Protein–RNA interactions for Protein: Q6PEW1

ZCCHC12, Zinc finger CCHC domain-containing protein 12, humanhuman

Predictions only

Length 402 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZCCHC12Q6PEW1 BMP7-201ENST00000395863 4013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
ZCCHC12Q6PEW1 LAT2-204ENST00000398475 2453 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
ZCCHC12Q6PEW1 GCFC2-202ENST00000409857 2516 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
ZCCHC12Q6PEW1 APH1A-204ENST00000414276 1718 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
ZCCHC12Q6PEW1 AC053503.2-201ENST00000420563 1598 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
ZCCHC12Q6PEW1 PPAN-P2RY11-202ENST00000428358 2661 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
ZCCHC12Q6PEW1 AC093724.1-201ENST00000448659 1027 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
ZCCHC12Q6PEW1 NECAP2-208ENST00000504551 768 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
ZCCHC12Q6PEW1 KRTAP5-9-201ENST00000528743 1136 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
ZCCHC12Q6PEW1 TMEM258-204ENST00000537328 575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
ZCCHC12Q6PEW1 QPRT-203ENST00000562473 579 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
ZCCHC12Q6PEW1 AP002472.1-201ENST00000577490 586 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
ZCCHC12Q6PEW1 POLI-208ENST00000579534 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
ZCCHC12Q6PEW1 AC040963.1-202ENST00000589729 644 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
ZCCHC12Q6PEW1 LYPD5-203ENST00000594013 1519 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
ZCCHC12Q6PEW1 AC008878.2-201ENST00000601870 942 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.3■□□□□ 0.04
ZCCHC12Q6PEW1 BTN1A1-202ENST00000613186 2266 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
ZCCHC12Q6PEW1 PHOSPHO2-207ENST00000616524 1253 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
ZCCHC12Q6PEW1 HYAL3-207ENST00000621157 1696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
ZCCHC12Q6PEW1 CCNY-202ENST00000339497 4630 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
ZCCHC12Q6PEW1 ST3GAL2-201ENST00000342907 4450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
ZCCHC12Q6PEW1 SLC30A5-202ENST00000396591 4360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
ZCCHC12Q6PEW1 SREBF1-201ENST00000261646 4178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
ZCCHC12Q6PEW1 TSHZ1-204ENST00000580243 3582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
ZCCHC12Q6PEW1 KLF10-201ENST00000285407 3097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
ZCCHC12Q6PEW1 PARP9-204ENST00000471785 3040 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
ZCCHC12Q6PEW1 PGAP3-201ENST00000300658 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
ZCCHC12Q6PEW1 U73166.1-201ENST00000439898 2625 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
ZCCHC12Q6PEW1 AP000487.1-202ENST00000500185 2602 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
ZCCHC12Q6PEW1 CYP2U1-201ENST00000332884 4944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ZCCHC12Q6PEW1 GFRA2-208ENST00000524240 4921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ZCCHC12Q6PEW1 ILVBL-201ENST00000263383 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ZCCHC12Q6PEW1 TNXB-209ENST00000613214 6842 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
ZCCHC12Q6PEW1 SARAF-201ENST00000256255 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ZCCHC12Q6PEW1 SH3BP5-206ENST00000426925 2190 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
ZCCHC12Q6PEW1 SFRP2-201ENST00000274063 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ZCCHC12Q6PEW1 ELFN2-208ENST00000430883 1970 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
ZCCHC12Q6PEW1 WDR74-205ENST00000525752 1724 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
ZCCHC12Q6PEW1 ZNF84-208ENST00000539354 3237 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ZCCHC12Q6PEW1 GNRHR2-201ENST00000312753 1599 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ZCCHC12Q6PEW1 LINC01118-203ENST00000479311 1588 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ZCCHC12Q6PEW1 ANKHD1-202ENST00000297183 7606 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
ZCCHC12Q6PEW1 PRKN-202ENST00000366892 1505 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
ZCCHC12Q6PEW1 ATP4B-201ENST00000335288 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ZCCHC12Q6PEW1 FBP1-201ENST00000375326 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ZCCHC12Q6PEW1 CLTA-201ENST00000242285 1152 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ZCCHC12Q6PEW1 NNAT-202ENST00000346199 1209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ZCCHC12Q6PEW1 TCEAL2-202ENST00000372780 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ZCCHC12Q6PEW1 CTRC-202ENST00000375949 898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ZCCHC12Q6PEW1 MECP2-203ENST00000407218 1174 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
