Protein–RNA interactions for Protein: Q6IPR1

ETFRF1, Electron transfer flavoprotein regulatory factor 1, humanhuman

Predictions only

Length 90 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ETFRF1Q6IPR1 ARAP1-AS1-201ENST00000542022 388 ntTSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
ETFRF1Q6IPR1 PNN-202ENST00000553331 656 ntTSL 3 BASIC13.2□□□□□ -0.3
ETFRF1Q6IPR1 AC139887.3-201ENST00000568585 713 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
ETFRF1Q6IPR1 AC091167.2-201ENST00000579581 588 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
ETFRF1Q6IPR1 AC091076.1-201ENST00000610741 619 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
ETFRF1Q6IPR1 Metazoa_SRP.33-201ENST00000613468 285 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
ETFRF1Q6IPR1 AP001350.2-201ENST00000625104 1094 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
ETFRF1Q6IPR1 SRRD-201ENST00000215917 4020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
ETFRF1Q6IPR1 WDR18-204ENST00000587001 1465 ntTSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
ETFRF1Q6IPR1 KCNN2-201ENST00000264773 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
ETFRF1Q6IPR1 FLVCR1-AS1-201ENST00000356684 2525 ntTSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
ETFRF1Q6IPR1 FGFR1OP2-201ENST00000229395 2924 ntTSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
ETFRF1Q6IPR1 CBFB-201ENST00000290858 3136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
ETFRF1Q6IPR1 SCP2-213ENST00000528311 1896 ntTSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
ETFRF1Q6IPR1 EPHX2-201ENST00000380476 2064 ntTSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
ETFRF1Q6IPR1 AC092364.2-201ENST00000596710 2692 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
ETFRF1Q6IPR1 KRT8P39-201ENST00000396270 1433 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
ETFRF1Q6IPR1 TSPAN4-205ENST00000397406 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
ETFRF1Q6IPR1 EIF2B4-206ENST00000451130 1633 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
ETFRF1Q6IPR1 CD1E-213ENST00000444681 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
ETFRF1Q6IPR1 HSD3B7-201ENST00000262520 2200 ntTSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
ETFRF1Q6IPR1 TBC1D2-201ENST00000342112 3046 ntTSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
ETFRF1Q6IPR1 RASD2-201ENST00000216127 3412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
ETFRF1Q6IPR1 BCAR1-204ENST00000418647 3387 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
ETFRF1Q6IPR1 TBL2-205ENST00000432538 1573 ntTSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
ETFRF1Q6IPR1 LILRA6-201ENST00000245621 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
ETFRF1Q6IPR1 AC005329.3-201ENST00000626781 1366 ntTSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
ETFRF1Q6IPR1 COL23A1-202ENST00000407622 2329 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
ETFRF1Q6IPR1 VPS54-201ENST00000272322 3463 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
ETFRF1Q6IPR1 KRAS-202ENST00000311936 5765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
ETFRF1Q6IPR1 AL161772.1-201ENST00000610494 4412 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
ETFRF1Q6IPR1 FAM214B-202ENST00000378557 3070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
ETFRF1Q6IPR1 PPP2R5D-202ENST00000394110 2894 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
ETFRF1Q6IPR1 AC245052.4-201ENST00000452097 4158 ntTSL 2 BASIC13.19□□□□□ -0.3
ETFRF1Q6IPR1 SEPT8-204ENST00000378699 2289 ntTSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
ETFRF1Q6IPR1 LSS-202ENST00000397728 4936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
ETFRF1Q6IPR1 ONECUT1-201ENST00000305901 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
ETFRF1Q6IPR1 NSMF-205ENST00000371474 3571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
ETFRF1Q6IPR1 MED26-201ENST00000263390 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
ETFRF1Q6IPR1 PTHLH-202ENST00000395868 1674 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
ETFRF1Q6IPR1 PDE4DIP-230ENST00000530472 1690 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
ETFRF1Q6IPR1 AC068888.1-203ENST00000546566 1650 ntTSL 2 BASIC13.19□□□□□ -0.3
ETFRF1Q6IPR1 HDHD2-201ENST00000300605 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
ETFRF1Q6IPR1 GPR153-201ENST00000377893 4082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
ETFRF1Q6IPR1 ATP6V0E2-212ENST00000611515 2565 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
ETFRF1Q6IPR1 LMNA-201ENST00000347559 3137 ntTSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
ETFRF1Q6IPR1 NTRK3-202ENST00000355254 2938 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
ETFRF1Q6IPR1 PLEKHG3-202ENST00000394691 4397 ntTSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
