Protein–RNA interactions for Protein: Q7LBR1

CHMP1B, Charged multivesicular body protein 1b, humanhuman

Predictions only

Length 199 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHMP1BQ7LBR1 TCF3-212ENST00000588136 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CHMP1BQ7LBR1 AFDN-203ENST00000366806 5962 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CHMP1BQ7LBR1 ASB10-202ENST00000377867 1738 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CHMP1BQ7LBR1 SLC27A1-201ENST00000252595 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CHMP1BQ7LBR1 WIZ-207ENST00000599910 4609 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CHMP1BQ7LBR1 AMZ2P1-202ENST00000430983 3425 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CHMP1BQ7LBR1 HFE2-201ENST00000336751 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CHMP1BQ7LBR1 FAM83C-201ENST00000374408 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CHMP1BQ7LBR1 PDZD4-202ENST00000393758 3763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CHMP1BQ7LBR1 UNC119-204ENST00000470125 2050 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CHMP1BQ7LBR1 RRBP1-208ENST00000470422 2070 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CHMP1BQ7LBR1 NUP62-211ENST00000597029 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CHMP1BQ7LBR1 CCDC94-201ENST00000262962 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CHMP1BQ7LBR1 ZFP1-208ENST00000568079 1426 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CHMP1BQ7LBR1 CDK1-204ENST00000448257 1948 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CHMP1BQ7LBR1 MAMLD1-203ENST00000370401 4854 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CHMP1BQ7LBR1 C19orf70-201ENST00000309324 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CHMP1BQ7LBR1 IFNL1-201ENST00000333625 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CHMP1BQ7LBR1 TRA2B-202ENST00000342294 288 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CHMP1BQ7LBR1 AMACR-204ENST00000382085 1195 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CHMP1BQ7LBR1 RPSAP43-201ENST00000402237 625 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
CHMP1BQ7LBR1 DDT-204ENST00000404092 805 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CHMP1BQ7LBR1 AC013270.1-201ENST00000425578 440 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CHMP1BQ7LBR1 AL669831.5-202ENST00000457084 566 ntTSL 4 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CHMP1BQ7LBR1 USP30-AS1-201ENST00000478808 656 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CHMP1BQ7LBR1 AC112482.1-201ENST00000492080 688 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
CHMP1BQ7LBR1 UBXN1-210ENST00000529640 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CHMP1BQ7LBR1 STX10-207ENST00000589083 1241 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CHMP1BQ7LBR1 AL121832.1-201ENST00000615180 677 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CHMP1BQ7LBR1 AC139530.3-201ENST00000620344 690 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
CHMP1BQ7LBR1 C20orf181-201ENST00000623918 480 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
CHMP1BQ7LBR1 AC244517.11-201ENST00000624192 573 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CHMP1BQ7LBR1 AP001350.2-201ENST00000625104 1094 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
CHMP1BQ7LBR1 PGLYRP1-201ENST00000008938 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CHMP1BQ7LBR1 RBM47-202ENST00000381793 4816 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CHMP1BQ7LBR1 TDRKH-202ENST00000368823 2751 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CHMP1BQ7LBR1 ADAMTS14-201ENST00000373207 5260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CHMP1BQ7LBR1 ADAMTS14-202ENST00000373208 5269 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CHMP1BQ7LBR1 KCNJ8-201ENST00000240662 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CHMP1BQ7LBR1 URAHP-203ENST00000517889 1381 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CHMP1BQ7LBR1 NRG1-216ENST00000523079 2359 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CHMP1BQ7LBR1 ARHGEF25-208ENST00000616622 2103 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CHMP1BQ7LBR1 CAMKK2-203ENST00000347034 5218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CHMP1BQ7LBR1 RHBDF1-201ENST00000262316 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CHMP1BQ7LBR1 B3GNT4-206ENST00000546192 2749 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CHMP1BQ7LBR1 AC005052.1-201ENST00000625181 2492 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
