Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZSB3

LINC00299, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00299, humanhuman

Predictions only

Length 139 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00299Q6ZSB3 ADAMTS14-202ENST00000373208 5269 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.34□□□□□ -0.11
LINC00299Q6ZSB3 SIRT6-202ENST00000337491 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
LINC00299Q6ZSB3 ACY1-206ENST00000476351 1409 ntTSL 3 BASIC14.34□□□□□ -0.11
LINC00299Q6ZSB3 CTBP1-209ENST00000510568 4250 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
LINC00299Q6ZSB3 SIK1-201ENST00000270162 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
LINC00299Q6ZSB3 CU639417.2-201ENST00000613488 4705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
LINC00299Q6ZSB3 ARPC4-TTLL3-201ENST00000397256 2466 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
LINC00299Q6ZSB3 PPIL6-207ENST00000521072 4128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
LINC00299Q6ZSB3 SBF1-201ENST00000348911 6045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
LINC00299Q6ZSB3 EVA1C-202ENST00000382699 1668 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
LINC00299Q6ZSB3 SFI1-209ENST00000443011 3579 ntTSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
LINC00299Q6ZSB3 PSMD6-210ENST00000492933 1495 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
LINC00299Q6ZSB3 SEMA3G-201ENST00000231721 4899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
LINC00299Q6ZSB3 BUD23-201ENST00000265758 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
LINC00299Q6ZSB3 TNNT3-206ENST00000381579 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
LINC00299Q6ZSB3 CSNK1A1P1-201ENST00000430593 2147 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
LINC00299Q6ZSB3 AC007663.1-201ENST00000438948 1240 ntBASIC14.34□□□□□ -0.11
LINC00299Q6ZSB3 DYNC1LI2-202ENST00000440564 1145 ntTSL 2 BASIC14.34□□□□□ -0.11
LINC00299Q6ZSB3 AL445645.1-201ENST00000451318 1019 ntTSL 2 BASIC14.34□□□□□ -0.11
LINC00299Q6ZSB3 DBNL-214ENST00000456905 1241 ntTSL 2 BASIC14.34□□□□□ -0.11
LINC00299Q6ZSB3 PAQR4-205ENST00000576565 842 ntTSL 2 BASIC14.34□□□□□ -0.11
LINC00299Q6ZSB3 RN7SL471P-201ENST00000580476 299 ntBASIC14.34□□□□□ -0.11
LINC00299Q6ZSB3 ATG9B-212ENST00000639579 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
LINC00299Q6ZSB3 HIST3H2BB-201ENST00000620438 2364 ntAPPRIS P1 BASIC14.34□□□□□ -0.11
LINC00299Q6ZSB3 BTBD11-204ENST00000420571 3478 ntTSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
LINC00299Q6ZSB3 REEP3-201ENST00000373758 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
LINC00299Q6ZSB3 TJP3-207ENST00000589378 3068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.34□□□□□ -0.11
LINC00299Q6ZSB3 CDH20-202ENST00000536675 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
LINC00299Q6ZSB3 HOXC12-201ENST00000243103 3335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
LINC00299Q6ZSB3 TAF11-201ENST00000361288 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
LINC00299Q6ZSB3 LARP4-210ENST00000522085 1577 ntTSL 2 BASIC14.34□□□□□ -0.11
LINC00299Q6ZSB3 SERP1-201ENST00000239944 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
LINC00299Q6ZSB3 ZC3HAV1-204ENST00000471652 3182 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
LINC00299Q6ZSB3 RPL15-201ENST00000307839 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
LINC00299Q6ZSB3 RPTOR-203ENST00000570891 2286 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
LINC00299Q6ZSB3 CYP1A1-210ENST00000617691 2521 ntTSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
LINC00299Q6ZSB3 ZBTB17-201ENST00000375733 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
LINC00299Q6ZSB3 DNAJC28-201ENST00000314399 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.11
LINC00299Q6ZSB3 KDM8-202ENST00000441782 1612 ntTSL 2 BASIC14.33□□□□□ -0.11
LINC00299Q6ZSB3 ZNF514-201ENST00000295208 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.11
LINC00299Q6ZSB3 ABCG1-201ENST00000343687 3037 ntTSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.11
LINC00299Q6ZSB3 AFF4-201ENST00000265343 9552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.11
LINC00299Q6ZSB3 PRR34-201ENST00000396008 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.11
LINC00299Q6ZSB3 SPOCK2-202ENST00000373109 5445 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.11
LINC00299Q6ZSB3 TMEM201-202ENST00000340381 3776 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.11
LINC00299Q6ZSB3 IRF5-215ENST00000619830 1652 ntTSL 2 BASIC14.33□□□□□ -0.11
LINC00299Q6ZSB3 FAM114A2-215ENST00000522858 3379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.11
LINC00299Q6ZSB3 GDPD2-204ENST00000536730 2171 ntTSL 2 BASIC14.33□□□□□ -0.11
LINC00299Q6ZSB3 MED16-203ENST00000325464 2922 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.12