ETFRF1Q6IPR1 AL512785.2-202ENST00000367932 830 ntTSL 4 BASIC13.19□□□□□ -0.3
ETFRF1Q6IPR1 ZFAND4-203ENST00000374366 3821 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
ETFRF1Q6IPR1 AL645608.6-201ENST00000418300 402 ntTSL 3 BASIC13.19□□□□□ -0.3
ETFRF1Q6IPR1 SNHG11-204ENST00000420006 720 ntTSL 3 BASIC13.19□□□□□ -0.3
ETFRF1Q6IPR1 RPL13P5-203ENST00000421824 845 ntTSL 3 BASIC13.19□□□□□ -0.3
ETFRF1Q6IPR1 SNHG11-206ENST00000432153 1181 ntTSL 3 BASIC13.19□□□□□ -0.3
ETFRF1Q6IPR1 POU5F1P6-201ENST00000466990 990 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
ETFRF1Q6IPR1 LAMTOR4-205ENST00000468582 621 ntTSL 2 BASIC13.19□□□□□ -0.3
ETFRF1Q6IPR1 AKTIP-212ENST00000570004 1162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
ETFRF1Q6IPR1 AC020934.1-201ENST00000588469 739 ntTSL 3 BASIC13.19□□□□□ -0.3
ETFRF1Q6IPR1 NPAP1P7-201ENST00000613027 823 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
ETFRF1Q6IPR1 CD6-201ENST00000313421 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
ETFRF1Q6IPR1 TRIM11-201ENST00000284551 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
ETFRF1Q6IPR1 WWTR1-204ENST00000467467 1603 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
ETFRF1Q6IPR1 ABTB1-201ENST00000232744 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
ETFRF1Q6IPR1 NRP1-203ENST00000374821 1988 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
ETFRF1Q6IPR1 NR3C1-203ENST00000394464 6795 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
ETFRF1Q6IPR1 SIGLEC10-205ENST00000439889 2126 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
ETFRF1Q6IPR1 UBQLN1-201ENST00000257468 2299 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
ETFRF1Q6IPR1 FUT2-201ENST00000391876 1593 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.19□□□□□ -0.3
ETFRF1Q6IPR1 SHMT2-232ENST00000557487 1918 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
ETFRF1Q6IPR1 CCDC85A-201ENST00000407595 3982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
ETFRF1Q6IPR1 KCNT1-212ENST00000628528 7057 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.19□□□□□ -0.3
ETFRF1Q6IPR1 MYH11-201ENST00000300036 6029 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
ETFRF1Q6IPR1 MAIP1-202ENST00000392290 1386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
ETFRF1Q6IPR1 KRT85-202ENST00000544265 1387 ntTSL 2 BASIC13.19□□□□□ -0.3
ETFRF1Q6IPR1 AC097376.2-205ENST00000610159 5334 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
ETFRF1Q6IPR1 SLC17A7-204ENST00000600601 2237 ntTSL 2 BASIC13.19□□□□□ -0.3
ETFRF1Q6IPR1 EGFR-206ENST00000454757 5464 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
ETFRF1Q6IPR1 ECE1-204ENST00000415912 5099 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
ETFRF1Q6IPR1 FUT3-202ENST00000458379 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
ETFRF1Q6IPR1 MN1-201ENST00000302326 7556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
ETFRF1Q6IPR1 UNC5D-203ENST00000416672 3532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
ETFRF1Q6IPR1 ASB7-202ENST00000343276 1694 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
ETFRF1Q6IPR1 AHCYL2-202ENST00000446544 5026 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
ETFRF1Q6IPR1 DTX3-202ENST00000548198 3199 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.18□□□□□ -0.3
ETFRF1Q6IPR1 ATP2A3-204ENST00000397035 4182 ntTSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
ETFRF1Q6IPR1 HECW1-203ENST00000453890 5169 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.18□□□□□ -0.3
ETFRF1Q6IPR1 RBM14-201ENST00000310137 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
ETFRF1Q6IPR1 GALNT6-201ENST00000356317 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
ETFRF1Q6IPR1 ADAM6-201ENST00000606026 1843 ntTSL 2 BASIC13.18□□□□□ -0.3
ETFRF1Q6IPR1 SARDH-202ENST00000371867 1326 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
ETFRF1Q6IPR1 PKLR-202ENST00000392414 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
ETFRF1Q6IPR1 DHRS1-201ENST00000288111 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
ETFRF1Q6IPR1 FSTL3-206ENST00000592947 2144 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
ETFRF1Q6IPR1 MRFAP1-205ENST00000617365 2112 ntTSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
ETFRF1Q6IPR1 SLC43A2-201ENST00000301335 8136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
ETFRF1Q6IPR1 GRM7-203ENST00000389336 2901 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
ETFRF1Q6IPR1 KIF1C-201ENST00000320785 7919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
ETFRF1Q6IPR1 CYP11A1-201ENST00000268053 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
ETFRF1Q6IPR1 TEX19-201ENST00000333437 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
ETFRF1Q6IPR1 RPRD1A-209ENST00000590898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.5 ms