ZCCHC12Q6PEW1 DANCR-201ENST00000411630 904 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ZCCHC12Q6PEW1 AL807752.7-201ENST00000471521 989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
ZCCHC12Q6PEW1 AC087276.3-201ENST00000526220 787 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
ZCCHC12Q6PEW1 MARVELD3-206ENST00000567566 850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ZCCHC12Q6PEW1 COX5A-206ENST00000568783 571 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
ZCCHC12Q6PEW1 HNRNPDL-206ENST00000602300 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ZCCHC12Q6PEW1 NDRG1-202ENST00000414097 3755 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
ZCCHC12Q6PEW1 AL513477.1-201ENST00000602865 2407 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
ZCCHC12Q6PEW1 WDR20-211ENST00000556807 2382 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ZCCHC12Q6PEW1 ITPKB-201ENST00000272117 5822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ZCCHC12Q6PEW1 EIF4G1-202ENST00000346169 5516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ZCCHC12Q6PEW1 TCP10L2-202ENST00000366832 2185 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ZCCHC12Q6PEW1 TPD52L2-209ENST00000611972 2197 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
ZCCHC12Q6PEW1 NFATC4-211ENST00000554344 2955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ZCCHC12Q6PEW1 DVL1-202ENST00000378891 2926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ZCCHC12Q6PEW1 STXBP1-216ENST00000636962 2918 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
ZCCHC12Q6PEW1 AP005329.2-201ENST00000580139 1771 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
ZCCHC12Q6PEW1 ZHX1-201ENST00000297857 5200 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
ZCCHC12Q6PEW1 SPG11-215ENST00000559193 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ZCCHC12Q6PEW1 GABRD-218ENST00000640949 1684 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
ZCCHC12Q6PEW1 SGPP1-201ENST00000247225 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ZCCHC12Q6PEW1 MIB2-217ENST00000504599 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
ZCCHC12Q6PEW1 NSUN5-202ENST00000310326 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
ZCCHC12Q6PEW1 HMBS-209ENST00000537841 1559 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
ZCCHC12Q6PEW1 DIS3-202ENST00000377780 5232 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ZCCHC12Q6PEW1 CLDN14-201ENST00000342108 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ZCCHC12Q6PEW1 CAMKV-204ENST00000466940 1475 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
ZCCHC12Q6PEW1 CHD4-210ENST00000544040 6514 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
ZCCHC12Q6PEW1 NDUFS2-202ENST00000392179 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ZCCHC12Q6PEW1 SIRT6-214ENST00000601488 1361 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
ZCCHC12Q6PEW1 PRLHR-201ENST00000239032 5446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ZCCHC12Q6PEW1 DDOST-206ENST00000602624 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ZCCHC12Q6PEW1 APBB1-202ENST00000311051 2619 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ZCCHC12Q6PEW1 PPP2R2B-206ENST00000453001 2569 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ZCCHC12Q6PEW1 SLITRK2-202ENST00000370490 7672 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
ZCCHC12Q6PEW1 TBC1D7-202ENST00000356436 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ZCCHC12Q6PEW1 ZNF593-202ENST00000374266 675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ZCCHC12Q6PEW1 ALKBH6-202ENST00000378875 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ZCCHC12Q6PEW1 TBC1D7-204ENST00000379300 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ZCCHC12Q6PEW1 OTOS-202ENST00000391989 645 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
ZCCHC12Q6PEW1 ZGLP1-201ENST00000403352 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
ZCCHC12Q6PEW1 SNHG11-205ENST00000421599 1046 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
ZCCHC12Q6PEW1 SMIM27-204ENST00000453396 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
ZCCHC12Q6PEW1 SLC30A5-203ENST00000502979 681 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ZCCHC12Q6PEW1 AC126696.3-201ENST00000563993 575 ntTSL 4 BASIC15.28■□□□□ 0.04
ZCCHC12Q6PEW1 AC040169.1-201ENST00000565382 521 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
ZCCHC12Q6PEW1 AC217774.2-201ENST00000580347 560 ntTSL 4 BASIC15.28■□□□□ 0.04
ZCCHC12Q6PEW1 BCL2L12-206ENST00000598306 510 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
ZCCHC12Q6PEW1 IRF1-211ENST00000613424 821 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ZCCHC12Q6PEW1 TXNDC11-202ENST00000356957 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.4 ms