Protein–RNA interactions for Protein: Q6UXN2

TREML4, Trem-like transcript 4 protein, humanhuman

Predictions only

Length 200 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TREML4Q6UXN2 IKBIP-201ENST00000299157 3189 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
TREML4Q6UXN2 INTS11-247ENST00000540437 2629 ntTSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
TREML4Q6UXN2 AC105917.1-201ENST00000506637 2539 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
TREML4Q6UXN2 NFATC4-202ENST00000413692 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
TREML4Q6UXN2 CLU-215ENST00000523500 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
TREML4Q6UXN2 KCNJ12-201ENST00000331718 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
TREML4Q6UXN2 BICD2-201ENST00000356884 6427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
TREML4Q6UXN2 RAI2-203ENST00000415486 2037 ntTSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
TREML4Q6UXN2 ZNF397-204ENST00000585800 2046 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
TREML4Q6UXN2 PTGES3-201ENST00000262033 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
TREML4Q6UXN2 EVC2-202ENST00000344408 4390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
TREML4Q6UXN2 SNX9-201ENST00000392185 4198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
TREML4Q6UXN2 HTR1A-201ENST00000323865 1778 ntAPPRIS P1 BASIC13.5□□□□□ -0.25
TREML4Q6UXN2 GFAP-233ENST00000639277 1783 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
TREML4Q6UXN2 UNC13A-205ENST00000551649 6052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
TREML4Q6UXN2 NOMO1-207ENST00000610363 3765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
TREML4Q6UXN2 LMBR1-202ENST00000359422 4727 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
TREML4Q6UXN2 HCG18-233ENST00000412685 2552 ntTSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
TREML4Q6UXN2 TMED7-TICAM2-201ENST00000282382 3491 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
TREML4Q6UXN2 NFASC-205ENST00000403080 2462 ntTSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
TREML4Q6UXN2 KCNK9-203ENST00000520439 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
TREML4Q6UXN2 CALU-205ENST00000535011 3210 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
TREML4Q6UXN2 SUFU-202ENST00000369902 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
TREML4Q6UXN2 ANTXRL-205ENST00000620264 2206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
TREML4Q6UXN2 ITGB1BP1-204ENST00000360635 4859 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
TREML4Q6UXN2 HNRNPH3-202ENST00000354695 1332 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
TREML4Q6UXN2 FAM49B-223ENST00000522746 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
TREML4Q6UXN2 RAP2C-201ENST00000342983 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
TREML4Q6UXN2 PSMG3-201ENST00000252329 1007 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.5□□□□□ -0.25
TREML4Q6UXN2 YIF1B-203ENST00000339413 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
TREML4Q6UXN2 STK39-201ENST00000355999 3820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
TREML4Q6UXN2 ZHX1-C8orf76-201ENST00000357082 1257 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
TREML4Q6UXN2 FAM24B-201ENST00000368896 704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
TREML4Q6UXN2 PSMA7-201ENST00000370858 925 ntTSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
TREML4Q6UXN2 LINC01264-201ENST00000431395 500 ntTSL 3 BASIC13.5□□□□□ -0.25
TREML4Q6UXN2 FTCD-AS1-201ENST00000446649 500 ntTSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
TREML4Q6UXN2 INGX-202ENST00000489074 768 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
TREML4Q6UXN2 RPS15P9-201ENST00000494093 319 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
TREML4Q6UXN2 AC113382.2-201ENST00000506911 646 ntTSL 3 BASIC13.5□□□□□ -0.25
TREML4Q6UXN2 KLRC1-204ENST00000536188 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
TREML4Q6UXN2 AC106782.2-201ENST00000563252 992 ntTSL 3 BASIC13.5□□□□□ -0.25
TREML4Q6UXN2 OAZ1-202ENST00000582888 969 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
TREML4Q6UXN2 AC008992.1-201ENST00000591132 446 ntTSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
TREML4Q6UXN2 AC010654.1-201ENST00000615722 808 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
TREML4Q6UXN2 CITED2-204ENST00000618718 901 ntTSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
TREML4Q6UXN2 AL513210.1-201ENST00000629608 234 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
TREML4Q6UXN2 NR2C1-201ENST00000330677 2014 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
TREML4Q6UXN2 CHRNB2-201ENST00000368476 5867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
TREML4Q6UXN2 RELT-201ENST00000064780 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