LINC00299Q6ZSB3 SEMA3B-212ENST00000616701 2958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
LINC00299Q6ZSB3 ANKRD50-202ENST00000515641 4212 ntTSL 2 BASIC14.33□□□□□ -0.12
LINC00299Q6ZSB3 OBSL1-202ENST00000373873 3297 ntTSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
LINC00299Q6ZSB3 FER1L4-213ENST00000621044 2778 ntTSL 2 BASIC14.33□□□□□ -0.12
LINC00299Q6ZSB3 DUSP23-201ENST00000368107 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
LINC00299Q6ZSB3 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
LINC00299Q6ZSB3 RGCC-201ENST00000379359 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
LINC00299Q6ZSB3 PQLC3-202ENST00000402361 696 ntTSL 2 BASIC14.33□□□□□ -0.12
LINC00299Q6ZSB3 DMRT2-206ENST00000412350 1244 ntTSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
LINC00299Q6ZSB3 AC093151.3-201ENST00000425554 623 ntTSL 2 BASIC14.33□□□□□ -0.12
LINC00299Q6ZSB3 ANKRD34C-AS1-201ENST00000557790 594 ntTSL 3 BASIC14.33□□□□□ -0.12
LINC00299Q6ZSB3 AC026471.3-201ENST00000565137 578 ntTSL 2 BASIC14.33□□□□□ -0.12
LINC00299Q6ZSB3 MALAT1-215ENST00000619449 794 ntTSL 3 BASIC14.33□□□□□ -0.12
LINC00299Q6ZSB3 AL590326.2-201ENST00000625139 305 ntBASIC14.33□□□□□ -0.12
LINC00299Q6ZSB3 AC116562.4-202ENST00000641738 218 ntBASIC14.33□□□□□ -0.12
LINC00299Q6ZSB3 SLC30A5-202ENST00000396591 4360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
LINC00299Q6ZSB3 TRMT1-217ENST00000592062 2579 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.12
LINC00299Q6ZSB3 NFKB2-203ENST00000369966 3101 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
LINC00299Q6ZSB3 TOMM40-207ENST00000592434 3415 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.33□□□□□ -0.12
LINC00299Q6ZSB3 SYNM-201ENST00000328642 3960 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
LINC00299Q6ZSB3 GJA8-201ENST00000369235 1302 ntAPPRIS P1 BASIC14.33□□□□□ -0.12
LINC00299Q6ZSB3 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC14.33□□□□□ -0.12
LINC00299Q6ZSB3 CCNF-202ENST00000397066 4283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
LINC00299Q6ZSB3 AC007686.3-201ENST00000619017 3487 ntBASIC14.33□□□□□ -0.12
LINC00299Q6ZSB3 C8orf31-201ENST00000395172 1875 ntTSL 2 BASIC14.33□□□□□ -0.12
LINC00299Q6ZSB3 EIF4G3-212ENST00000602326 6196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
LINC00299Q6ZSB3 MGAT1-202ENST00000333055 8863 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.33□□□□□ -0.12
LINC00299Q6ZSB3 PRSS16-203ENST00000421826 1949 ntTSL 2 BASIC14.33□□□□□ -0.12
LINC00299Q6ZSB3 UBTF-205ENST00000526094 2459 ntTSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.12
LINC00299Q6ZSB3 C11orf16-202ENST00000525780 1685 ntTSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
LINC00299Q6ZSB3 TMEM41B-204ENST00000528080 3968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
LINC00299Q6ZSB3 CEP131-208ENST00000575907 3444 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
LINC00299Q6ZSB3 NFATC4-207ENST00000553469 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
LINC00299Q6ZSB3 KCTD1-203ENST00000417602 1705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.32□□□□□ -0.12
LINC00299Q6ZSB3 SSFA2-205ENST00000431877 5150 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
LINC00299Q6ZSB3 SERPINA4-203ENST00000557004 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
LINC00299Q6ZSB3 RASAL2-AS1-202ENST00000421505 2329 ntTSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
LINC00299Q6ZSB3 SLC38A9-202ENST00000396865 2927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
LINC00299Q6ZSB3 TMEM145-201ENST00000301204 1768 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.32□□□□□ -0.12
LINC00299Q6ZSB3 PGBD5-201ENST00000391860 10961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
LINC00299Q6ZSB3 PWWP2A-201ENST00000307063 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
LINC00299Q6ZSB3 IRAK1-203ENST00000369980 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
LINC00299Q6ZSB3 TSPAN12-201ENST00000222747 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
LINC00299Q6ZSB3 MFSD11-217ENST00000590514 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
LINC00299Q6ZSB3 GPD1L-201ENST00000282541 4060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
LINC00299Q6ZSB3 C22orf34-201ENST00000343999 2816 ntTSL 2 BASIC14.32□□□□□ -0.12
LINC00299Q6ZSB3 CAMK2B-203ENST00000347193 1577 ntTSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
LINC00299Q6ZSB3 LINC00311-201ENST00000366314 1566 ntTSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
LINC00299Q6ZSB3 WASHC2C-208ENST00000537517 4417 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.32□□□□□ -0.12
LINC00299Q6ZSB3 POU4F3-201ENST00000230732 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
LINC00299Q6ZSB3 UPK3B-201ENST00000257632 1296 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC14.32□□□□□ -0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.8 ms