CHMP1BQ7LBR1 GABRB2-202ENST00000353437 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CHMP1BQ7LBR1 PCDHA9-202ENST00000532602 6293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CHMP1BQ7LBR1 FOS-208ENST00000555686 1496 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CHMP1BQ7LBR1 MCM4-201ENST00000262105 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CHMP1BQ7LBR1 USP43-201ENST00000285199 4169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CHMP1BQ7LBR1 RPP14-202ENST00000445193 7985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CHMP1BQ7LBR1 C20orf166-AS1-201ENST00000412495 2302 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CHMP1BQ7LBR1 TCAF1-205ENST00000479870 5733 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CHMP1BQ7LBR1 PICALM-219ENST00000532317 3474 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CHMP1BQ7LBR1 TOM1-204ENST00000411850 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CHMP1BQ7LBR1 RPAP3-203ENST00000432584 2133 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CHMP1BQ7LBR1 ARL13B-203ENST00000394222 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CHMP1BQ7LBR1 SLC6A2-209ENST00000568943 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CHMP1BQ7LBR1 KIF25-202ENST00000354419 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CHMP1BQ7LBR1 SERPINH1-201ENST00000358171 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CHMP1BQ7LBR1 SCP2-204ENST00000407246 2239 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CHMP1BQ7LBR1 ACSM2A-213ENST00000575690 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CHMP1BQ7LBR1 BAG5-202ENST00000337322 1960 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CHMP1BQ7LBR1 SEMA3G-201ENST00000231721 4899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CHMP1BQ7LBR1 LAT-203ENST00000395456 1616 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CHMP1BQ7LBR1 PIGBOS1-201ENST00000436697 866 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CHMP1BQ7LBR1 CYB561D1-208ENST00000528785 1271 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CHMP1BQ7LBR1 AL031432.2-201ENST00000566714 459 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
CHMP1BQ7LBR1 AC104758.1-202ENST00000568184 602 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CHMP1BQ7LBR1 AC013565.3-202ENST00000570120 460 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CHMP1BQ7LBR1 AL928711.1-201ENST00000570165 459 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
CHMP1BQ7LBR1 AC010776.2-201ENST00000588946 1081 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CHMP1BQ7LBR1 ZEB1-AS1-206ENST00000606250 573 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CHMP1BQ7LBR1 ZNF445-205ENST00000617032 1291 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CHMP1BQ7LBR1 GNAO1-202ENST00000262494 5767 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CHMP1BQ7LBR1 DNM2-202ENST00000359692 3588 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CHMP1BQ7LBR1 LILRA6-201ENST00000245621 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CHMP1BQ7LBR1 SLC12A5-209ENST00000616201 2955 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CHMP1BQ7LBR1 PDZRN3-201ENST00000263666 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CHMP1BQ7LBR1 UNC5D-203ENST00000416672 3532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CHMP1BQ7LBR1 ASPH-211ENST00000518068 2744 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CHMP1BQ7LBR1 CYP51A1P2-201ENST00000419457 1499 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
CHMP1BQ7LBR1 ADCY2-201ENST00000338316 6575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CHMP1BQ7LBR1 ATP11B-201ENST00000323116 7325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CHMP1BQ7LBR1 DNM2-203ENST00000389253 3581 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CHMP1BQ7LBR1 EVA1C-202ENST00000382699 1668 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CHMP1BQ7LBR1 AMOTL2-211ENST00000513145 2653 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CHMP1BQ7LBR1 AL365277.1-202ENST00000331856 2241 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CHMP1BQ7LBR1 ULBP2-201ENST00000367351 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CHMP1BQ7LBR1 KIF1A-201ENST00000320389 8832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CHMP1BQ7LBR1 CTSO-201ENST00000433477 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CHMP1BQ7LBR1 ARHGAP33-201ENST00000007510 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CHMP1BQ7LBR1 LRRC71-201ENST00000337428 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CHMP1BQ7LBR1 DGAT1-206ENST00000528718 3711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CHMP1BQ7LBR1 CCDC189-204ENST00000541260 1531 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CHMP1BQ7LBR1 COQ6-220ENST00000629426 1538 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CHMP1BQ7LBR1 ANKRD24-206ENST00000600132 4026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CHMP1BQ7LBR1 SLX1A-SULT1A3-202ENST00000565342 2195 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CHMP1BQ7LBR1 PFN2-201ENST00000239940 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 65.5 ms