TREML4Q6UXN2 ADM-201ENST00000278175 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
TREML4Q6UXN2 TPM1-205ENST00000357980 1800 ntTSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
TREML4Q6UXN2 CRY1-201ENST00000008527 3267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
TREML4Q6UXN2 PLAGL1-211ENST00000625622 3216 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
TREML4Q6UXN2 HMBOX1-212ENST00000558662 1765 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
TREML4Q6UXN2 STK24-203ENST00000397517 4578 ntTSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
TREML4Q6UXN2 MUTYH-201ENST00000354383 1744 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
TREML4Q6UXN2 CHEK1-202ENST00000427383 1670 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
TREML4Q6UXN2 H1F0-201ENST00000340857 2344 ntAPPRIS P1 BASIC13.5□□□□□ -0.25
TREML4Q6UXN2 NDUFA6-AS1-203ENST00000439129 2950 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
TREML4Q6UXN2 BBS5-201ENST00000295240 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
TREML4Q6UXN2 AC009336.1-201ENST00000608941 1553 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
TREML4Q6UXN2 NUS1-201ENST00000368494 4676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
TREML4Q6UXN2 AC008969.1-201ENST00000550135 6438 ntTSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
TREML4Q6UXN2 GMPPA-202ENST00000341142 1524 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
TREML4Q6UXN2 B3GNT4-206ENST00000546192 2749 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
TREML4Q6UXN2 NDUFS2-202ENST00000392179 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
TREML4Q6UXN2 LSS-205ENST00000457828 4390 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
TREML4Q6UXN2 CTSB-201ENST00000345125 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
TREML4Q6UXN2 KLHDC8B-201ENST00000332780 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
TREML4Q6UXN2 SLC4A3-201ENST00000273063 4246 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
TREML4Q6UXN2 SEC14L4-201ENST00000255858 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
TREML4Q6UXN2 TAP2-202ENST00000374899 2497 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
TREML4Q6UXN2 AP001122.1-202ENST00000501648 1916 ntTSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
TREML4Q6UXN2 RAB31-207ENST00000578921 4055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
TREML4Q6UXN2 CHD1L-203ENST00000369259 2358 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
TREML4Q6UXN2 ZMIZ1-201ENST00000334512 7546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
TREML4Q6UXN2 RPS12-201ENST00000230050 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
TREML4Q6UXN2 KLK8-202ENST00000320838 456 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
TREML4Q6UXN2 RPA2-202ENST00000373909 1162 ntTSL 3 BASIC13.49□□□□□ -0.25
TREML4Q6UXN2 PRUNE2-202ENST00000376713 1069 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
TREML4Q6UXN2 AC004461.1-201ENST00000412461 403 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
TREML4Q6UXN2 LINC01143-201ENST00000449073 625 ntTSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
TREML4Q6UXN2 AC074386.1-202ENST00000463561 864 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
TREML4Q6UXN2 LAMTOR4-206ENST00000473459 720 ntTSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
TREML4Q6UXN2 AC093214.1-201ENST00000511688 1107 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
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TREML4Q6UXN2 GLIPR1L1-204ENST00000548623 484 ntTSL 3 BASIC13.49□□□□□ -0.25
TREML4Q6UXN2 AL157871.1-202ENST00000556458 478 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
TREML4Q6UXN2 KRT19P2-202ENST00000557173 1012 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
TREML4Q6UXN2 AC005225.4-201ENST00000557330 545 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
TREML4Q6UXN2 AC087641.1-201ENST00000557561 1021 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
TREML4Q6UXN2 AL137246.1-201ENST00000607072 977 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
TREML4Q6UXN2 ZEB1-AS1-209ENST00000607455 559 ntTSL 4 BASIC13.49□□□□□ -0.25
TREML4Q6UXN2 LINC00628-201ENST00000628516 1289 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
TREML4Q6UXN2 MYO1D-201ENST00000318217 5563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
TREML4Q6UXN2 ABCF3-203ENST00000429586 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
TREML4Q6UXN2 CORO2B-201ENST00000261861 3569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
TREML4Q6UXN2 CORO2B-204ENST00000566799 3566 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
TREML4Q6UXN2 IQCE-217ENST00000623361 6775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
TREML4Q6UXN2 AL365203.3-201ENST00000609742 2057 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
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