00000560258 1744 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CCDC103Q8IW40 RNF151-202ENST00000569210 853 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CCDC103Q8IW40 CALM3-211ENST00000598871 561 ntTSL 4 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CCDC103Q8IW40 AL590235.2-202ENST00000602543 594 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CCDC103Q8IW40 AC025062.2-201ENST00000605477 670 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
CCDC103Q8IW40 VPS51-217ENST00000639871 243 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CCDC103Q8IW40 RNASEH2B-202ENST00000422660 4830 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CCDC103Q8IW40 PCDH17-201ENST00000377918 8232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CCDC103Q8IW40 CDKN1A-203ENST00000405375 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CCDC103Q8IW40 NEK2-202ENST00000366999 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CCDC103Q8IW40 HSPB7-204ENST00000411503 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CCDC103Q8IW40 MAGI1-216ENST00000497477 3555 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CCDC103Q8IW40 ZNF324B-201ENST00000336614 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CCDC103Q8IW40 PDP1-201ENST00000297598 4272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CCDC103Q8IW40 PIK3R1-211ENST00000521381 7011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CCDC103Q8IW40 GID4-202ENST00000376345 1391 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CCDC103Q8IW40 GHDC-201ENST00000301671 2650 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CCDC103Q8IW40 SOWAHA-201ENST00000378693 3211 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CCDC103Q8IW40 DIS3-202ENST00000377780 5232 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CCDC103Q8IW40 ABTB1-206ENST00000468137 2065 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CCDC103Q8IW40 EIF2B4-212ENST00000622434 1771 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CCDC103Q8IW40 AC068944.1-201ENST00000514855 1604 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CCDC103Q8IW40 HACE1-201ENST00000262903 4576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CCDC103Q8IW40 ARL8B-201ENST00000256496 3005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CCDC103Q8IW40 SLC34A2-202ENST00000503434 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CCDC103Q8IW40 KCNG3-202ENST00000394973 3656 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CCDC103Q8IW40 MBD1-202ENST00000269471 2980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CCDC103Q8IW40 C10orf111-201ENST00000624760 1714 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CCDC103Q8IW40 FAM53B-202ENST00000337318 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CCDC103Q8IW40 OSBP2-201ENST00000332585 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CCDC103Q8IW40 POLR3D-202ENST00000397802 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CCDC103Q8IW40 ZNHIT1-201ENST00000305105 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CCDC103Q8IW40 DPM3-201ENST00000341298 486 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CCDC103Q8IW40 AL049795.1-201ENST00000373604 642 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CCDC103Q8IW40 FAM3A-205ENST00000393572 1041 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CCDC103Q8IW40 MPG-203ENST00000397817 1039 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CCDC103Q8IW40 RAB17-203ENST00000409576 466 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CCDC103Q8IW40 RPS2P1-201ENST00000434010 821 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
CCDC103Q8IW40 AC016999.1-201ENST00000447880 452 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CCDC103Q8IW40 MCCC2-205ENST00000509358 1214 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CCDC103Q8IW40 AC073648.2-201ENST00000510116 352 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
CCDC103Q8IW40 AC034243.1-201ENST00000520838 587 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CCDC103Q8IW40 AL160237.2-201ENST00000556165 472 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
CCDC103Q8IW40 CARHSP1-205ENST00000562843 843 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CCDC103Q8IW40 TMEM220-203ENST00000578345 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CCDC103Q8IW40 PNMT-203ENST00000581428 677 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CCDC103Q8IW40 AC148477.8-201ENST00000624298 468 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
CCDC103Q8IW40 AL161669.4-201ENST00000634353 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CCDC103Q8IW40 C12orf65-201ENST00000253233 2073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CCDC103Q8IW40 SMTNL2-201ENST00000338859 1919 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CCDC103Q8IW40 CDK1-204ENST00000448257 1948 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CCDC103Q8IW40 HTD2-201ENST00000461393 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CCDC103Q8IW40 RGN-202ENST00000352078 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
CCDC103Q8IW40 VILL-207ENST00000465644 1857 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
CCDC103Q8IW40 ABHD16A-201ENST00000395952 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
CCDC103Q8IW40 CCDC120-203ENST00000536628 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
CCDC103Q8IW40 APH1A-204ENST00000414276 1718 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
CCDC103Q8IW40 MAPT-204ENST00000344290 6816 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
CCDC103Q8IW40 GRM1-201ENST00000282753 6622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CCDC103Q8IW40 ESM1-201ENST00000381403 1326 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CCDC103Q8IW40 CACNG5-202ENST00000533854 1311 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CCDC103Q8IW40 ISCU-205ENST00000535729 1330 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CCDC103Q8IW40 EIF4A1-203ENST00000577269 1319 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CCDC103Q8IW40 HNRNPDL-210ENST00000630827 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CCDC103Q8IW40 C11orf24-201ENST00000304271 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CCDC103Q8IW40 CDSN-202ENST00000376288 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CCDC103Q8IW40 ZNF804B-201ENST00000333190 4659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CCDC103Q8IW40 MGME1-202ENST00000377709 1936 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CCDC103Q8IW40 KIFC3-205ENST00000540079 2781 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CCDC103Q8IW40 SIGLEC10-201ENST00000339313 2256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CCDC103Q8IW40 SLC39A13-201ENST00000354884 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CCDC103Q8IW40 HPCAL1-206ENST00000613496 1547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CCDC103Q8IW40 CTNND2-214ENST00000511377 4336 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CCDC103Q8IW40 DCTN3-201ENST00000259632 808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CCDC103Q8IW40 MCFD2-208ENST00000409973 821 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.7 ms